煙草NaD1基因克隆及結(jié)構(gòu)分析
發(fā)布時(shí)間:2024-07-04 23:13
NaD1(Nicotiana alata Defensin 1)蛋白是一種在花煙草(Nicotiana alata)花中發(fā)現(xiàn)的植物防御素。其對(duì)多種植物病原菌及人類病源性真菌具有抗性,同時(shí)還具有撕裂癌細(xì)胞的功能,在植物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中均具有重要的價(jià)值。本研究以花煙草為材料克隆NaD1基因并進(jìn)行深入研究,取得如下結(jié)果:1.NaD1基因克隆及結(jié)構(gòu)分析根據(jù)已經(jīng)報(bào)道的NaD1基因序列,提取mRNA反轉(zhuǎn)cDNA,利用同源克隆法克隆花煙草NaD1基因編碼序列進(jìn)行克隆,分析表明該序列長(zhǎng)為318 bp,與已知的NaD1基因編碼序列的同源性為100%。該基因共編碼105個(gè)氨基酸,其中丙氨酸(A)含量最高(12.4%),谷氨酸(E)含量次之(10.7%),其他氨基酸含量相對(duì)較低。分析發(fā)現(xiàn)NaD1為不穩(wěn)定的疏水性蛋白,相對(duì)分子質(zhì)量為11.7kD,理論等電點(diǎn)pI為6.56,具有信號(hào)肽(第4-21位氨基酸)、跨膜結(jié)構(gòu)及多個(gè)磷酸化位點(diǎn);其二級(jí)結(jié)構(gòu)中3個(gè)ɑ-螺旋及1個(gè)β-折疊,符合植物防御素的結(jié)構(gòu)特征。利用同源克隆技術(shù),以花煙草基因組DNA為模板,克隆了NaD1基因的基因組DNA序列,分析表明其大小為514 bp,包含...
【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 前言
2 NaD1蛋白簡(jiǎn)介
2.1 NaD1蛋白編碼基因克隆及蛋白結(jié)構(gòu)研究
2.2 NaD1蛋白的作用及作用機(jī)制
3 內(nèi)含子
3.1 內(nèi)含子的分類
3.2 內(nèi)含子的功能
4 真核生物啟動(dòng)子
4.1 真核生物啟動(dòng)子的組成
4.2 啟動(dòng)子的克隆方法
4.3 啟動(dòng)子的研究方法
5 本研究的目的及意義
第二章 花煙草NaD1基因的克隆及結(jié)構(gòu)分析
1 前言
2 材料與方法
2.1 材料
2.2 主要試劑與儀器設(shè)備
2.3 引物
2.4 試驗(yàn)方法
3 結(jié)果與分析
3.1 NaD1基因全長(zhǎng)編碼序列克隆
3.2 NaD1基因生物信息學(xué)分析
3.3 NaD1基因dna序列克隆
3.4 NaD1基因的基因結(jié)構(gòu)及內(nèi)含子序列分析
3.5 NaD1基因啟動(dòng)子片段克隆
3.6 NaD1基因啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)及順式作用元件的預(yù)測(cè)
3.7 NaD1基因啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性驗(yàn)證
4 討論
第三章 NaD1基因在花煙草不同器官中的表達(dá)研究
1 前言
2 材料與方法
2.1 材料
2.2 主要試劑與儀器設(shè)備
2.3 引物
2.4 試驗(yàn)方法
3 結(jié)果與分析
3.1 熒光定量pcr引物的篩選
3.2 NaD1基因在花煙草不同器官中的表達(dá)分析
4 討論
第四章 結(jié)論、創(chuàng)新點(diǎn)與研究展望
1 結(jié)論
2 創(chuàng)新點(diǎn)
3 研究展望
參考文獻(xiàn)
附錄一
附錄二
致謝
本文編號(hào):4000675
【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 前言
2 NaD1蛋白簡(jiǎn)介
2.1 NaD1蛋白編碼基因克隆及蛋白結(jié)構(gòu)研究
2.2 NaD1蛋白的作用及作用機(jī)制
3 內(nèi)含子
3.1 內(nèi)含子的分類
3.2 內(nèi)含子的功能
4 真核生物啟動(dòng)子
4.1 真核生物啟動(dòng)子的組成
4.2 啟動(dòng)子的克隆方法
4.3 啟動(dòng)子的研究方法
5 本研究的目的及意義
第二章 花煙草NaD1基因的克隆及結(jié)構(gòu)分析
1 前言
2 材料與方法
2.1 材料
2.2 主要試劑與儀器設(shè)備
2.3 引物
2.4 試驗(yàn)方法
3 結(jié)果與分析
3.1 NaD1基因全長(zhǎng)編碼序列克隆
3.2 NaD1基因生物信息學(xué)分析
3.3 NaD1基因dna序列克隆
3.4 NaD1基因的基因結(jié)構(gòu)及內(nèi)含子序列分析
3.5 NaD1基因啟動(dòng)子片段克隆
3.6 NaD1基因啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)及順式作用元件的預(yù)測(cè)
3.7 NaD1基因啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性驗(yàn)證
4 討論
第三章 NaD1基因在花煙草不同器官中的表達(dá)研究
1 前言
2 材料與方法
2.1 材料
2.2 主要試劑與儀器設(shè)備
2.3 引物
2.4 試驗(yàn)方法
3 結(jié)果與分析
3.1 熒光定量pcr引物的篩選
3.2 NaD1基因在花煙草不同器官中的表達(dá)分析
4 討論
第四章 結(jié)論、創(chuàng)新點(diǎn)與研究展望
1 結(jié)論
2 創(chuàng)新點(diǎn)
3 研究展望
參考文獻(xiàn)
附錄一
附錄二
致謝
本文編號(hào):4000675
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