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水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油特性及基因表達(dá)譜分析

發(fā)布時(shí)間:2020-12-07 16:50
  水黃皮(Millettia pinnata)為豆科(Leguminosae)崖豆藤屬(Millettia)植物,因其種子具有較高含量的非食用油脂而成為生物柴油的潛在原料樹(shù)種。培育具有商業(yè)應(yīng)用價(jià)值的水黃皮品種有賴于對(duì)其種子發(fā)育過(guò)程中調(diào)節(jié)油脂積累的分子機(jī)制進(jìn)行系統(tǒng)了解。到目前為止,此物種中只有有限的基因組序列或轉(zhuǎn)錄本序列被分離并用于研究,對(duì)其種子不同發(fā)育階段的基因表達(dá)模式尚未有報(bào)道。本研究擬通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)水黃皮種子三個(gè)發(fā)育階段進(jìn)行RNA-Seq分析,以了解此發(fā)育過(guò)程中基因表達(dá)的變化特點(diǎn)及其與油脂代謝變化的相關(guān)性。本論文首先基于種子胚胎形態(tài)、干重、鮮重及含水量等多方面特征,確定了水黃皮種子三個(gè)主要發(fā)育階段,即胚胎形成期、灌漿期和脫水期的時(shí)間范圍。然后,應(yīng)用RNA-Seq量化分析三個(gè)發(fā)育階段的基因表達(dá)水平,每個(gè)階段各進(jìn)行了三次生物學(xué)重復(fù)。測(cè)序結(jié)果表明,高達(dá)93.88%的unigenes在三個(gè)發(fā)育階段均有被表達(dá),只有不到2%的unigenes僅在其中一個(gè)階段特異性表達(dá);共發(fā)現(xiàn)8,881個(gè)在任意兩個(gè)階段間存在顯著差異表達(dá)的基因(Differentially Expressed Genes,D... 

【文章來(lái)源】:深圳大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油特性及基因表達(dá)譜分析


水黃皮種子發(fā)育過(guò)程觀測(cè)圖

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圖 2 水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油量變化圖此外,本研究分析了上述 6 個(gè)時(shí)間點(diǎn)提取到的油脂的脂肪酸組成。結(jié)果主要發(fā)現(xiàn)七種類型的脂肪酸,包括 C16:0(棕櫚酸)、C18:0(硬脂酸)、C18:1(油酸)、C18:2(亞酸)、C18:3(亞麻酸)、C20:0(花生酸)、C24:0(山崳酸),且在所有樣品中均有被檢測(cè)(表 3)。而某些類型的脂肪酸,如 C14:0(肉豆蔻酸)和 C24:0(二十四烷酸)只有在特定表 3 水黃皮種子不同發(fā)育時(shí)期的脂肪酸組分測(cè)定開(kāi)花后周數(shù)C16:0 (%) C18:0 (%) C18:1 (%) C18:2 (%) C18:3 (%) C20:0 (%) C22:0 (%) Others 10 14.10%±0.17 7.86%±0.10 27.30%±0.26 49.40%±0.09 0.32%±0.03 0.64%±0.08 0.28%±0.05 0.10%±014 12.98%±0.26 7.62%±0.47 31.75%±0.73 46.60%±0.27 0.25%±0.01 0.51%±0.08 0.21%±0.03 0.09%±0

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水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油特性及基因表達(dá)譜分析酶(linoleate 9S-lipoxygenase)的基因(Ug22769)在 MpSII 和 MpSII,編碼;d體蛋白的基因(Ug22773)在 MpSI 階段高表達(dá)。另一方面,1 個(gè) unigenes 分別在 MpSI、MpSII 和 MpSIII 階段特異性表達(dá)(圖 4)。大表達(dá)基因編碼的蛋白質(zhì)參與了轉(zhuǎn)錄和翻譯過(guò)程的調(diào)節(jié)。同樣,這些在特基因有部分與油脂代謝有關(guān)。比如 ACP 基因(Ug28085),脂肪酸去飽和基urase gene,Ug50523),脂肪酸羥化酶基因(FA hydroxylase gene,Ug50;d體蛋白合成酶基因(3-oxoacyl-ACP synthase gene,Ug42167)和輔酶 A 還原酶基因(long-chain enoyl-CoA reductase gene,Ug51546)在,一個(gè)酰基-輔酶 A 硫酯酶基因(acyl-coA thioesterase gene,Ug43564)達(dá),兩個(gè)脂肪酶基因(Ug36735 和 Ug44985)在 MpSIII 階段表達(dá)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào):2903582

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