發(fā)布時間：2024-06-01 22:17

　　本研究將同窩民豬6頭隨機分為兩組：常溫組3頭20℃24h飼養(yǎng)；低溫組3頭4℃24h飼養(yǎng)。分別對兩組民豬肌肉組織進行表達譜測序，目的是獲得民豬在冷應激反應時差異基因。全文主要結論如下： 1）常溫組和低溫組分別獲得5860627條和5664509條高質量標簽序列（Clean Tags），占標簽序列總量的95.28%和96.89%，約為標簽序列種類的37.37%和38.24%。 2）篩選出差異表達基因1720個，其中上調表達基因662個，下調表達基因1058個，通過對差異基因篩選結果進一步分析發(fā)現了大量免疫相關的基因，如豬白細胞抗原2基因（SLA-2）、白介素10基因（IL-10）等；生長性能相關基因，肌球蛋白重鏈4基因（MYH4）、抗壞血酸過氧化物酶基因（OSAP）、硫氧還蛋白還原酶1基因（TXNRD1）、上皮生長因子基因(EGF)、3磷酸肌醇依賴性蛋白激酶1基因（PDK-1）、肌酸磷酸激酶2基因（CKMT-2）、圍脂滴蛋白2基因（PLIN-2）、半乳糖結合蛋白基因（GBP1）等，機體保護相關基因硝基還原酶基因（NOR-1）、CADD45A等。 3）對1720個差異基因進行了GO Onto...

【文章頁數】：65 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1測序飽和度分析

圖3-1測序飽和度分析Fig.3-1Sequencingsaturationanalysis.1.2高質量標簽序列統(tǒng)計分析.1.2.1高質量標簽序列分布統(tǒng)計通過對測序標簽序列的統(tǒng)計分析發(fā)現，常溫組和低溫組分別獲得586萬條和566萬量標簽序列（CleanT....

圖3-2測序整體質量評估Fig.3-2SequencingQualityEvaluation

圖3-2測序整體質量評估Fig.3-2SequencingQualityEvaluation圖3-3高質量標簽序列拷貝數分布統(tǒng)計分析Fig.3-3DistributionofCleanTagCopyNumber

圖3-3高質量標簽序列拷貝數分布統(tǒng)計分析

18圖3-3高質量標簽序列拷貝數分布統(tǒng)計分析Fig.3-3DistributionofCleanTagCopyNumber3.1.2.2高質量標簽序列的對比統(tǒng)計將標簽序列對比到已知轉錄組是鑒定基因表達譜分子事件的最有效辦法，將常溫、低溫組文庫中tag比對到....

圖3-4高質量標簽序列比對統(tǒng)計

圖3-4高質量標簽序列比對統(tǒng)計Fig.3-4StatisticsofCleanTagAlignment3.1.4民豬差異表達基因篩選將常溫組和低溫組的所有高質量標簽序列經過基因注釋后進行差異表達分析，設定檢測條件為log2（常溫組/低溫組）的比值絕對值大于0.....

本文編號：3986460