為探究藏系綿羊瘤胃和糞便的微生物群落結(jié)構(gòu)特征及差異,以5只6月齡體況相近及體質(zhì)量為(21.50±0.59)kg的藏系綿羊為研究對象,分別采集其瘤胃液和糞便樣品,利用高通量測序技術(shù)對16S rRNA基因V3-V4區(qū)段進行測序和生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,從藏系綿羊瘤胃液和糞便10個樣品中共獲得729 326條原始序列,經(jīng)過濾后平均每個樣品產(chǎn)生(64 145±320)條優(yōu)化序列,平均長度(435.20±2.78) bp,聚類后共得到1 207個OTU。藏系綿羊瘤胃微生物的Chao 1指數(shù)和ACE指數(shù)顯著高于糞便微生物,而Simpson指數(shù)和Shannon指數(shù)在兩組之間差異均不顯著,且兩組的菌群結(jié)構(gòu)有顯著分化。在門分類水平上,瘤胃中相對豐度最高的優(yōu)勢菌門為擬桿菌門,糞便中相對豐度最高的優(yōu)勢菌門為厚壁菌門;在屬分類水平上,瘤胃中相對豐度最高的屬為細菌和普雷沃氏菌屬₁,糞便中相對豐度最高的屬為瘤胃球菌科Ruminococcaceae_UCG₀10。對瘤胃和糞便的微生物群落進行功能預(yù)測,發(fā)現(xiàn)有顯著性差異的代謝通路34個,主要富集在代謝、...

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗動物
    1.2 樣品的采集與處理
    1.3 DNA提取及高通量測序
    1.4 微生物多樣性的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 各樣品測序結(jié)果
    2.2 微生物群落多樣性分析
        2.2.1 α多樣性分析
        2.2.2 β多樣性分析
    2.3 不同分類水平微生物群落結(jié)構(gòu)差異分析
        2.3.1 門水平微生物群落結(jié)構(gòu)差異
        2.3.2 屬水平微生物群落結(jié)構(gòu)差異
    2.4 微生物基因功能預(yù)測分析
3 討 論
    3.1 瘤胃和糞便的微生物群落多樣性
    3.2 瘤胃和糞便微生物在不同分類水平上的群落結(jié)構(gòu)差異
    3.3 瘤胃和糞便微生物功能預(yù)測
4 結(jié) 論



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