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岷縣黑裘皮羊微衛(wèi)星多樣性與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-11-10 14:01
   岷縣黑裘皮羊是甘肅省地方裘皮用綿羊品種,研究其遺傳多樣性與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)性可以為種質(zhì)資源的保護(hù)和利用提供理論依據(jù)。本研究在分析體重與體尺性狀通徑關(guān)系的基礎(chǔ)上,利用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù),選取聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(FAO)推薦的24對(duì)微衛(wèi)星引物,以144只岷縣黑裘皮羊?yàn)檠芯繉?duì)象,分析了其群體遺傳多樣性,同時(shí)利用SPSS 21.0軟件的一般線性模型對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記與性狀的表型數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明:1.岷縣黑裘皮羊12、24和36月齡各生產(chǎn)性狀變異系數(shù)分別為8.44%~19.89%、4.24%~8.52%和4.31%~10.62%。2.體重與體尺性狀的相關(guān)性分析得出:除12月齡胸寬與體重?zé)o顯著相關(guān)外(P0.05),其它各體尺性狀與體重均呈正相關(guān)(P0.05)。3.逐步多元回歸分析得出:12月齡岷縣黑裘皮羊體尺與體重的最優(yōu)回歸方程:Y=0.409 X_5+0.246 X_1-19.850,R~2=0.546;24月齡:Y=0.485 X_5+0.929 X_3-19.569,R~2=0.719;36月齡:Y=1.086 X_3+0.327 X_2+0.251 X_1-10.207,R~2=0.930。4.體重與體尺性狀的通徑分析得出:12和24月齡時(shí),胸圍對(duì)體重的直接作用最大,體高和胸寬通過(guò)胸圍對(duì)體重的間接作用大于自身的直接作用;36月齡時(shí),胸寬對(duì)體重的直接作用最大,體高通過(guò)胸寬對(duì)體重的間接作用最大。5.微衛(wèi)星遺傳多樣性分析得出:24個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)共檢測(cè)到231個(gè)等位基因,平均等位基因數(shù)為9.63個(gè);群體等位基因頻率為0.0104~0.7396,等位基因片段大小為97~285bp;平均有效等位基因數(shù)為3.6540個(gè),平均觀測(cè)雜合度為0.4839,平均期望雜合度為0.6956,平均遺傳雜合度為0.6883,平均多態(tài)信息含量為0.6527。位點(diǎn)MAF70等位基因數(shù)(Na=15)、有效等位基因數(shù)(Ne=8.2433)、期望雜合度(He=0.8879)和多態(tài)信息含量(PIC=0.8673)最高,位點(diǎn)OarFCB128觀測(cè)雜合度(Ho=0.8125)最高;位點(diǎn)OarAE129等位基因數(shù)(Na=4)最少,位點(diǎn)SRCRSP9期望雜合度(He=0.4357)、多態(tài)信息含量(PIC=0.4070)最低,位點(diǎn)OarFCB304觀測(cè)雜合度(Ho=0.2500)最低。所選位點(diǎn)中19個(gè)處于Hardy-Weinberg不平衡狀態(tài)。說(shuō)明岷縣黑裘皮羊具有豐富的遺傳多樣性,環(huán)境適應(yīng)能力較強(qiáng),同時(shí)這24個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)可用于岷縣黑裘皮羊生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析。6.對(duì)24個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析表明:21個(gè)位點(diǎn)分別與12、24和36月齡岷縣黑裘皮羊體重、體高、體長(zhǎng)、胸寬、胸深和胸圍存在不同程度的關(guān)聯(lián)性(P0.5)。其中,12月齡時(shí),與體重相關(guān)的位點(diǎn)有7個(gè):DYMS1、SRCRSP9、ILSTS11、OarFCB304、OarJMP58、MAF65、MAF70;與體高相關(guān)的位點(diǎn)有7個(gè):OarFCB128、OarVH72、ILSTS28、MAF214、MAF33、OarJMP29、MAF70;與體長(zhǎng)相關(guān)的位點(diǎn)有3個(gè):OarFCB193、MAF65、MAF70;與胸寬相關(guān)的位點(diǎn)有1個(gè):ILSTS28;與胸深相關(guān)的位點(diǎn)有4個(gè):MAF214、OarFCB304、OarJMP29、MAF209;與胸圍相關(guān)的位點(diǎn)有5個(gè):ILSTS11、OarFCB193、OarJMP58、MAF65、MAF70。24月齡時(shí),與體重相關(guān)的位點(diǎn)有7個(gè):SRCRSP9、ILSTS11、MAF33、OarFCB193、OarJMP29、OarJMP58、MAF209;與體高相關(guān)的位點(diǎn)有4個(gè):MCM140、OarFCB193、OarJMP58、MAF70;與體長(zhǎng)相關(guān)的位點(diǎn)有4個(gè):DYMS1、MAF214、MAF65、MAF209;與胸寬相關(guān)的位點(diǎn)有1個(gè):ILSTS5;與胸深相關(guān)的位點(diǎn)有4個(gè):BM8125、ILSTS5、ILSTS11、OarFCB304;與胸圍相關(guān)的位點(diǎn)有7個(gè):BM8125、SRCRSP9、MCM140、OarFCB193、OarJMP29、OarJMP58、MAF209。36月齡時(shí),與體重相關(guān)的位點(diǎn)有5個(gè):OarHH47、OarVH72、OarCB226、OarFCB193、OarJMP29;與體高相關(guān)的位點(diǎn)有5個(gè):OarHH47、DYMS1、SRCRSP9、MCM140、OarFCB193;與體長(zhǎng)相關(guān)的位點(diǎn)有4個(gè):OarAE129、ILSTS5、OarFCB304、MAF65;與胸寬相關(guān)的位點(diǎn)有6個(gè):OarFCB128、OarVH72、BM8125、OarCB226、OarFCB193、OarFCB304;與胸深相關(guān)的位點(diǎn)有4個(gè):OarAE129、OarCB226、MAF33、MAF65;與胸圍相關(guān)的位點(diǎn)有5個(gè):ILSTS5、MCM140、OarFCB193、OarJMP29、MAF65。綜上所述,岷縣黑裘皮羊各體尺性狀對(duì)體重的影響隨月齡的變化而變化;同時(shí),該群體遺傳多樣性豐富,所選位點(diǎn)與生產(chǎn)性狀間關(guān)聯(lián)程度較高,作為國(guó)家級(jí)畜禽遺傳資源,該品種的保護(hù)工作急不可待。
【學(xué)位單位】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S826
【部分圖文】:

示意圖,體尺性狀,通徑分析,體重


甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士學(xué)位論文0.312 和 0.693;36 月齡體高、體長(zhǎng)和胸寬對(duì)體重的直接通徑系數(shù)分別為 0.299、0.312 和0.519。說(shuō)明 12 月齡時(shí),胸圍對(duì)體重的直接作用大于體高;24 月齡時(shí),胸圍對(duì)體重的直接作用大于胸寬;36 月齡時(shí),胸寬對(duì)體重的直接作用最大,體長(zhǎng)次之,體高最小。岷縣黑裘皮羊體尺與體重間的通徑關(guān)系如圖 2-1 所示。36 月齡時(shí),體高與體長(zhǎng)和胸寬間的相關(guān)系數(shù)分別為 0.254 和 0.806,體長(zhǎng)與體重的直接通徑系數(shù)為 0.312,因此,通過(guò)體長(zhǎng)的間接通徑系數(shù)為 0.254 0.312=0.079,通過(guò)胸寬的間接通徑系數(shù)為 0.8060.519=0.418。同理計(jì)算出其它體尺對(duì)體重的通徑系數(shù),結(jié)果見(jiàn)表 2-5。說(shuō)明 12 和 24 月齡時(shí),體高和胸寬通過(guò)胸圍對(duì)體重的間接作用均大于自身的直接作用;36 月齡時(shí),體高通過(guò)胸寬對(duì)體重的間接作用最大。

基因組DNA,檢測(cè)結(jié)果,樣品,基因組


、 :第 、 個(gè)等位基因的頻率;n:等位基因數(shù)。(4)多態(tài)信息含量多態(tài)信息含量(PIC)是表示微衛(wèi)星位點(diǎn)遺傳變異程度的指標(biāo),反映多態(tài)性的高低。 11 1221212ninjiniPIC PiPiPj(公式:3-6)n:等位基因數(shù); 、 :第 、 個(gè)等位基因的頻率。3.2 結(jié)果與分析3.2.1 基因組 DNA 檢測(cè)結(jié)果將提取的基因組 DNA 用 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(圖 3-1),結(jié)果顯示各泳道均有DNA 條帶,且位置基本相同,說(shuō)明所提 DNA 質(zhì)量較好,只是各泳道內(nèi)條帶明暗程度不一,說(shuō)明所提 DNA 濃度不同,為保證 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物濃度的一致,對(duì)基因組 DNA 進(jìn)行了濃度一致性調(diào)整,可用于下一步試驗(yàn)。

基因型,檢測(cè)結(jié)果,群體遺傳多樣性,基因測(cè)序


圖 3-2 3 號(hào)個(gè)體在位點(diǎn) MAF33 的檢測(cè)結(jié)果(基因型為 126/136 bp)Figure 3-2 Detection results of No.3 in loci MCM140(The genetype is 177/181圖 3-3 2 號(hào)個(gè)體在位點(diǎn) OarJMP29 的檢測(cè)結(jié)果(基因型為 136/136 bp)Figure 3-3 Detection results of No.2 in loci OarJMP29(The genetype is 136/1采用 ABI-3730 基因測(cè)序儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳檢測(cè),結(jié)果顯示,各個(gè)位點(diǎn)較完整,熒光強(qiáng)度值和片段大小均在理想范圍內(nèi)。圖 3-2 為 3 號(hào)樣品在位點(diǎn)基因型(126/136bp),是雜合子;圖 3-3 為 2 號(hào)個(gè)體在位點(diǎn) OarJMP29 的基因bp),是純合子。3.2.4 群體遺傳多樣性分析
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本文編號(hào):2878015

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