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家禽屠宰場微生物分布特征及大腸桿菌耐藥性評估與ERIC-PCR分型研究

發(fā)布時間:2020-11-17 15:13
   隨著抗生素的濫用,作為危害嚴重食源性致病菌之一的大腸桿菌,其耐藥性不斷增強,多重耐藥譜逐步變寬。肉雞作為大腸桿菌傳播的主要載體,在屠宰加工過程中容易通過食物鏈傳到人體,探究家禽屠宰場加工生產(chǎn)鏈中大腸桿菌的污染狀況,追蹤大腸桿菌污染的主要環(huán)節(jié)顯得尤為重要。本研究以浙江省某大型家禽屠宰場為采樣點,檢測空氣沉降微生物的污染指標,評估屠宰場不同區(qū)域的微生物污染水平,以分離獲得的大腸桿菌為主要研究對象,檢測毒力基因并評估其耐藥性,通過ERIC-PCR分型探究分離株的親緣關(guān)系。(1)本實驗取屠宰場廠房外部和內(nèi)部空氣沉降微生物,檢測其污染指標,并通過16S rRNA V3-V4的Illumina高通量測序方法分析其菌群結(jié)構(gòu)多樣性。結(jié)果顯示屠宰后八個車間的菌落總數(shù)、腸桿菌科、霉菌和酵母數(shù)量均有所增加,宰殺瀝血間菌落總數(shù)達到最高達到1100 cfu/皿,浸燙脫羽間腸桿菌科數(shù)達到最高1500cfu/皿,宰殺瀝血間霉菌、酵母數(shù)量分別最高達到175 cfu/皿、50cfu/皿。比較屠宰場廠房內(nèi)外部的空氣沉降細菌菌群結(jié)構(gòu),從門的水平上來看,屠宰場廠內(nèi)和廠外優(yōu)勢門相同,均為厚壁菌門(Firmicute)、放線菌門(Actinobacteria)和變形菌門(Proteobacteria)。但從屬的水平上屠宰場廠房外和屠宰場廠內(nèi)優(yōu)勢屬幾乎都不相同,兩者存在不同屬類別的細菌污染。屠宰場廠房內(nèi)空氣中主要優(yōu)勢屬葡萄球菌屬(Staphylococcus),埃希氏菌屬(Escherichia),假單胞菌屬(Pseudomonas),而屠宰場廠房外空氣中主要優(yōu)勢屬是芽孢桿菌屬(Bacillus),(Phycicoccus),考克氏菌屬(Kocuria)。(2)本實驗取屠宰場的存在水體,以及用無菌紗布擦拭各區(qū)域的地面和器械表面采集微生物進行培養(yǎng)后,通過16S rRNA V3-V4的Illumina高通量測序方法分析其菌群結(jié)構(gòu)多樣性,并用PCR對細菌的9大類24種耐藥基因進行檢測。結(jié)果表明,屠宰場不同區(qū)域水體、地面和屠宰器械表面微生物均以變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)和放線菌門(Actinobacteria)為主,其相對豐度分別為45.18%~87.74%、0.09%~33.46%、3.34%~28.09%;優(yōu)勢菌屬為不動桿菌屬(Acinetobacter)、鏈球菌屬(Streptococcus)、嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)、水棲菌屬(Enhydrobacter)、皮生球菌屬(Dermacoccus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、黃桿菌屬(Flavobacterium)、乳球菌屬(Tetragenococcus),金黃桿菌屬(Chryseobacterium)和弓形桿菌屬(Arcobacter),約占總類群40%。各樣品中共檢測到21種耐藥基因,其中sulⅠ、sulⅡ、qnrS、blaTEM和aadA1的檢出率為100%,floR、tetA和ereA的檢出率為88.9%以上。(3)本實驗從收集的屠宰場空氣沉降微生物、存在水體、地面、器械表面和冷鮮雞共240個樣品中分離大腸桿菌,檢測大腸桿菌的毒力基因并評估其耐藥性。結(jié)果顯示在預冷間的預冷水、外界的干凈屠宰用水、包裝間和冷藏間的空氣中未檢出大腸桿菌,但在其他區(qū)域均有檢測出大腸桿菌。大腸桿菌耐藥基因檢測結(jié)果表明,來源于冷鮮雞表面ESBL型大腸桿菌檢出率最高,對單環(huán)β內(nèi)酰胺類的氨芐西林(62.0%)、磺胺類的復方新諾明(55.4%)耐藥最明顯,多重耐藥菌株多達33株(35.9%),最多耐7種類型的抗生素;除了青霉素類基因(mecC)和多粘菌素類基因(mcr-1)未檢出,耐藥基因pmrA(92.4%)、blaTEM(78.3%)和qnrS(53.3%)檢出率較高。此外,毒力基因檢測結(jié)果顯示腸毒素性大腸桿菌(ETEC)毒力基因est檢出率最高,高達31.5%。空氣來源的大腸桿菌毒力基因檢出率種類最多,檢測出stx、est、elt和aggR這四種毒力基因。(4)本實驗對分離獲得的92株大腸桿菌進行ERIC-PCR分型分析,結(jié)果顯示在以相似系數(shù)0.80的水平上,不同來源的家禽屠宰場大腸桿菌分離株可以分型為11種菌型(A~H),其中E型有32株,為優(yōu)勢菌型,來源包括雞肛門拭子、掛禽間冷鮮雞、凈膛間掛鉤紗布和預冷間空氣等不同環(huán)節(jié)的樣品,由此可見同一屠宰場的空氣、水體、器械、地面和冷鮮雞相互之間存在著大腸桿菌的交叉污染。
【學位單位】:中國計量大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S852.6
【部分圖文】:

路線圖,研究技術(shù),路線,技術(shù)路線


研究技術(shù)路線

流程圖,屠宰加工,流程


掛禽間宰殺瀝血間浸燙脫羽間凈膛間2. 1 材料與方法2.1.1 實驗儀器和試劑主要儀器如下表 2-1。表 2. 1 主要儀器Table 2.1 Main equipment儀器名稱 生產(chǎn)廠家恒溫培養(yǎng)箱、烘箱 上海一恒科學儀器有限公司天平 北京賽多利斯天平有限公司主要試劑:平板計數(shù)瓊脂(PCA)培養(yǎng)基、孟加拉紅培養(yǎng)基、麥康凱培養(yǎng)基均由杭州微生物試劑有限公司提供。2.1.2 樣本的采集2.1.2.1 屠宰加工流程

屠宰場,豐度,內(nèi)臟,預冷


16Figure 2.7 The top 10 phylum (A) and genus (B) of each sample in the external air ofslaughterhouse:BH,屠宰前掛禽間;BS,屠宰前宰殺瀝血間;BD,屠宰前浸燙脫羽間;BE,屠宰前;BPr,屠宰前預冷間;BPa,屠宰前包裝間;BRe,屠宰前冷藏間;BV,屠宰前內(nèi)臟間;宰前屠宰場廠房外四周;AH,屠宰后掛禽間;AS,屠宰后宰殺瀝血間;AD,屠宰后浸間;AE,屠宰后凈膛間;APr,屠宰后預冷間;APa,屠宰后包裝間;ARe,屠宰后冷,屠宰后內(nèi)臟間;AO,屠宰后屠宰場廠房外四周。te:BH,hanging district before slaughter;BS,slitting and blood draining district before slaug,scalding and dehairng district before slaughter;BE,eviscerating district before slaughter;-cooling district before slaughter;BPa,Packing district before slaughter;BRe,Refrigerated dfore slaughter;BV,Visceral district before slaughter;BO,around the factory before slau,hanging district after slaughter;AS,slitting and blood draining district after slaughter;lding and dehairng district after slaughte;AE,eviscerating district after slaughter;APr,Pre-ctrict after slaughter;APa,Packing district after slaughter;ARe,Refrigerated district after slaug,Visceral district after slaughter;AO,outside the factory after slaughter結(jié)構(gòu)
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