海洋生物基因組數(shù)據庫中新型降鈣素序列挖掘、優(yōu)化與功能驗證
發(fā)布時間:2020-12-08 07:37
背景:我國已逐步進入老年社會,骨質疏松癥是老年人尤其是中老年婦女的常見病,盡管降鈣素是臨床上用來治療骨質疏松癥的有效藥物,但其也存在著諸如成本高、半衰期較短、免疫原性高等問題。因此,發(fā)掘更高效的降鈣素具有重要臨床意義。目的:通過對多種新型海洋來源的降鈣素基因序列進行序列對比、進化樹分析、活性檢測,發(fā)現(xiàn)高效新型降鈣素,為臨床應用奠定基礎;建立高通量挖掘驗證活性多肽的技術平臺,為發(fā)現(xiàn)新功能多肽提供技術儲備。內容:1、利用生物信息學方法從海洋生物基因組數(shù)據庫中挖掘不同物種的降鈣素序列。2、分析各降鈣素序列差異、化學合成、質譜分析及活性驗證。3、總結活性規(guī)律,并在此基礎上設計優(yōu)化新的降鈣素序列及功能驗證。4、通過對降鈣素的研究初步建立海洋生物活性多肽的篩選平臺。方法:1、利用鮭魚降鈣素序列進行BLAST獲得其他物種的降鈣素序列,由兩部分組成:NCBI非冗余蛋白庫和華大基因水生生物基因組數(shù)據庫。2、通過clustal omega軟件進行序列比對,結合物種選取具有代表性的序列使用MEGA7軟件構建進化樹。3、根據進化樹結果,結合物種分類選擇包括鮭魚降鈣素在內的13條序列進行化學合成。4、按照中國藥...
【文章來源】:中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學上海市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
鮭魚降鈣素的空間3D結構
MEGA7 軟件構建的降鈣素進化樹。進化樹使用鄰接法和最大別構建,然后生成一個共識樹。進化距離使用 JTT 矩陣法計算代表遺傳距離Evolutionary relationships of calcitonins. Phylogenetic analysis waA7 software using the Neighbor-Joining method and Maximum Lhe evolutionary distances were computed using the JTT matrix-basular evolutionary tree of the calcitonin peptides was also drawn by are. The numbers at internal nodes and branches indicate the percentstrap values (1000 replicates). Scale length represented genetic dis樹結果顯示,根據距離關系和物種,我們可以將這 27 條序列分二組和第五組中各選擇 3 條序列,從第一組和第三組中各選擇中選擇 1 條序列,再加上人降鈣素和鮭魚降鈣素共計 13 條用于性檢測。序列及物種信息見表 5。
Gga的MS/HPLC結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]海洋動物活性多肽和多糖的研究進展[J]. 孟春英,王茂劍,張健,王共明,侯志剛. 齊魯漁業(yè). 2015 (05)
[2]對骨質疏松性慢性疼痛:如何認知和預防?[J]. 位新維,陳志信. 中國組織工程研究. 2014(38)
[3]鮭魚降鈣素柔性脂質體大鼠鼻腔給藥的降血鈣效應[J]. 陳銘,鄧秋,李馨儒,劉艷. 藥學學報. 2007(06)
[4]蛋白多肽類藥物的藥代動力學研究概況[J]. 樊蓉,張純,高申. 藥學實踐雜志. 2006(03)
[5]利用煙草表達一種新型鮭魚降鈣素的初步研究[J]. 王曉曄,普穎穎,宋杰,王國豐,錢虹妹,林娟,趙凌俠,唐克軒. 揚州大學學報. 2006(01)
[6]聚乙二醇修飾蛋白質類藥物的研究現(xiàn)狀及展望[J]. 徐靜. 國外醫(yī)學(預防、診斷、治療用生物制品分冊). 2004(02)
[7]鮭魚降鈣素重組桿狀病毒載體的構建及表達[J]. 劉穎,王正坤,梁東春,郭剛,張鏡宇. 現(xiàn)代口腔醫(yī)學雜志. 2003(01)
[8]美國國家衛(wèi)生院有關骨質疏松癥的預防、診斷和治療的共識文件[J]. 秦嶺,張戈. 中國骨質疏松雜志. 2002(02)
[9]人修飾型降鈣素和鼠酰胺化酶基因在昆蟲細胞中的偶聯(lián)表達[J]. 楊冠珍,陳珍珍,崔大敷,李伯良,吳祥甫. 生物工程學報. 2002(01)
[10]鮭魚降鈣素在鏈霉菌中的分泌表達[J]. 洪斌,李元,李嗣英,姜蓉. 遺傳學報. 1998(04)
本文編號:2904723
【文章來源】:中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學上海市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
鮭魚降鈣素的空間3D結構
MEGA7 軟件構建的降鈣素進化樹。進化樹使用鄰接法和最大別構建,然后生成一個共識樹。進化距離使用 JTT 矩陣法計算代表遺傳距離Evolutionary relationships of calcitonins. Phylogenetic analysis waA7 software using the Neighbor-Joining method and Maximum Lhe evolutionary distances were computed using the JTT matrix-basular evolutionary tree of the calcitonin peptides was also drawn by are. The numbers at internal nodes and branches indicate the percentstrap values (1000 replicates). Scale length represented genetic dis樹結果顯示,根據距離關系和物種,我們可以將這 27 條序列分二組和第五組中各選擇 3 條序列,從第一組和第三組中各選擇中選擇 1 條序列,再加上人降鈣素和鮭魚降鈣素共計 13 條用于性檢測。序列及物種信息見表 5。
Gga的MS/HPLC結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]海洋動物活性多肽和多糖的研究進展[J]. 孟春英,王茂劍,張健,王共明,侯志剛. 齊魯漁業(yè). 2015 (05)
[2]對骨質疏松性慢性疼痛:如何認知和預防?[J]. 位新維,陳志信. 中國組織工程研究. 2014(38)
[3]鮭魚降鈣素柔性脂質體大鼠鼻腔給藥的降血鈣效應[J]. 陳銘,鄧秋,李馨儒,劉艷. 藥學學報. 2007(06)
[4]蛋白多肽類藥物的藥代動力學研究概況[J]. 樊蓉,張純,高申. 藥學實踐雜志. 2006(03)
[5]利用煙草表達一種新型鮭魚降鈣素的初步研究[J]. 王曉曄,普穎穎,宋杰,王國豐,錢虹妹,林娟,趙凌俠,唐克軒. 揚州大學學報. 2006(01)
[6]聚乙二醇修飾蛋白質類藥物的研究現(xiàn)狀及展望[J]. 徐靜. 國外醫(yī)學(預防、診斷、治療用生物制品分冊). 2004(02)
[7]鮭魚降鈣素重組桿狀病毒載體的構建及表達[J]. 劉穎,王正坤,梁東春,郭剛,張鏡宇. 現(xiàn)代口腔醫(yī)學雜志. 2003(01)
[8]美國國家衛(wèi)生院有關骨質疏松癥的預防、診斷和治療的共識文件[J]. 秦嶺,張戈. 中國骨質疏松雜志. 2002(02)
[9]人修飾型降鈣素和鼠酰胺化酶基因在昆蟲細胞中的偶聯(lián)表達[J]. 楊冠珍,陳珍珍,崔大敷,李伯良,吳祥甫. 生物工程學報. 2002(01)
[10]鮭魚降鈣素在鏈霉菌中的分泌表達[J]. 洪斌,李元,李嗣英,姜蓉. 遺傳學報. 1998(04)
本文編號:2904723
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