目的:Tourette綜合征是一種起病于兒童時期,以多發(fā)性運動抽動伴有一種或多種發(fā)聲抽動為主要臨床特點的神經精神障礙性疾病。近年來有關谷氨酸受體基因家族與該病的相關性被關注,研究證明多種谷氨酸受體基因參與Tourette綜合征的發(fā)病機制,而GRIN3B基因是谷氨酸受體基因家族中的一個主要成員,本研究的目的是對該基因編碼區(qū)突變進行研究,明確該基因與Tourette綜合征的相關性。方法:本研究通過采用illumina二代測序的方法對GRIN3B基因的全部外顯子區(qū)域進行測序分析;結合測序結果和生物信息學分析,初步篩選TS患者GRIN3B可能與TS相關的突變位點及類型;然后將二代測序初選出的位點用一代測序在相應樣本中進行驗證。其中選取51例Tourette綜合征患兒及60例健康對照組,實驗組選取2015年10月至2016年11月就診于青島大學附屬醫(yī)院的51例年齡范圍在6-16歲的TS患兒,平均年齡9.78±3.64歲,其中男孩41例(80.4%),女孩10例(19.6%);入選標準為:(1)在疾病的某段時間內存在多種運動和一個或更多的發(fā)聲抽動,盡管不一定同時出現;(2)抽動的頻率可以有強有弱,但自第一次抽動發(fā)生起持續(xù)超過一年;(3)18歲前發(fā)病;(4)這種障礙不能歸因于某種物質(例如可卡因)的生理效應或其他軀體疾病。健康對照組選取年齡在22-45歲范圍內的健康體檢者,平均年齡29.08±2.89歲,其中男性49例(81.7%),女性11例(18.3%)。選擇標準為:(1)無神經系統(tǒng)和精神疾病及其它重大軀體疾病;(2)無神經、精神疾病家族史;(3)自愿參與此次臨床試驗并簽署知情同意書的健康體檢者。提取兩組的血液基因組DNA,設計GRIN3B基因片段引物,然后對GRIN3B基因編碼區(qū)進行PCR擴增,采用Sanger測序法對每一個編碼區(qū)進行測序,并將測序結果與對照組及NCBI數據庫中GRIN3B基因編碼區(qū)原序列(NM_138690.2)進行比對,檢測這些患兒是否攜帶GRIN3B基因突變。結果:本研究通過Sanger測序法對TS組及對照組的GRIN3B基因進行突變研究,結果在TS組發(fā)現兩個非同義變異位點p.P154S和p.L396S,其中rs113181909位點變異(c.C460T)導致脯氨酸突變成絲氨酸(p.P154S),該氨基酸位于高度保守序列。rs12978900位點變異(c.T1187C)導致亮氨酸突變?yōu)榻z氨酸(p.L396S),但該氨基酸位于非保守序列,而對照組rs113181909和rs12978900未發(fā)現相應的變異。經生物信息學分析發(fā)現,位于GRIN3B蛋白第154位密碼子編碼的脯氨酸變?yōu)榻z氨酸(p.P154S),第396位密碼子編碼的亮氨酸變?yōu)榻z氨酸(p.L396S)。同時,利用DNAMAN軟件將人、牛、小鼠、綿羊、大白鼠以及野豬的GRIN3B蛋白進行多重序列比對,結果發(fā)現第154位氨基酸位于保守區(qū)內,而位于第396位的氨基酸位于非保守區(qū)域。結論:在2例患者中發(fā)現了GRIN3B基因c.C460T(p.P154S)變體;在10例患者中發(fā)現GRIN3B基因c.T1187C(p.L396S)變體,并通過Sanger測序的方法驗證,得到雙峰變異測序圖。兩個GRIN3B變異位點均導致該編碼蛋白的改變,但有關GRIN3B基因變異導致Tourette綜合征的具體機制尚不明確。
【學位單位】：青島大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：R749.94
【部分圖文】：

8第三章 實驗結果3.1 瓊脂糖凝膠電泳結果(見圖1)圖1 瓊脂糖凝膠電泳圖（注：泳道1為Marker I，自上到下分別為：700bp，600 bp，500 bp，400 bp，300 bp，200 bp，100 bp;其他泳道自左到右分別為GRIN3B 1-9 的PCR產物,其中泳道2-3為外顯子1、2的PCR產物；泳道4-6為GRIN3B外顯子3的3個片段的PCR產物；7-12泳道為4-9外顯子PCR產物)3.2 Sanger測序結果發(fā)現兩例GRIN3B基因c.460C＞T（圖2A）變異和一例c.1187T＞C（圖2B）變異

圖2 Sanger測序結果到下為：GRIN3B基因c.460C＞T, p.P154S，健康人GRIN3B基因序列；B:自上到下為：GRIN3B基因.L396S，健康人GRIN3B基因序列)生物信息學分析結果生物信息學分析發(fā)現，位于GRIN3B蛋白第154位密碼子編碼的脯氨酸p.P154S），第396位密碼子編碼的亮氨酸變?yōu)榻z氨酸（p.L396S）。同AMAN軟件將人、牛、小鼠、綿羊、大白鼠以及野豬的GRIN3B蛋白進對，結果發(fā)現第154位氨基酸位于保守區(qū)內，而位于第396位的氨基酸域(見圖3)。

圖2 Sanger測序結果(A:自上到下為：GRIN3B基因c.460C＞T, p.P154S，健康人GRIN3B基因序列；B:自上到下為：GRIN3B基因c.1187T＞C, p.L396S，健康人GRIN3B基因序列)3.3 生物信息學分析結果經生物信息學分析發(fā)現，位于GRIN3B蛋白第154位密碼子編碼的脯氨酸變?yōu)榻z氨酸（p.P154S），第396位密碼子編碼的亮氨酸變?yōu)榻z氨酸（p.L396S）。同時，利用DNAMAN軟件將人、牛、小鼠、綿羊、大白鼠以及野豬的GRIN3B蛋白進行多重序列比對，結果發(fā)現第154位氨基酸位于保守區(qū)內，而位于第396位的氨基酸位于非保守區(qū)域(見圖3)。A
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本文編號：2890932