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雙穩(wěn)態(tài)生物系統(tǒng)的動(dòng)力學(xué)建模與分析

發(fā)布時(shí)間:2024-06-14 00:02
  在生物系統(tǒng)的發(fā)展進(jìn)程中,雙穩(wěn)態(tài)扮演了重要角色。為了更好地理解雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng),以及更好地對(duì)癌細(xì)胞中存在的雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行調(diào)控,可以利用非線性方程對(duì)生物系統(tǒng)建立動(dòng)力學(xué)模型并進(jìn)行定量、半定量的分析。本文以Hill函數(shù)為基礎(chǔ),對(duì)雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)建進(jìn)行了理論探究并對(duì)雙穩(wěn)態(tài)生物實(shí)例進(jìn)行了模擬分析。在理論建模方面,本文利用非線性方程描述系統(tǒng)內(nèi)各物質(zhì)間的正負(fù)調(diào)節(jié)關(guān)系。對(duì)于回路數(shù)量較少的二元系統(tǒng),本文枚舉了全部可能的結(jié)構(gòu);對(duì)于回路數(shù)量較多的三元系統(tǒng),本文枚舉了部分結(jié)構(gòu)。對(duì)枚舉出的結(jié)構(gòu),本文探究了各結(jié)構(gòu)的雙穩(wěn)態(tài)魯棒性,以及各結(jié)構(gòu)存在雙穩(wěn)態(tài)時(shí)的參數(shù)取值規(guī)律。最終,本文在構(gòu)建二元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的基礎(chǔ)上,發(fā)現(xiàn)了令閉環(huán)三元系統(tǒng)存在雙穩(wěn)態(tài)的最簡(jiǎn)結(jié)構(gòu),同時(shí)提出了構(gòu)建該類三元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的基本規(guī)則,并推測(cè)了多元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)建規(guī)律。另外,本文根據(jù)示例推測(cè),雙穩(wěn)態(tài)具有較強(qiáng)的延續(xù)性,即多元、多回路母系統(tǒng)的雙穩(wěn)態(tài)存在與否以及特性很大程度上依賴于該系統(tǒng)所包含的少元、少回路子系統(tǒng)。進(jìn)一步的,本文將理論模型運(yùn)用到抗癌治療中受let7-LIN28反饋回路調(diào)控的耐藥性研究與癌癥轉(zhuǎn)移進(jìn)程中受let7-LIN28-OCT4反饋回路調(diào)控的穩(wěn)態(tài)研究中。對(duì)各...

【文章頁(yè)數(shù)】:87 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2.3.1Waddington景觀模型[68]

圖2.3.1Waddington景觀模型[68]

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文生物系統(tǒng)中的非線性方程10點(diǎn)(x*,y*)是該系統(tǒng)的平衡點(diǎn),則應(yīng)當(dāng)滿足F(x*,y*)=0且G(x*,y*)=0。至于該平衡點(diǎn)的穩(wěn)定性,在非線性動(dòng)力學(xué)中可以通過(guò)Jacobi矩陣做進(jìn)一步判斷。而在生物學(xué)的二元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)中,也可以通過(guò)兩種物質(zhì)的零線圖直接判斷,即令....


圖3.2.1二元系

圖3.2.1二元系

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文二元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)與閉環(huán)三元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)建113二元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)與閉環(huán)三元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)建3.1引言對(duì)于利用非線性方程構(gòu)建動(dòng)力學(xué)模型以探究雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)來(lái)說(shuō),什么樣的結(jié)構(gòu)存在雙穩(wěn)態(tài)、什么樣的結(jié)構(gòu)不存在雙穩(wěn)態(tài)、什么樣的參數(shù)取值存在雙穩(wěn)態(tài)始終是關(guān)鍵問(wèn)題。Monod,Gri....


圖3.2.2雙負(fù)反饋結(jié)構(gòu)存在雙穩(wěn)態(tài)時(shí)各參數(shù)取值分布與聚類(若餅圖中百分比相加總和為99%或101%,為運(yùn)算程序小數(shù)點(diǎn)四舍五入造成

圖3.2.2雙負(fù)反饋結(jié)構(gòu)存在雙穩(wěn)態(tài)時(shí)各參數(shù)取值分布與聚類(若餅圖中百分比相加總和為99%或101%,為運(yùn)算程序小數(shù)點(diǎn)四舍五入造成

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文二元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)與閉環(huán)三元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)建14正反饋方程(3.2.2)34755.5%負(fù)反饋方程(3.2.3)00.0%由表3.2.1可知,假設(shè)以方程(2.2.2、2.2.3)為基礎(chǔ)進(jìn)行動(dòng)力學(xué)模型的構(gòu)造,則雙負(fù)反饋或者正反饋是可以令二元系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)雙穩(wěn)態(tài)的結(jié)構(gòu)[10....


圖3.2.3正反饋結(jié)構(gòu)存在雙穩(wěn)態(tài)時(shí)各參數(shù)取值分布與聚類

圖3.2.3正反饋結(jié)構(gòu)存在雙穩(wěn)態(tài)時(shí)各參數(shù)取值分布與聚類

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文二元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)與閉環(huán)三元雙穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)建14正反饋方程(3.2.2)34755.5%負(fù)反饋方程(3.2.3)00.0%由表3.2.1可知,假設(shè)以方程(2.2.2、2.2.3)為基礎(chǔ)進(jìn)行動(dòng)力學(xué)模型的構(gòu)造,則雙負(fù)反饋或者正反饋是可以令二元系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)雙穩(wěn)態(tài)的結(jié)構(gòu)[10....



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