馬立克氏腫瘤的泛素化組分析及CDK1泛素化的鑒定
發(fā)布時間:2020-12-05 10:29
馬立克氏。∕D)是由血清1型馬立克氏病毒(MDV-1)引起的雞淋巴組織增生性傳染病。雞CD4+T細胞最易被MDV感染轉(zhuǎn)化,可經(jīng)浸潤在外周神經(jīng)和內(nèi)臟器官中形成T淋巴瘤并引起免疫抑制。MDV編碼的基因參與MD腫瘤發(fā)生、MDV的感染與復(fù)制等過程,一些有關(guān)MD腫瘤的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組分析也揭示MDV可通過改變宿主細胞的組學(xué)促進致病。本實驗的前期研究發(fā)現(xiàn)MDV編碼的被膜蛋白UL36具有去泛素化酶活性,并在MD腫瘤細胞中高水平表達,此蛋白在MDV的復(fù)制、致瘤及傳播中發(fā)揮重要作用。由于動物細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)泛素化參與細胞周期、增殖、分化、凋亡和病毒感染等過程,我們推測MDV可能改變雞CD4+T淋巴細胞的泛素化組以促進腫瘤發(fā)生及免疫功能異常。因此,本研究對MD腫瘤細胞與雞正常CD4+T細胞的泛素化組差異進行了分析。本研究應(yīng)用抗泛素化肽段(K-ε-GG)的單克隆抗體分離MD腫瘤細胞系MDCC-MSB1細胞和CD4+T淋巴細胞中的泛素化多肽,然后應(yīng)用質(zhì)譜對多肽進行定量和定性分析,并應(yīng)用生物信息學(xué)分析泛素化基序、結(jié)構(gòu)域以及蛋...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:112 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
純化的雞CD4+T淋巴細胞的純度鑒定Fig.1.1VerificationofthepurifiedchickenCD4+Tlymphocytes
圖 1.3 MS 數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制分析Fig. 1.3 Quality control and validation of MS dataA. 鑒定到的多肽的質(zhì)量誤差分布。B. 不同長度多肽的個數(shù). The mass error distribution of the identified peptides. B. Number of peptidesdifferent lengths.本實驗中,一共鑒定到了 2880 個蛋白質(zhì)和這些蛋白質(zhì)中的 10024 個泛。除去 MDCC-MSB1/T cells(M/T 比值)定量比值中的無效的統(tǒng)計結(jié)有 2350 個蛋白和其中的 7097 個泛素化多肽定量檢測比值具有統(tǒng)計<0.05)。在此基礎(chǔ)上,M/T 比值≥2.0 認為是泛素化顯著上調(diào),而 T/M 比值為是泛素化顯著下調(diào)。每個樣品均進行三次平行重復(fù)實驗,檢測數(shù)據(jù)的果如圖 1.4,x/y 的值接近 1 則表示數(shù)據(jù)有很好的再現(xiàn)性,圖中可知所得展現(xiàn)了良好的重復(fù)性。最終,檢測到有 717 個蛋白質(zhì)及其 1638 個肽段
圖 1.4 使用散點圖對三次重復(fù)實驗的再現(xiàn)性分析Fig. 1.4 Reproducibility analysis of three repeated measures using a scatter diagramA. 橫軸表示 LOG2(M-1 / T-1 比率)的值,縱軸表示 LOG2(M-2 / T-2 比率)的值。 B. 橫軸表示 LOG2(M-2 / T-2 比率)的值,縱軸表示 LOG2(M-3 / T-3比率)的值。C. 橫軸表示 LOG2(M-1 / T-1 比率)值,縱軸表示 LOG2(M-3 / T-3比率)值A(chǔ). The x-axis presents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents theLOG2 (M-2/T-2 ratio) values. B. The x-axis presents the LOG2 (M-2/T-2 ratio)values, and the y-axis presents the LOG2 (M-3/T-3 ratio) values. C. The x-axispresents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents the LOG2(M-3/T-3 ratio) values.1.3.3.2 ‘RD.K..N’基序更容易受 MDV 的泛素化或去泛素化調(diào)節(jié)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]馬立克氏病毒UL36蛋白的表達及其去泛素化酶活性分析[J]. 王夢云,周宏達,韋美甜,呂巖,吳山力,艾永興. 畜牧與獸醫(yī). 2017(05)
本文編號:2899310
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:112 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
純化的雞CD4+T淋巴細胞的純度鑒定Fig.1.1VerificationofthepurifiedchickenCD4+Tlymphocytes
圖 1.3 MS 數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制分析Fig. 1.3 Quality control and validation of MS dataA. 鑒定到的多肽的質(zhì)量誤差分布。B. 不同長度多肽的個數(shù). The mass error distribution of the identified peptides. B. Number of peptidesdifferent lengths.本實驗中,一共鑒定到了 2880 個蛋白質(zhì)和這些蛋白質(zhì)中的 10024 個泛。除去 MDCC-MSB1/T cells(M/T 比值)定量比值中的無效的統(tǒng)計結(jié)有 2350 個蛋白和其中的 7097 個泛素化多肽定量檢測比值具有統(tǒng)計<0.05)。在此基礎(chǔ)上,M/T 比值≥2.0 認為是泛素化顯著上調(diào),而 T/M 比值為是泛素化顯著下調(diào)。每個樣品均進行三次平行重復(fù)實驗,檢測數(shù)據(jù)的果如圖 1.4,x/y 的值接近 1 則表示數(shù)據(jù)有很好的再現(xiàn)性,圖中可知所得展現(xiàn)了良好的重復(fù)性。最終,檢測到有 717 個蛋白質(zhì)及其 1638 個肽段
圖 1.4 使用散點圖對三次重復(fù)實驗的再現(xiàn)性分析Fig. 1.4 Reproducibility analysis of three repeated measures using a scatter diagramA. 橫軸表示 LOG2(M-1 / T-1 比率)的值,縱軸表示 LOG2(M-2 / T-2 比率)的值。 B. 橫軸表示 LOG2(M-2 / T-2 比率)的值,縱軸表示 LOG2(M-3 / T-3比率)的值。C. 橫軸表示 LOG2(M-1 / T-1 比率)值,縱軸表示 LOG2(M-3 / T-3比率)值A(chǔ). The x-axis presents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents theLOG2 (M-2/T-2 ratio) values. B. The x-axis presents the LOG2 (M-2/T-2 ratio)values, and the y-axis presents the LOG2 (M-3/T-3 ratio) values. C. The x-axispresents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents the LOG2(M-3/T-3 ratio) values.1.3.3.2 ‘RD.K..N’基序更容易受 MDV 的泛素化或去泛素化調(diào)節(jié)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]馬立克氏病毒UL36蛋白的表達及其去泛素化酶活性分析[J]. 王夢云,周宏達,韋美甜,呂巖,吳山力,艾永興. 畜牧與獸醫(yī). 2017(05)
本文編號:2899310
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