靶向泛素化降解PLK1和BRD4蛋白的蛋白降解靶向嵌合體設(shè)計、合成以及生物活性研究
【學(xué)位單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:R914;R96
【部分圖文】:
TX2-121-1 TX2-135-2 TX2-120-1圖 2 疏水標(biāo)記(HyT)技術(shù)開發(fā)的化合物結(jié)構(gòu)1.2.3 蛋白降解靶向嵌合體技術(shù)PROTACs 是由靶蛋白配體、連接體、E3 連接酶配體三部分組成的一個化物分子。連接體將這兩個配體連接起來,其中靶蛋白配體與靶蛋白產(chǎn)生相互作用E3 連接酶配體可與 E3 連接酶相結(jié)合。因此,PROTAC 在與其 E3 連接酶和靶白結(jié)合時形成三元復(fù)合物。通過連接 E3 連接酶,PROTAC 將 POI 置于空間有的位置以促進(jìn)底物泛素化,從而選擇性地降解靶蛋白(圖 2)[43]。這種方法與小分子抑制劑相比,有很多優(yōu)點(diǎn)。第一,在理論上來說,小分抑制劑與靶蛋白結(jié)合后理應(yīng)抑制其活性,例如,恩扎魯胺可與雄激素受體結(jié)合
(ErBb2PPPI3K),以在生長因子刺激時誘導(dǎo) PI3K 的條件性敲低 9(圖 3)。類似于早期的 PROTAC,該降解分子由 VHL 肽結(jié)合片段和多聚-D- ARG 序列組成,以增強(qiáng)細(xì)胞通透性。然而,磷酸 PROTAC 不是用一個小分子配體來募集靶蛋白,而是使用“條件性”蛋白質(zhì)配體,即僅在向細(xì)胞添加生長因子時才結(jié)合其同源伴侶的蛋白質(zhì)配體。這是通過結(jié)合來自受體酪氨酸激酶(例如,ErBb3)的肽序列來實現(xiàn)的,所述受體酪氨酸激酶含有磷酸化位點(diǎn),其用作下游信號傳導(dǎo)組分(例如,PI3K)的結(jié)合位點(diǎn)。在概念驗證實驗中,生長因子神經(jīng)調(diào)節(jié)蛋白誘導(dǎo)磷酸PROTAC 的 ErBb3 和 ErBb3 磷酸化位點(diǎn),從而導(dǎo)致 PI3K 的募集、泛素化和蛋白酶體介導(dǎo)的降解。此外,在小鼠異種移植模型中,ErBb2PPPI3K 的治療導(dǎo)致腫瘤大小減少 40%[54],首次證明了 PROTAC 的體內(nèi)活性。盡管在降解靶蛋白方面效果顯著,也有較好的體內(nèi)抗腫瘤活性,但其分子量高、細(xì)胞通透性差、潛在的代謝不穩(wěn)定性等特性使得 PROTAC 不太可能成為良好的候選藥物。
1.2.3.2.3 VHL 蛋白作為 E3 泛素連接酶第一個廣泛應(yīng)用于小分子選擇性靶蛋白降解的E3連接酶是Cli-RING泛素連接酶(CRL)組分 VHL(圖 5)。通過基于經(jīng)典片段的方法開發(fā)基于羥脯氨酸的HIF1 衍生的 VHL 結(jié)合肽的小分子模擬物,實現(xiàn)了這一突破。該蛋白為 E3 泛素連接酶復(fù)合體Elongin B/C-CUL2-VHL的組成部分。VHL可以使缺氧誘導(dǎo)因子-1α(HIF1α)泛素化導(dǎo)致 HIF1α 的降解。2012 年 Buckley 等人發(fā)表了第一個抑制VHL-HIF1α 相互作用的小分子化合物,該 VHL 配體可與 VHL 中 HIF1α 識別位點(diǎn)偶聯(lián),結(jié)果顯示該 PROTAC 在 100 nm(DC50)下可誘導(dǎo)其靶蛋白 50%的降解。重要的是,這種 PROTAC 被證明在體內(nèi)是有活性的;在使用 PROTAC 治療之后,小鼠心臟,腎臟和 MDA-MB-231 異種移植腫瘤的 ERRα 水平分別降低了約 44%、44%和 39%[47]。因此該設(shè)計被廣泛應(yīng)用于 PROTAC 的設(shè)計中,研究發(fā)現(xiàn)此類PROTAC 可同時降解絲氨酸/蘇氨酸激酶 RIPK2。
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本文編號:2878065
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