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人包皮成纖維細胞酵母雙雜交均一化cDNA文庫的構(gòu)建

發(fā)布時間:2020-12-09 17:23
  目的構(gòu)建人包皮成纖維細胞(HFF)酵母雙雜交均一化cDNA文庫,為研究弓形蟲與宿主細胞間的相互作用及其入侵機制奠定基礎(chǔ)。方法復蘇、培養(yǎng)HFF細胞并提取細胞總RNA,采用SMART和LD-PCR合成ds cDNA,對其進行均一化處理后,利用SfiI酶切,酶切后的ds cDNA連接pGADT7-SfiI三閱讀框表達載體,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸埃希菌HST08,構(gòu)建cDNA初級文庫,進行庫容檢測和插入片段的PCR鑒定。提取文庫質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至酵母Y187中,制備HFF細胞Y187酵母文庫。結(jié)果 HFF細胞總RNA的A260/A280值為2.02,1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測到28S和18S核糖體特異性條帶且二者亮度之比為2∶1,提取的RNA完整、質(zhì)量良好。3種讀碼框庫容分別為1.4×106 CFU/ml、1.8×106 CFU/ml和2.0×106 CFU/ml,重組率為99%。cDNA文庫外源基因插入片段長度700~2 000bp。制備的HFF細胞酵母cDNA文庫庫容量為2.5×107 CFU/ml。結(jié)論構(gòu)建的HF... 

【文章來源】:中國病原生物學雜志. 2019年01期 第23-26頁 北大核心

【文章頁數(shù)】:4 頁

【部分圖文】:

人包皮成纖維細胞酵母雙雜交均一化cDNA文庫的構(gòu)建


圖1HFF細胞總RNA1.5%瓊脂糖凝膠電泳M250bpDNALadder1TotalRNAofHFFcellM250bpDNA標志物1HFF細胞總RNA

標志物,電泳圖,庫容,文庫


勻彌散,且濃度提高(圖2B)。M250bpDNA標志物1HFF細胞總RNA圖1HFF細胞總RNA1.5%瓊脂糖凝膠電泳M250bpDNALadder1TotalRNAofHFFcellFig.1TotalRNAofHFFcellM250bpDNA標志物1cDNA2均一化的cDNA圖2cDNA合成及均一化電泳圖M250bpDNALadder1cDNA2normalizedcDNAFig.2GelelectrophoresisresultsofcDNAandnormalizedcDNA3cDNASfiI酶切及純化cDNA經(jīng)過限制性內(nèi)切酶SfiI酶切處理后,使用CHROMASPIN-1000-TE對酶切cDNA進行過柱處理,去除短片段,1.5%瓊脂糖凝膠電泳顯示彌散狀的cDNA均勻分布在500~3000bp處(圖3),短片段得到有效去除。M250bpDNA標志物1CHROMASPIN-1000-TE純化后的cDNA圖3CHROMASPIN-1000-TE純化cDNA的電泳分析M250bpDNALadder1PurificationcDNAwithCHROMASPIN-1000-TEFig.3PurificationcDNAwithCHROMASPIN-1000-TE4初級文庫庫容檢測酶切、純化后的cDNA與pGADT7-SfiI三框表達載體連接、轉(zhuǎn)化后,計算文庫庫容,3種讀碼框庫容分別為1.4×106CFU/ml、1.8×106CFU/ml和2.0×1

標志物,電泳分析,庫容,文庫


勻彌散,且濃度提高(圖2B)。M250bpDNA標志物1HFF細胞總RNA圖1HFF細胞總RNA1.5%瓊脂糖凝膠電泳M250bpDNALadder1TotalRNAofHFFcellFig.1TotalRNAofHFFcellM250bpDNA標志物1cDNA2均一化的cDNA圖2cDNA合成及均一化電泳圖M250bpDNALadder1cDNA2normalizedcDNAFig.2GelelectrophoresisresultsofcDNAandnormalizedcDNA3cDNASfiI酶切及純化cDNA經(jīng)過限制性內(nèi)切酶SfiI酶切處理后,使用CHROMASPIN-1000-TE對酶切cDNA進行過柱處理,去除短片段,1.5%瓊脂糖凝膠電泳顯示彌散狀的cDNA均勻分布在500~3000bp處(圖3),短片段得到有效去除。M250bpDNA標志物1CHROMASPIN-1000-TE純化后的cDNA圖3CHROMASPIN-1000-TE純化cDNA的電泳分析M250bpDNALadder1PurificationcDNAwithCHROMASPIN-1000-TEFig.3PurificationcDNAwithCHROMASPIN-1000-TE4初級文庫庫容檢測酶切、純化后的cDNA與pGADT7-SfiI三框表達載體連接、轉(zhuǎn)化后,計算文庫庫容,3種讀碼框庫容分別為1.4×106CFU/ml、1.8×106CFU/ml和2.0×1

【參考文獻】:
期刊論文
[1]白背飛虱酵母雙雜交cDNA文庫的構(gòu)建[J]. 薛進,李靜,羊健,唐彥,梁瑤,陳劍平,張恒木.  浙江農(nóng)業(yè)學報. 2017(12)
[2]滅蚊真菌-貴陽腐霉Pythium sp.GY1938菌株cDNA文庫的構(gòu)建及鑒定[J]. 楊平,李艷,張坤,余赟,楊亞瓊,黃世梅,李敏惠.  中國病原生物學雜志. 2017(03)

博士論文
[1]與弓形蟲微線體蛋白互作的宿主蛋白的篩選和鑒定[D]. 王一凡.華中農(nóng)業(yè)大學 2015



本文編號:2907211

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