高溫處理后尼羅羅非魚性逆轉(zhuǎn)雄魚與未逆轉(zhuǎn)雌魚的差異性腺轉(zhuǎn)錄組研究
發(fā)布時間:2017-12-22 19:23
本文關(guān)鍵詞:高溫處理后尼羅羅非魚性逆轉(zhuǎn)雄魚與未逆轉(zhuǎn)雌魚的差異性腺轉(zhuǎn)錄組研究 出處:《山東農(nóng)業(yè)大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
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【摘要】:動物性別決定一直以來是生物學(xué)領(lǐng)域的研究熱點,它對個體的發(fā)育和自然種群性別比例組成等都具有深刻的影響。依據(jù)性別決定因素,性別決定模式可分為遺傳性別決定(Genotypic Sex Determination,GSD)和溫度性別決定(Temperature-dependent Sex Determination,TSD)兩類。魚類的性別決定模式介于遺傳性別決定(GSD)和溫度性別決定(TSD)之間,也稱為GSD+TE(Temperature Effect)類型,即在性腺分化期溫度變化能部分影響魚類的性別決定。尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)是一種性別分化方向受到基因和溫度雙重影響的魚類,即在尼羅羅非魚的性別分化期,溫度能夠?qū)ζ湫詣e分化的方向起到一定的導(dǎo)向作用,而溫度是如何影響其性別分化,以及尼羅羅非魚性腺分化早期的高溫處理對其性腺發(fā)育的影響如何,具體的分子機制是什么,目前還不是很清楚。本研究通過偽雄魚和野生型雌魚交配的方式建立3個尼羅羅非魚全雌家系,三個家系高溫處理后的性逆轉(zhuǎn)率分別為90.4%、86%和74%。我們挑取雄性率最高的家系分別利用HE染色和Illumina Hiseq技術(shù)對受精后120天全雌家系(對照組)和高溫處理組雌雄尼羅羅非魚性腺進行組織學(xué)檢測和高通量轉(zhuǎn)錄組測序。組織學(xué)結(jié)果顯示高溫處理后的雌魚卵母細(xì)胞排列松散,高溫處理后的雄魚性腺和正常野生型雄魚相似,沒有顯著變化。將測序所得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與尼羅羅非魚基因組進行比對,對照組雌魚(CF)、高溫處理組雌魚(TF)、高溫處理組雄魚(IM)共獲得149624210 Raw Reads,共有124515460 Clean Reads,平均有80.09%Clean Reads比對到尼羅羅非魚基因組上。CF、TF和IM三組間兩兩比較,結(jié)果顯示差異表達基因(DEG)上、下調(diào)數(shù)目分別為:CF/TF共有DEG 79個,其中上調(diào)DEG 34個,下調(diào)DEG 45個;CF/IM共有DEG 11117個,其中上調(diào)DEG 5779個,下調(diào)DEG 5338個;TF/IM共有DEG 11000個,其中上調(diào)DEG5607個,下調(diào)DEG 5393個。Venn圖顯示CF/TF和CF/IM、CF/TF和TF/IM、CF/IM和TF/IM共有的DEG分別為54、44和9451個。將CF/TF DEG按照不同差異倍數(shù)進行分析,發(fā)現(xiàn)有很多差異倍數(shù)大于7的差異基因。另外將所獲得的DEG分別通過COG、NR、KEGG、GO和Swiss Prot注釋,其中GO分析將DEG分為三類,分別為Cellular Component(CC),Molecular Function(MF)和Biological Process(BP)。另外還在Ovarian steroidogenesis,Cell cycle,GnRH signaling pathway,Natural killer cell-mediated cytotoxicity等生物學(xué)通路中鑒定出許多DEG。本研究接著對鑒定出的性類固醇激素合成相關(guān)基因和溫度響應(yīng)相關(guān)基因,利用qRT-PCR進行驗證,共驗證了10個基因,發(fā)現(xiàn)雄性激素合成相關(guān)基因表達上調(diào)如hsd17b7、3β-hsd,雌性合成相關(guān)基因表達下調(diào)如cyp19a1a。并且短暫性腺分化早期的高溫處理持續(xù)影響了cyp19a1a、pycrl、mrpl28、cdc42和ccnh基因。為了進一步檢測短暫性腺分化早期的高溫處理對雌激素合成關(guān)鍵基因cyp19a1a的持續(xù)性影響,本研究利用本實驗室構(gòu)建的cyp19a1a表達載體,誘導(dǎo)原核表達cyp19a1a蛋白,利用親和層析技術(shù)純化蛋白,用其免疫8周齡昆明白小鼠獲得多克隆抗體。利用Western blot檢測高溫處理后cyp19a1a蛋白表達情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)高溫處理后cyp19a1a蛋白在TF和IM中均表達顯著下調(diào)?傊,本研究結(jié)果顯示了高溫處理導(dǎo)致尼羅羅非魚雌魚卵母細(xì)胞排列疏松,對于雄魚沒有顯著影響;顯著下調(diào)了雌激素合成基因,顯著上調(diào)了雄激素合成基因,并持續(xù)影響了卵巢分化和發(fā)育重要基因cyp19a1a相關(guān)基因、溫度響應(yīng)基因和一些核受體基因的表達水平。初步證明了性激素合成代謝可能在一定程度上介導(dǎo)了高溫處理尼羅羅非魚性逆轉(zhuǎn)的過程以及性腺分化早期的高溫處理對一些基因具有持續(xù)性調(diào)控作用。本研究的結(jié)果為進一步探索高溫處理尼羅羅非魚性逆轉(zhuǎn)過程中的分子機制提供了重要基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S917.4
【參考文獻】
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,本文編號:1320707
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