H5N1和H5N8亞型HPAI病毒的時空分布及長距離傳播特征研究
發(fā)布時間:2024-06-28 04:02
禽流感(Avian Influenza)是指由禽流感病毒引起的禽類的一種綜合癥。其病原根據(jù)致死性的強弱分為高致病性禽流感病毒和低致病性禽流感病毒。近年來,高致病性禽流感病毒因出現(xiàn)跨種間傳播、高致死性等特點而受到人們的廣泛關(guān)注。其中H5亞型是較早發(fā)現(xiàn),分布廣泛的高致病亞型。而對于禽流感病毒的遠距離傳播,遷徙候鳥的作用備受質(zhì)疑。研究H5亞型高致病性禽流感病毒的暴發(fā)、傳播和未來發(fā)展趨勢,對野生鳥類疫情的防控具有重要意義。本研究首先從整體上對近年來高致病性禽流感病毒H5N1和H5N8亞型的暴發(fā)及進化規(guī)律進行了初步統(tǒng)計分析。再利用MaxEnt模型分別對H5N1和H5N8亞型高致病性禽流感毒株的當(dāng)前及未來空間適宜性分布進行了預(yù)測。最后對我國目前以野生鳥類為保護對象的自然保護區(qū)所呈現(xiàn)出來的疾病壓力情況進行了探討。具體研究結(jié)果如下:(1)世界范圍內(nèi)高致病性禽流感H5N1發(fā)生過兩次大的暴發(fā),分別在2006年及2016年前后,暴發(fā)次數(shù)有減弱現(xiàn)象;而H5N8禽流感病毒主要的暴發(fā)時間在2016至2017年間,暴發(fā)次數(shù)有增強的趨勢,而亞洲為兩次禽流感暴發(fā)的中心地區(qū)。(2)預(yù)測模型中可見高致病性禽流感H5N1亞型...
【文章頁數(shù)】:230 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 引言
1.2 H5N1的概述
1.2.1 H5N1的結(jié)構(gòu)
1.2.2 H5N1的危害和特征
1.3 H5N8的概述
1.4 最大熵模型(MAXENT)的應(yīng)用
1.5 Logistic回歸模型的應(yīng)用
1.6 系統(tǒng)發(fā)育分析方法的簡介
1.7 地理信息系統(tǒng)(GIS)的簡介
1.8 全球鳥類遷徙路線的分布
1.9 本課題的立題背景與主要研究內(nèi)容
2 H5亞型禽流感病毒的暴發(fā)規(guī)律、進化模式及其在遺傳上的地理傳播路徑分析
2.1 引言
2.2 實驗數(shù)據(jù)和方法
2.2.1 禽流感暴發(fā)數(shù)據(jù)的收集
2.2.2 禽流感暴發(fā)趨勢分析
2.2.3 病毒HA蛋白序列的收集
2.2.4 病毒HA蛋白序列的進化分析
2.3 實驗結(jié)果
2.3.1 H5N1亞型高致病性禽流感在不同國家暴發(fā)數(shù)量統(tǒng)計
2.3.2 H5N1亞型高致病性禽流感暴發(fā)的時間與變化規(guī)律
2.3.3 H5N1亞型高致病性禽流感病毒進化關(guān)系
2.3.4 H5N8亞型高致病性禽流感在不同國家暴發(fā)數(shù)量統(tǒng)計
2.3.5 H5N8亞型高致病性禽流感暴發(fā)的時間與變化規(guī)律
2.3.6 H5N8亞型高致病性禽流感病毒進化關(guān)系
2.4 本章討論
2.4.1 通過H5N1病毒基因進化關(guān)系推測與其關(guān)聯(lián)的鳥類遷徙路線
2.4.2 通過H5N8病毒基因進化關(guān)系推測與其關(guān)聯(lián)的鳥類遷徙路線
2.4.3 H5亞型高致病性禽流感病毒的暴發(fā)與傳播規(guī)律
2.5 本章小結(jié)
3 HPAI-H5N1在不同環(huán)境因子組合條件下的空間分布比較和環(huán)境因子影響分析
3.1 引言
3.2 實驗材料與方法
