發(fā)布時間：2020-11-05 08:29

　　 目的:對UNC5D基因進行基因結(jié)構(gòu)分析,保守性分析,轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析,表觀遺傳分析,臨床相關(guān)數(shù)據(jù)計算及其在腎癌中的共表達基因信號通路富集分析,為研究UNC5D在癌癥中檢測及治療提供參考。方法:通過UCSC基因組瀏覽器、ECR browser、MethPrimer、JASPAR、TCGA、starbase、cBioPortal、DAVID及KEGG等公共數(shù)據(jù)庫和在線工具分析軟件對UNC5D序列,轉(zhuǎn)錄調(diào)控,表觀遺傳,臨床表達進行整體分析,并通過TCGA數(shù)據(jù)庫利用SPSS軟件具體分析了腎透明細胞癌患者中UNC5D對臨床患者生存及分期分級,通過Cbioportal尋找UNC5D在腎透明細胞癌中的共表達基因,對預(yù)測的基因集進行信號通路富集分析,預(yù)測UNC5D可能存在的下游信號通路。結(jié)果:研究表明,人UNC5D基因定位于8p12,其上下游鄰近多個腫瘤抑制相關(guān)基因。UNC5D基因序列在哺乳動物中高度保守,其多個轉(zhuǎn)錄本可能翻譯出不同蛋白。UNC5D基因主要表達于成人神經(jīng)系統(tǒng)和泌尿生殖系統(tǒng),且在多種腫瘤中表達呈明顯下降趨勢,其表達量的下降可能與啟動子區(qū)的高甲基化水平有關(guān)。UNC5D的表達量差異對腎癌患者生存存在顯著影響,同時在臨床相關(guān)參數(shù)中存在顯著差異。腎癌中UNC5D共表達基因集的信號通路主要富集在代謝及炎癥相關(guān)通路上。結(jié)論:UNC5D可能在多種癌癥中尤其是腎癌中作為腫瘤抑制因子行使其生物學功能。
【學位單位】：中國醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：R737.11
【部分圖文】：

圖 1 UNC5D 上下游相鄰基因示意圖及對腫瘤相關(guān)基因標注3.2 基因保守性分析ECR browser 的在線分析顯示，UNC5D 基因在哺乳動物中包括小鼠，狗及恒河猴中的全基因保守性較高，均高于百分之五十,而在低等動物中全基因保守性大部分低于百分之五十。（見圖 2）

圖 1 UNC5D 上下游相鄰基因示意圖及對腫瘤相關(guān)基因標注3.2 基因保守性分析ECR browser 的在線分析顯示，UNC5D 基因在哺乳動物中包括小鼠，狗及恒河猴中的全基因保守性較高，均高于百分之五十,而在低等動物中全基因保守性大部分低于百分之五十。（見圖 2）

6圖 3 縱向?qū)Ρ?UNC5D 核心轉(zhuǎn)錄區(qū)甲基化水平，正負表觀遺傳信號水平，轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點信號及預(yù)測，保守性分析3.4 基因變構(gòu)體分析根據(jù)轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)與蛋白結(jié)構(gòu)及檢測分析顯示，UNC5D 基因的 7 個轉(zhuǎn)錄本有 6個經(jīng)檢測可以翻譯出蛋白。其中轉(zhuǎn)錄本 1 和轉(zhuǎn)錄本 2 翻譯的蛋白結(jié)構(gòu)域和長度基本相似，長度分別為 953 個氨基酸和 948 個氨基酸，有完整的免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域、兩個血小板反應(yīng)蛋白類結(jié)構(gòu)域重復、ZU5 結(jié)構(gòu)域和死亡結(jié)構(gòu)域。轉(zhuǎn)錄本 3（H7BXJ2）、轉(zhuǎn)錄本 4（C9J2B6）、轉(zhuǎn)錄本 5（C9J1I0）翻譯的蛋白，均缺少血小板反應(yīng)蛋白類結(jié)構(gòu)域，長度分別為 884 個氨基酸、958 個氨基酸和 886 個氨基酸。轉(zhuǎn)錄本 7
【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 馬偉杰;張君;;腎癌相關(guān)抑癌基因[J];中國腫瘤生物治療雜志;2014年03期

本文編號：2871386