為挖掘柑橘潰瘍病抗性關(guān)鍵基因,對(duì)柑橘促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)基因家族進(jìn)行注釋和功能域分析,明確了CsMPK1、CsMPK3、CsMPK4、CsMPK6和CsMPK19的組織表達(dá)特異性和在抗病品種‘金彈’(Fortunella japonica Swingle)和感病品種‘晚錦橙’(Citrus sinensis Osbeck)中受病原菌(Xanthomonas citri subsp.citri,Xcc)誘導(dǎo)的表達(dá)情況;并對(duì)CsMPK19進(jìn)行了生物信息分析。共注釋出12個(gè)柑橘M(fèi)APK基因家族成員,根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)將其分為3個(gè)亞類(lèi),均含有促分裂原活化蛋白激酶(Pkinase)功能結(jié)構(gòu)域。其中CsMPK1、CsMPK3、CsMPK4-1和CsMPK6在果實(shí)中表達(dá)水平較高,CsMPK19在葉片中表達(dá)量相對(duì)較高。CsMPK1的表達(dá)在潰瘍病抗(感)品種中均受病原菌強(qiáng)烈誘導(dǎo),且在感病品種中上調(diào)的幅度高于抗病品種;CsMPK3和CsMPK6僅在感病品種中病原菌處理早期有較強(qiáng)烈的響應(yīng);CsMPK4-1和CsMPK4-2的表達(dá)在感病品種中受病原菌誘導(dǎo)上調(diào),而在抗病品種中病原菌處理后低于水處理對(duì)照;...

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圖1柑橘與擬南芥MPK的功能域分析

柑橘與擬南芥的MAPK基因家族相似性較高，根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，MAPK基因家族可分為3個(gè)類(lèi)群（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ）。對(duì)柑橘和擬南芥的MAPK基因家族的功能域進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)這些基因都有促分裂原活化蛋白激酶（Pkinase）功能結(jié)構(gòu)域（圖1）。2.2CsMPK的組織表達(dá)特異性分析

圖2CsMPK在‘晚錦橙’不同組織的表達(dá)量

根據(jù)目前MAPK基因在抗病方面的相關(guān)研究結(jié)果，結(jié)合課題組前期的研究基礎(chǔ)，推測(cè)CsMPK1(Cs3g25220）、CsMPK3(Cs8g17360）、CsMPK4-1(orange1.1t00403）、CsMPK4-2(Cs5g03160）、CsMPK6(orange1.1t02....

圖3CsMPK受潰瘍病菌誘導(dǎo)的表達(dá)量分析

對(duì)在抗病品種中受病原菌誘導(dǎo)上調(diào)幅度較大的CsMPK19(Cs5g13100.1）進(jìn)行了生物信息分析。序列比對(duì)表明，CsMPK19位于甜橙的5號(hào)染色體，基因全長(zhǎng)5137bp，其開(kāi)放閱讀框由10個(gè)外顯子組成，序列總長(zhǎng)度為1824bp，可編碼607個(gè)氨基酸；ProtPar....

圖4不同物種MPK的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

根據(jù)甜橙的CsMPK19蛋白序列，通過(guò)Phytozomev12.1數(shù)據(jù)庫(kù)和TAIR數(shù)據(jù)庫(kù)獲得了多個(gè)物種的MPK蛋白序列，并用MEGA7.0軟件與可可樹(shù)（Theobromacacao;Thecc1EG032167t1）、木瓜（Caricapapaya;evm.TU.cont....

本文編號(hào)：3997906