3.2.1 實驗材料
3.2.2 實驗方法
3.3 實驗結(jié)果
3.3.1 環(huán)境氣候因子的篩選及適生區(qū)評價
3.3.2 家禽對當(dāng)前全球范圍內(nèi)H5N1適生區(qū)分布預(yù)測的影響(第一組分組)
3.3.3 未來全球范圍內(nèi)H5N1適生區(qū)分布的預(yù)測(第二組分組)
3.3.4 適宜性區(qū)域質(zhì)心移動趨勢分析
3.4 本章討論
3.5 本章小結(jié)
4 HPAI-H5N8在不同環(huán)境因子組合條件下的空間分布比較和環(huán)境因子影響分析
4.1 引言
4.2 實驗材料及方法
4.2.1 實驗材料
4.2.2 實驗方法
4.3 實驗結(jié)果
4.3.1 重要環(huán)境氣候變量的篩選
4.3.2 當(dāng)前全球范圍內(nèi)H5N8適生區(qū)的分布預(yù)測(第一組分組)
4.3.3 未來全球范圍內(nèi)H5N8適生區(qū)的分布預(yù)測(第二組分組)
4.4 本章討論
4.5 本章小結(jié)
5 在人類足跡影響下野鳥感染HPAI-H5N1和HPAI-H5N8的風(fēng)險區(qū)域分布
5.1 引言
5.2 實驗材料和方法
5.2.1 實驗數(shù)據(jù)的收集和處理
5.2.2 實驗步驟
5.3 實驗結(jié)果
5.3.1 重要環(huán)境氣候變量的篩選
5.3.2 存在人類足跡等變量條件下HPAI-H5N1的適宜性區(qū)域分布預(yù)測
5.3.3 人類足跡等變量條件下野鳥HPAI-H5N8的適宜性區(qū)域分布預(yù)測
5.4 本章討論
5.5 本章小結(jié)
6 HPAI-H5N1和HPAI-H5N8亞型在我國以鳥類為保護對象的自然保護區(qū)的分布體現(xiàn)
6.1 引言
6.2 實驗原理和方法
6.2.1 實驗原理
6.2.2 實驗方法
6.3 實驗結(jié)果
6.3.1 野生鳥類暴發(fā)H5N1和H5N8亞型禽流感與全球濕地分布的關(guān)系
6.3.2 HPAI-H5N1亞型毒株引發(fā)野鳥死亡的熱點地區(qū)分析
6.3.3 334個自然保護區(qū)目前可能受到HPAIV-H5N1影響的情況
6.3.4 野生鳥類感染HPAIV-H5N8亞型毒株的時間變化趨勢分析
6.3.5 同時對兩種亞型毒株表現(xiàn)出適生性的自然保護區(qū)分析
6.4 本章討論
6.5 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號:3996407
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摘要
Abstract
1 緒論
1.1 引言
1.2 H5N1的概述
1.2.1 H5N1的結(jié)構(gòu)
1.2.2 H5N1的危害和特征
1.3 H5N8的概述
1.4 最大熵模型(MAXENT)的應(yīng)用
1.5 Logistic回歸模型的應(yīng)用
1.6 系統(tǒng)發(fā)育分析方法的簡介
1.7 地理信息系統(tǒng)(GIS)的簡介
1.8 全球鳥類遷徙路線的分布
1.9 本課題的立題背景與主要研究內(nèi)容
2 H5亞型禽流感病毒的暴發(fā)規(guī)律、進化模式及其在遺傳上的地理傳播路徑分析
2.1 引言
2.2 實驗數(shù)據(jù)和方法
2.2.1 禽流感暴發(fā)數(shù)據(jù)的收集
2.2.2 禽流感暴發(fā)趨勢分析
2.2.3 病毒HA蛋白序列的收集
2.2.4 病毒HA蛋白序列的進化分析
2.3 實驗結(jié)果
2.3.1 H5N1亞型高致病性禽流感在不同國家暴發(fā)數(shù)量統(tǒng)計
