柑橘MAPK基因的生物信息及其響應潰瘍病菌侵染的表達分析
發(fā)布時間:2024-06-29 21:19
為挖掘柑橘潰瘍病抗性關鍵基因,對柑橘促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)基因家族進行注釋和功能域分析,明確了CsMPK1、CsMPK3、CsMPK4、CsMPK6和CsMPK19的組織表達特異性和在抗病品種‘金彈’(Fortunella japonica Swingle)和感病品種‘晚錦橙’(Citrus sinensis Osbeck)中受病原菌(Xanthomonas citri subsp.citri,Xcc)誘導的表達情況;并對CsMPK19進行了生物信息分析。共注釋出12個柑橘MAPK基因家族成員,根據系統(tǒng)發(fā)育樹將其分為3個亞類,均含有促分裂原活化蛋白激酶(Pkinase)功能結構域。其中CsMPK1、CsMPK3、CsMPK4-1和CsMPK6在果實中表達水平較高,CsMPK19在葉片中表達量相對較高。CsMPK1的表達在潰瘍病抗(感)品種中均受病原菌強烈誘導,且在感病品種中上調的幅度高于抗病品種;CsMPK3和CsMPK6僅在感病品種中病原菌處理早期有較強烈的響應;CsMPK4-1和CsMPK4-2的表達在感病品種中受病原菌誘導上調,而在抗病品種中病原菌處理后低于水處理對照;...
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本文編號:3997906
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圖1柑橘與擬南芥MPK的功能域分析
柑橘與擬南芥的MAPK基因家族相似性較高,根據系統(tǒng)發(fā)育關系,MAPK基因家族可分為3個類群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)。對柑橘和擬南芥的MAPK基因家族的功能域進行分析,發(fā)現這些基因都有促分裂原活化蛋白激酶(Pkinase)功能結構域(圖1)。2.2CsMPK的組織表達特異性分析
圖2CsMPK在‘晚錦橙’不同組織的表達量
根據目前MAPK基因在抗病方面的相關研究結果,結合課題組前期的研究基礎,推測CsMPK1(Cs3g25220)、CsMPK3(Cs8g17360)、CsMPK4-1(orange1.1t00403)、CsMPK4-2(Cs5g03160)、CsMPK6(orange1.1t02....
圖3CsMPK受潰瘍病菌誘導的表達量分析
對在抗病品種中受病原菌誘導上調幅度較大的CsMPK19(Cs5g13100.1)進行了生物信息分析。序列比對表明,CsMPK19位于甜橙的5號染色體,基因全長5137bp,其開放閱讀框由10個外顯子組成,序列總長度為1824bp,可編碼607個氨基酸;ProtPar....
圖4不同物種MPK的系統(tǒng)進化樹
根據甜橙的CsMPK19蛋白序列,通過Phytozomev12.1數據庫和TAIR數據庫獲得了多個物種的MPK蛋白序列,并用MEGA7.0軟件與可可樹(Theobromacacao;Thecc1EG032167t1)、木瓜(Caricapapaya;evm.TU.cont....
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