發(fā)布時間：2024-06-06 00:30

　　目的采用計算機分子對接技術,研究芴酮衍生物與端粒G-四鏈體DNA的相互作用,為建立合理的化合物虛擬篩選模型提供依據(jù)。方法使用SYBYL-X 2.0的分子對接模塊,以2種結合了平面剛性骨架小分子的G-四鏈體DNA晶體結構為目標受體,在對接模型可靠性驗證的基礎上,選取經(jīng)結構優(yōu)化改造后的芴酮衍生物小分子為配體,以總評分為評價標準進行分子對接,研究小分子配體與G-四鏈體DNA的相互作用方式。結果通過對比實驗活性數(shù)據(jù),分子對接模型的總評分能較好地反映化合物的細胞毒性強弱,并給出了多種分子間的相互作用模式。結論通過分子模擬研究建立了比較可靠的對接模型,可在后續(xù)工作中指導化合物結構設計,尋找高活性抗腫瘤化合物。

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【部分圖文】：

將原始配體從晶體結構中抽取并重新對接回原位點后可看出其與原配體基本位于同一位置，其中2MS6配體總評分為5.53，相似度評分為0.64,3ES0配體對接總評分為9.552，相似度評分為0.725�；�于評分結果我們認為對接模型能比較好地預測結合情況，可用于下一步的分子對接研究。重新....

6j為側鏈帶有2個正丁胺基乙基官能團的化合物，其IC50值<10μmol/L，對接總評分均>8分。對接結果顯示（圖5),6j與2MS6的DT9、DT15、DT16形成π-π堆積效應，與DT8、DT9、DT15、DT22形成碳-氫鍵，與DT15、DT23形成常規(guī)氫鍵；6j和3ES0....

圖3化合物4b與2種四鏈體晶體結構的對接結果圖5化合物6j與2種四鏈體晶體結構的對接結果

圖4化合物4d與2種四鏈體晶體結構的對接結果3討論

本文編號：3990033