丹參（Salvia miltiorrhiza Bge.）柯巴基焦磷酸合酶1（SmCPS1）基因是編碼丹參酮類成分生物合成途徑下游部分的第一個(gè)關(guān)鍵酶基因,其表達(dá)調(diào)控對(duì)丹參酮類成分含量的積累至關(guān)重要。有關(guān)其表達(dá)機(jī)制的研究對(duì)丹參良種選育和丹參酮類成分的生物合成研究具有重要意義。作為決定基因時(shí)空特異性表達(dá)的主要因素之一,啟動(dòng)子上的序列變化和甲基化修飾均可能改變基因的表達(dá)模式。因此,本研究試從（1）不同遺傳背景丹參SmCPS1基因啟動(dòng)子序列多態(tài)性（2）丹參根、莖和葉中SmCPS1基因啟動(dòng)子序列甲基化特征這兩個(gè)角度探究SmCPS1基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制。主要結(jié)果如下:（1）丹參SmCPS1基因啟動(dòng)子區(qū)序列含有較編碼區(qū)更豐富的多態(tài)性且有些多態(tài)性位點(diǎn)處于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的關(guān)鍵位點(diǎn),如:MIKC_MADS、C2H2、ARR-B、CPP、MYB、AP2、MIKC-MAC、TCP、Dof和TATA-box;這些位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子涉及植物器官如花、種子的形成,參與碳代謝途徑中的基因光調(diào)控過程,響應(yīng)赤霉素、生長素以及鹽、冷和旱脅迫等過程。（2）不同遺傳背景丹參中SmCPS1基因表達(dá)量不同,且Mant...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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圖1.SmCPS1不同區(qū)域的序列多樣性

SmCPS1序列多態(tài)性分布圖如圖2所示。圖2SmCPS1序列多態(tài)性分布圖。

圖2 SmCPS1序列多態(tài)性分布圖。

圖1.SmCPS1不同區(qū)域的序列多樣性2.2.3丹參SmCPS1啟動(dòng)子區(qū)元件預(yù)測(cè)結(jié)果

圖3.位于SmCPS1啟動(dòng)子區(qū)的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)所對(duì)應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子家族數(shù)量統(tǒng)計(jì)

在所測(cè)啟動(dòng)子區(qū)范圍內(nèi),共預(yù)測(cè)出由81個(gè)轉(zhuǎn)錄因子和117個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)組成的33個(gè)調(diào)控區(qū)（表4）。合并同具有重疊區(qū)域的同家族轉(zhuǎn)錄因子后發(fā)現(xiàn),SmCPS1啟動(dòng)子區(qū)分布了23個(gè)不同的轉(zhuǎn)錄因子家族（圖3）。MIKC_MADS和Dof家族的轉(zhuǎn)錄因子分布數(shù)量最多（各8....

圖4.基于SmCPS1序列多態(tài)性位點(diǎn),Neighbor-Joining法聚類結(jié)果

功能性多態(tài)性位點(diǎn)如表6所示。位于啟動(dòng)子上功能性多態(tài)性區(qū)域的有12個(gè)。其中插入/缺失型突變3個(gè)。串聯(lián)重復(fù)型突變4個(gè),其余為單堿基突變型變異。位于外顯子、內(nèi)含子上的突變均為單堿基替換型突變。其中位于外顯子上的有3個(gè),位于內(nèi)含子上的有2個(gè)。圖5.不同遺傳背景丹參原引種地點(diǎn)分布圖

本文編號(hào)：4056877