造成胃癌治療預(yù)后不良的兩個(gè)主要的因素是轉(zhuǎn)移(包括微轉(zhuǎn)移)與耐藥。本課題的研究目標(biāo)是識(shí)別胃癌微轉(zhuǎn)移、耐藥的預(yù)測(cè)標(biāo)志及可重復(fù)的多維組學(xué)特征。1.識(shí)別微轉(zhuǎn)移與術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)標(biāo)志與胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的多維組學(xué)特征早期胃癌術(shù)后復(fù)發(fā)率很高,除了手術(shù)失敗及幾率較低的腫瘤重新發(fā)生的因素之外,臨床影像及病理檢測(cè)難以發(fā)現(xiàn)的微轉(zhuǎn)移是術(shù)后復(fù)發(fā)的主要原因。因此,亟需發(fā)展預(yù)測(cè)胃癌微轉(zhuǎn)移與術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的標(biāo)志。另外,由于按TNM分期標(biāo)識(shí)的轉(zhuǎn)移與無(wú)轉(zhuǎn)移臨床樣本存在較高的轉(zhuǎn)移假陰性和假陽(yáng)性率,在兩類(lèi)樣本間難以識(shí)別獨(dú)立可重復(fù)的差異表達(dá)基因。因此,我們做了如下兩方面的研究。(1)識(shí)別微轉(zhuǎn)移與術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)標(biāo)志:首先,利用77例僅接受手術(shù)治療的早期胃癌患者的基因表達(dá)譜,識(shí)別了一個(gè)由COL8A1、PTPRE和NALCN等37個(gè)基因組成的19對(duì)基因標(biāo)志(19 gene pair signature,19-GPS),根據(jù)每對(duì)基因在樣本內(nèi)的表達(dá)水平的相對(duì)高低秩序關(guān)系,通過(guò)多數(shù)投票規(guī)則預(yù)測(cè)早期胃癌微轉(zhuǎn)移與術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)。在兩組分別包含71和46例樣本的獨(dú)立數(shù)據(jù)中,驗(yàn)證了該標(biāo)志。(2)識(shí)別可重復(fù)的轉(zhuǎn)移相關(guān)的多維組學(xué)特征:利用19-GPS排除可能...

【文章頁(yè)數(shù)】：141 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖4.15-FU耐藥預(yù)測(cè)標(biāo)志的篩選的流程圖

63圖4.15-FU耐藥預(yù)測(cè)標(biāo)志的篩選的流程圖9個(gè)基因中的任意兩個(gè)基因，根據(jù)它們?cè)谖赴┙M織樣本內(nèi)部的REO據(jù)集中的35個(gè)胃癌樣本分成兩組，然后估計(jì)兩組間OS是否有顯著差素Cox回歸分析，控制p<0.05，我們識(shí)別了兩對(duì)基因（KCNE2和PR和AP....

圖4.2胃癌患者的OS和PFS生存曲線圖

福建醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文樣本分別分為高、風(fēng)險(xiǎn)組，前者的OS顯著短于后者（HR=2.78，95%CI：1.05-7.39，g-rankp=3.39E-02，見(jiàn)圖4.2A）。在矯正了癌癥分期、分級(jí)和性別這些臨床因素，多因素Cox回歸分析顯示該標(biāo)志仍然傾向有預(yù)后區(qū)分能力（p....

圖5.15-FU耐藥相關(guān)的有多維組學(xué)改變的特征基因的功能網(wǎng)絡(luò)分析

圖5.15-FU耐藥相關(guān)的有多維組學(xué)改變的特征基因的功能網(wǎng)絡(luò)分析：綠色的節(jié)點(diǎn)代表5-FU代謝相關(guān)基因；粉色的節(jié)點(diǎn)在A圖中代表在耐藥組中高甲基化且低達(dá)的基因，在B圖中代表在耐藥組中拷貝數(shù)擴(kuò)增且高表達(dá)的基因，在C圖中代表在敏感組頻突變的基因；紅色節(jié)點(diǎn)代表既有表觀....

圖5.2在耐藥組相對(duì)于敏感組中高頻擴(kuò)增的7個(gè)拷貝數(shù)區(qū)域

圖5.2在耐藥組相對(duì)于敏感組中高頻擴(kuò)增的7個(gè)拷貝數(shù)區(qū)域我們分別統(tǒng)計(jì)了TCGA胃癌敏感、耐藥組樣本的突變基因個(gè)數(shù)的均值發(fā)現(xiàn)敏感組樣本的平均突變基因數(shù)為366.69，顯著高于在耐藥樣本中平均因數(shù)305.32（Wilcoxon秩和檢驗(yàn)，p=3.75E-02）。提示基因....

本文編號(hào)：4055202