為進一步研究多房棘球絳蟲的致病性、藥物靶點以及疫苗診斷試劑的開發(fā)提供理論依據(jù),應用生物信息學方法預測分析多房棘球絳蟲(Echinococcus multilocularis,Em)鈣網(wǎng)蛋白(Calreticulin,CRT)的結(jié)構(gòu)和功能。通過基因組數(shù)據(jù)庫收集數(shù)據(jù)確定Em-CRT基因和氨基酸序列;利用生物信息學軟件分別對Em-CRT進行蛋白質(zhì)基本性質(zhì)、翻譯后修飾位點、功能域、亞細胞定位、二/三級結(jié)構(gòu)、親/疏水性、抗原表位以及進化關(guān)系等進行預測和分析。結(jié)果表明:Em-CRT基因轉(zhuǎn)錄本長度為1 188 bp,蛋白全長為395個氨基酸殘基,分子量大小約為45.44 kDa,等電點(pI)為4.47,為穩(wěn)定蛋白,親水性較高,可溶于水;具有信號肽和信號肽酶剪切位點,為膜外蛋白;Em-CRT具有N端糖基化位點,酪氨酸激酶(TK)Ⅱ磷酸化位點,cAMP和cGMP依賴蛋白激酶磷酸化位點,N端肉豆蔻酰化位點,蛋白激酶C磷酸化位點,酪氨酸激酶磷酸化位點;二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲和α螺旋為主;Em-CRT具有良好的T,B細胞抗原表位。所以,Em-CRT對多房棘球絳蟲個體發(fā)育具有重要的作用,且與多房棘球蚴感染免疫密...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)準備
    1.2 蛋白質(zhì)特性預測分析
    1.3 蛋白抗原表位分析
    1.4 分子進化分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 Em-CRT蛋白基本性質(zhì)
    2.2 CD4+T 細胞抗原表位結(jié)果
    2.3 CD8+T 細胞抗原表位結(jié)果
    2.4 B細胞抗原表位綜合分析
    2.5 分子進化分析
3 討論與結(jié)論



本文編號：3995704