2.3.2 H5N1亞型高致病性禽流感暴發(fā)的時間與變化規(guī)律
2.3.3 H5N1亞型高致病性禽流感病毒進化關(guān)系
2.3.4 H5N8亞型高致病性禽流感在不同國家暴發(fā)數(shù)量統(tǒng)計
2.3.5 H5N8亞型高致病性禽流感暴發(fā)的時間與變化規(guī)律
2.3.6 H5N8亞型高致病性禽流感病毒進化關(guān)系
2.4 本章討論
2.4.1 通過H5N1病毒基因進化關(guān)系推測與其關(guān)聯(lián)的鳥類遷徙路線
2.4.2 通過H5N8病毒基因進化關(guān)系推測與其關(guān)聯(lián)的鳥類遷徙路線
2.4.3 H5亞型高致病性禽流感病毒的暴發(fā)與傳播規(guī)律
2.5 本章小結(jié)
3 HPAI-H5N1在不同環(huán)境因子組合條件下的空間分布比較和環(huán)境因子影響分析
3.1 引言
3.2 實驗材料與方法
3.2.1 實驗材料
3.2.2 實驗方法
3.3 實驗結(jié)果
3.3.1 環(huán)境氣候因子的篩選及適生區(qū)評價
3.3.2 家禽對當(dāng)前全球范圍內(nèi)H5N1適生區(qū)分布預(yù)測的影響(第一組分組)
3.3.3 未來全球范圍內(nèi)H5N1適生區(qū)分布的預(yù)測(第二組分組)
3.3.4 適宜性區(qū)域質(zhì)心移動趨勢分析
3.4 本章討論
3.5 本章小結(jié)
4 HPAI-H5N8在不同環(huán)境因子組合條件下的空間分布比較和環(huán)境因子影響分析
4.1 引言
4.2 實驗材料及方法
4.2.1 實驗材料
4.2.2 實驗方法
4.3 實驗結(jié)果
4.3.1 重要環(huán)境氣候變量的篩選
4.3.2 當(dāng)前全球范圍內(nèi)H5N8適生區(qū)的分布預(yù)測(第一組分組)
4.3.3 未來全球范圍內(nèi)H5N8適生區(qū)的分布預(yù)測(第二組分組)
4.4 本章討論
4.5 本章小結(jié)
5 在人類足跡影響下野鳥感染HPAI-H5N1和HPAI-H5N8的風(fēng)險區(qū)域分布
5.1 引言
5.2 實驗材料和方法
5.2.1 實驗數(shù)據(jù)的收集和處理
5.2.2 實驗步驟
5.3 實驗結(jié)果
5.3.1 重要環(huán)境氣候變量的篩選
5.3.2 存在人類足跡等變量條件下HPAI-H5N1的適宜性區(qū)域分布預(yù)測
5.3.3 人類足跡等變量條件下野鳥HPAI-H5N8的適宜性區(qū)域分布預(yù)測
5.4 本章討論
5.5 本章小結(jié)
6 HPAI-H5N1和HPAI-H5N8亞型在我國以鳥類為保護對象的自然保護區(qū)的分布體現(xiàn)
6.1 引言
6.2 實驗原理和方法
6.2.1 實驗原理
6.2.2 實驗方法
6.3 實驗結(jié)果
6.3.1 野生鳥類暴發(fā)H5N1和H5N8亞型禽流感與全球濕地分布的關(guān)系
6.3.2 HPAI-H5N1亞型毒株引發(fā)野鳥死亡的熱點地區(qū)分析
6.3.3 334個自然保護區(qū)目前可能受到HPAIV-H5N1影響的情況
6.3.4 野生鳥類感染HPAIV-H5N8亞型毒株的時間變化趨勢分析
6.3.5 同時對兩種亞型毒株表現(xiàn)出適生性的自然保護區(qū)分析
6.4 本章討論
6.5 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號:3996407
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