發(fā)布時間：2024-07-01 22:46

　　以脆肉型‘京欣3號’西瓜和硬肉型‘甜王’西瓜為樣品,評價果肉硬度表型差異,并利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)檢測2個品種間差異表達基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn)‘,甜王’西瓜品種果肉硬度是‘京欣3號’西瓜的1.9倍,表型與‘京欣3號’西瓜具有顯著性差異。轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示,與‘京欣3號’西瓜相比‘,甜王’西瓜樣品有5 342個基因差異表達,其中2 360個基因上調(diào)表達,2 982個基因下調(diào)表達。差異基因主要注釋在碳水化合物代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、脂質(zhì)代謝等途徑,其中與果肉硬度變化的候選基因主要包括果膠酯酶、果膠裂合酶、聚半乳糖醛酸酶、纖維素酶、纖維素合酶、β-半乳糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、酸性幾丁質(zhì)酶、幾丁質(zhì)酶、木葡聚糖內(nèi)轉(zhuǎn)葡糖基酶/水解酶和脂氧合酶基因。鈣調(diào)蛋白、乙烯反應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子、乙烯不敏感樣蛋白、WRKY轉(zhuǎn)錄因子、MYC2轉(zhuǎn)錄因子、過氧化氫酶、呼吸爆發(fā)氧化酶和脫落酸受體PYR1參與果肉細胞活動信號轉(zhuǎn)導(dǎo),可能與果肉硬度相關(guān)。

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【部分圖文】：

圖2西瓜樣本間相關(guān)性分析

通過對不同西瓜樣本的表達基因進行比較，篩選出差異表達基因。將FC（差異倍數(shù)）≥2且Padjust<0.05作為篩選標(biāo)準(zhǔn)，差異表達基因的數(shù)目統(tǒng)計如表2所示，2組間共有5342個基因差異表達，其中2360個基因上調(diào)表達，2982個基因下調(diào)表達。差異基因火山圖（圖4）可以簡明地....

圖7差異表達基因的分層聚類分析

脂氧合酶參與植物脂肪酸氧化，與植物的抗病和抗傷害反應(yīng)密切相關(guān)。鈣調(diào)蛋白可以調(diào)節(jié)細胞內(nèi)鈣離子的濃度，介導(dǎo)細胞活動。乙烯響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子是植物中廣泛存在的轉(zhuǎn)錄因子,對植物的生長發(fā)育、次生代謝過程和植物的抗脅迫能力具有重要的調(diào)控作用[24]。Gao等[19]對‘PI186490’和‘San....

圖1西瓜果肉貯藏期內(nèi)硬度變化

圖1顯示，‘京欣3號’西瓜和‘甜王’西瓜在貯藏期期間硬度變化情況。‘京欣3號’西瓜和‘甜王’西瓜具有相同的母本，屬于近緣品種，‘京欣3號’西瓜果肉松脆，而‘甜王’西瓜果肉較硬。測定結(jié)果顯示‘甜王’西瓜果肉硬度顯著高于‘京欣3號’西瓜，是‘京欣3號’西瓜果肉硬度的1.9倍；在貯藏期....

圖3西瓜樣本PCA分析

圖2西瓜樣本間相關(guān)性分析2.5差異表達基因的GO功能富集

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