利用生物信息學(xué)方法對(duì)玉米基因組中的GATA基因家族成員進(jìn)行鑒定,并對(duì)其理化性質(zhì)、染色體分布、系統(tǒng)進(jìn)化、基因結(jié)構(gòu)、保守基序進(jìn)行分析,并分析其在熱脅迫前后的表達(dá)水平變化,以期為玉米GATA基因功能研究奠定基礎(chǔ)。結(jié)果表明,在玉米基因組中共鑒定到37個(gè)GATA基因,它們不均勻地分布在10條染色體上,均含有CX₂CX₁₈CX₂C保守基序;進(jìn)化樹(shù)分析表明,玉米GATA基因家族可分為A、B、C、D 4組,分別包含21、10、4、2個(gè)基因,同一組內(nèi)的基因具有相似的基因結(jié)構(gòu)。熱脅迫處理后,玉米GATA家族成員中表達(dá)上調(diào)的基因有9個(gè),包含A組5個(gè)（Zm00001d010785、Zm00001d023539、Zm00001d041883、Zm00001d025953、Zm00001d031135）,B組2個(gè)（Zm00001d011771、Zm00001d034751）,C組2個(gè)（Zm00001d036494、Zm00001d014656）;下調(diào)的基因有2個(gè),均屬于B組（Zm00001d016361和Zm00001d009193）。說(shuō)明上調(diào)表達(dá)...

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【部分圖文】：

圖1 玉米GATA 基因的染色體分布

由圖1可知,37個(gè)玉米GATA基因在10條染色體上不均勻分布,8號(hào)染色體上最多,含有6個(gè)基因;其次是1號(hào)、4號(hào)和5號(hào)染色體,均含有5個(gè)基因;6號(hào)和10號(hào)染色體分別含有4個(gè)基因;9號(hào)染色體上含有3個(gè)基因;2號(hào)和3號(hào)染色體分別含有2個(gè)基因;7號(hào)染色體上最少,只鑒定到1個(gè)基因。其中,4....

圖2 玉米GATA基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

本研究將鑒定到的玉米GATA基因家族成員氨基酸序列與已知擬南芥GATA基因家族成員氨基酸序列進(jìn)行比對(duì),根據(jù)已知擬南芥GATA基因家族成員進(jìn)化分類信息對(duì)玉米GATA基因家族進(jìn)行分類(圖2),玉米GATA基因家族可以分為4組(A、B、C、D),其中A組包含21個(gè)家族成員,占玉米GAT....

圖3 玉米GATA基因家族成員基因結(jié)構(gòu)

由圖3可知,玉米GATA家族基因含有1～8個(gè)外顯子,其中,A組含有1～3個(gè)外顯子;B組的4個(gè)基因含有2個(gè)外顯子,6個(gè)基因含有3個(gè)外顯子;C組的4個(gè)基因(Zm00001d033523、Zm00001d013331、Zm00001d036494和Zm00001d014656)含有7～....

圖4 玉米GATA基因家族保守基序

圖3玉米GATA基因家族成員基因結(jié)構(gòu)2.4玉米GATA基因家族成員應(yīng)答熱脅迫的表達(dá)分析

本文編號(hào)：4055416