兒童哮喘蛋白和microRNAs血清標(biāo)志物的篩選及其診斷模型的構(gòu)建
發(fā)布時(shí)間:2021-01-10 02:34
第一部分采用i TRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)篩選兒童哮喘血清蛋白標(biāo)志物及建立診斷模型研究背景:支氣管哮喘(bronchial asthma)是以持續(xù)的氣道炎癥、氣道高反應(yīng)性和氣道重塑為特征的慢性呼吸道疾病。兒童哮喘發(fā)病率逐年增高,約有1/3的患兒可發(fā)展成為成人哮喘,及時(shí)診斷哮喘、準(zhǔn)確評(píng)估病情是有效防控兒童哮喘的關(guān)鍵。兒童哮喘不同時(shí)期以及病理狀態(tài)下的蛋白質(zhì)表達(dá)水平的不同,可篩選出與兒童哮喘相關(guān)的特異性蛋白,作為預(yù)測(cè)、診斷、評(píng)估兒童哮喘病情及預(yù)后的生物標(biāo)志物。蛋白組學(xué)技術(shù)的發(fā)展為從整體水平分析兒童哮喘相關(guān)蛋白提供了技術(shù)平臺(tái),同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量標(biāo)記聯(lián)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)(isobaric tags for relative and absolute quantification,two-dimensional liquid chromatography,nanoelectrospray ionization and high resolution tandem mass spectrometry using the hybrid quadrupole time-of-flight p...
【文章來(lái)源】:杭州師范大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:119 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
蛋白樣品SDS-PAGE圖
杭州師范大學(xué)碩士學(xué)位論文采用iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)篩選兒童哮喘血清蛋白標(biāo)志物及建立診斷模型362.3.3差異蛋白的GO分析對(duì)本研究的78個(gè)差異蛋白進(jìn)行GO分析,包括分子功能分析、生物過(guò)程、和細(xì)胞成分。根據(jù)分子功能注釋,66個(gè)差異蛋白主要具有分子功能調(diào)節(jié)器、結(jié)合功能、催化活性和轉(zhuǎn)運(yùn)活性等9種分子功能;根據(jù)生物過(guò)程分析,68個(gè)差異蛋白主要參與代謝過(guò)程、細(xì)胞過(guò)程、單一生物過(guò)程、響應(yīng)刺激、生物調(diào)節(jié)、多細(xì)胞生物過(guò)程等22個(gè)重要的生物過(guò)程;通過(guò)細(xì)胞成分分析,68個(gè)差異蛋白主要定位在細(xì)胞器、胞外區(qū)域、細(xì)胞外基質(zhì)、大分子復(fù)合物等8種不同的細(xì)胞結(jié)構(gòu)(圖2-2)。圖2-2兒童哮喘差異蛋白GO分析圖2.3.4差異蛋白的通路富集分析利用通路富集(KEGG)分析顯示,78個(gè)差異蛋白中41個(gè)蛋白主要涉及補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)通路、朊病毒疾并金黃色葡萄球菌感染等53個(gè)通路,其中16個(gè)差異蛋白參與補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)通路(圖2-3)。
杭州師范大學(xué)碩士學(xué)位論文采用iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)篩選兒童哮喘血清蛋白標(biāo)志物及建立診斷模型37圖2-3兒童哮喘差異蛋白通路富集KEGG圖2.3.5差異蛋白的PPI相互作用網(wǎng)絡(luò)圖運(yùn)用String軟件構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖(圖2-4)。圖2-4中各圓圈代表一種蛋白,空間距離越近的蛋白,越有可能歸為一類,蛋白之間的線段越粗表示蛋白間相互作用越緊密。圖2-4兒童哮喘差異蛋白PPI相互作用網(wǎng)絡(luò)圖2.3.6差異蛋白ELISA驗(yàn)證結(jié)合蛋白質(zhì)差異比值和GO、KEGG、STRING分析結(jié)果,從iTRAQ結(jié)果中
本文編號(hào):2967887
【文章來(lái)源】:杭州師范大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:119 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
蛋白樣品SDS-PAGE圖
杭州師范大學(xué)碩士學(xué)位論文采用iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)篩選兒童哮喘血清蛋白標(biāo)志物及建立診斷模型362.3.3差異蛋白的GO分析對(duì)本研究的78個(gè)差異蛋白進(jìn)行GO分析,包括分子功能分析、生物過(guò)程、和細(xì)胞成分。根據(jù)分子功能注釋,66個(gè)差異蛋白主要具有分子功能調(diào)節(jié)器、結(jié)合功能、催化活性和轉(zhuǎn)運(yùn)活性等9種分子功能;根據(jù)生物過(guò)程分析,68個(gè)差異蛋白主要參與代謝過(guò)程、細(xì)胞過(guò)程、單一生物過(guò)程、響應(yīng)刺激、生物調(diào)節(jié)、多細(xì)胞生物過(guò)程等22個(gè)重要的生物過(guò)程;通過(guò)細(xì)胞成分分析,68個(gè)差異蛋白主要定位在細(xì)胞器、胞外區(qū)域、細(xì)胞外基質(zhì)、大分子復(fù)合物等8種不同的細(xì)胞結(jié)構(gòu)(圖2-2)。圖2-2兒童哮喘差異蛋白GO分析圖2.3.4差異蛋白的通路富集分析利用通路富集(KEGG)分析顯示,78個(gè)差異蛋白中41個(gè)蛋白主要涉及補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)通路、朊病毒疾并金黃色葡萄球菌感染等53個(gè)通路,其中16個(gè)差異蛋白參與補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)通路(圖2-3)。
杭州師范大學(xué)碩士學(xué)位論文采用iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)篩選兒童哮喘血清蛋白標(biāo)志物及建立診斷模型37圖2-3兒童哮喘差異蛋白通路富集KEGG圖2.3.5差異蛋白的PPI相互作用網(wǎng)絡(luò)圖運(yùn)用String軟件構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖(圖2-4)。圖2-4中各圓圈代表一種蛋白,空間距離越近的蛋白,越有可能歸為一類,蛋白之間的線段越粗表示蛋白間相互作用越緊密。圖2-4兒童哮喘差異蛋白PPI相互作用網(wǎng)絡(luò)圖2.3.6差異蛋白ELISA驗(yàn)證結(jié)合蛋白質(zhì)差異比值和GO、KEGG、STRING分析結(jié)果,從iTRAQ結(jié)果中
本文編號(hào):2967887
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