雙峰駝TPM2與TPM3基因表達(dá)模式及其功能探究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-09 03:14
雙峰駝作為一種古老而獨(dú)特的動(dòng)物,有著不可估量的研究?jī)r(jià)值。雙峰駝屬于典型的精清誘導(dǎo)排卵型動(dòng)物,有明顯的季節(jié)性發(fā)情特征。在繁殖季節(jié)與非繁殖季節(jié)不同的生活習(xí)性使的雙峰駝生殖生理存在一定差異。基于本研究團(tuán)隊(duì)前期利用蛋白組學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)肌肉生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)差異原肌球蛋白2(TPM2)與原肌球蛋白3(TPM3)。原肌球蛋白2和原肌球蛋白3結(jié)構(gòu)功能既有相似性也有特異性,編碼平滑肌、骨骼肌等肌肉異構(gòu)體的同時(shí),也編碼肌肉成纖維細(xì)胞異構(gòu)體,對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生不同的影響。為了進(jìn)一步揭示TPM2基因和TPM3基因在不同繁殖期雙峰駝肌肉中的作用,本研究以繁殖季節(jié)雙峰母駝為研究對(duì)象,通過RT-PCR技術(shù)克隆雙峰駝TPM2和TPM3基因并進(jìn)行序列,分析TPM2基因和TPM3基因基本功能;應(yīng)用免疫熒光技術(shù)、免疫組織化學(xué)法、qRT-PCR、Western blot法驗(yàn)證TPM2基因和TPM3基因在繁殖季節(jié)雙峰母駝肌肉具體表達(dá)情況,探究TPM2基因和TPM3基因在繁殖與非繁殖季節(jié)雙峰母駝肌肉組織中的表達(dá)模式;以雙峰駝肌纖維細(xì)胞為基礎(chǔ),通過轉(zhuǎn)染siRNA的方法,探索干擾序列對(duì)肌纖維細(xì)胞凋亡的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn):1.克隆得到雙峰駝CDS全長(zhǎng)為...
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Bcl-2家族成員間異型和同型二聚體結(jié)合調(diào)控細(xì)胞凋亡的原理圖
雙峰駝TPM2與TPM3基因表達(dá)模式及其功能探究13圖2-1雙峰駝TPM2和TPM3基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖Fig2-1BactriancamelTPM2andTPM3genePCRamplificationproductagarosegelelectrophoresis2.2雙峰駝TPM2、TPM3基因核苷酸及氨基酸序列分析根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的ORFFinder軟件分析雙峰駝TPM2基因序列,開放閱讀框根據(jù)序列比對(duì)分析雙峰駝TPM2基因的序列,起始密碼子ATG位在109bp處,終止密碼子TAG位于963bp處。應(yīng)用ProtParam軟件預(yù)測(cè)TPM2理化性質(zhì),分子式為C1400H2325N397O498S115,分子量為33.03988KD,理論等電點(diǎn)為(pI)4.65。而TPM3基因序列比對(duì)結(jié)果顯示起始密碼子ATG位在146bp處,終止密碼子TAG位于521bp處,預(yù)測(cè)TPM3理化性質(zhì)結(jié)果顯示,分子式為C927H1588N294O311S5,分子量為21.98889KD,理論等電點(diǎn)為(pI)5.40,兩蛋白都屬于酸性蛋白。TMHMM2.0Server程序進(jìn)行跨膜區(qū)預(yù)測(cè),表明TPM2、TPM3蛋白都不存在跨膜區(qū)域。亞細(xì)胞定位分析雙峰駝TPM2、TPM3蛋白定位于細(xì)胞核,在線粒體、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞骨架、細(xì)胞膜以及胞質(zhì)中均有分布,主要在細(xì)胞核中大量分布。圖2-2雙峰駝TPM2二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig2-2PredictionofsecondarystructureofBactriancamelTPM2
雙峰駝TPM2與TPM3基因表達(dá)模式及其功能探究13圖2-1雙峰駝TPM2和TPM3基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖Fig2-1BactriancamelTPM2andTPM3genePCRamplificationproductagarosegelelectrophoresis2.2雙峰駝TPM2、TPM3基因核苷酸及氨基酸序列分析根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的ORFFinder軟件分析雙峰駝TPM2基因序列,開放閱讀框根據(jù)序列比對(duì)分析雙峰駝TPM2基因的序列,起始密碼子ATG位在109bp處,終止密碼子TAG位于963bp處。應(yīng)用ProtParam軟件預(yù)測(cè)TPM2理化性質(zhì),分子式為C1400H2325N397O498S115,分子量為33.03988KD,理論等電點(diǎn)為(pI)4.65。而TPM3基因序列比對(duì)結(jié)果顯示起始密碼子ATG位在146bp處,終止密碼子TAG位于521bp處,預(yù)測(cè)TPM3理化性質(zhì)結(jié)果顯示,分子式為C927H1588N294O311S5,分子量為21.98889KD,理論等電點(diǎn)為(pI)5.40,兩蛋白都屬于酸性蛋白。TMHMM2.0Server程序進(jìn)行跨膜區(qū)預(yù)測(cè),表明TPM2、TPM3蛋白都不存在跨膜區(qū)域。亞細(xì)胞定位分析雙峰駝TPM2、TPM3蛋白定位于細(xì)胞核,在線粒體、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞骨架、細(xì)胞膜以及胞質(zhì)中均有分布,主要在細(xì)胞核中大量分布。圖2-2雙峰駝TPM2二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig2-2PredictionofsecondarystructureofBactriancamelTPM2
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貴州黑山羊快肌肌鈣蛋白基因克隆和氨基酸序列分析[J]. 陳浩林,吳仙,朱冠群,毛鳳顯,陳燕,鄧大鵬. 貴州畜牧獸醫(yī). 2018(06)
[2]微小RNA-193a通過原肌球蛋白調(diào)控對(duì)人肺癌細(xì)胞株A549的侵襲和增殖的影響[J]. 張春敭,齊宇,吳愷,張巖,趙松. 中華實(shí)驗(yàn)外科雜志. 2018 (03)
[3]siRNATPM4對(duì)肺癌細(xì)胞增殖凋亡的影響[J]. 何建林,李玨,楊娜. 中國老年學(xué)雜志. 2017(20)
[4]原肌球蛋白3與雄激素受體配體結(jié)合域之間的相互作用[J]. 邱陽,陳曉雅,孫崢嶸,胡冰青,徐品一,崔磊,李玲. 中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(11)
[5]原肌球蛋白3在大腸癌中的表達(dá)和意義[J]. 印璞,李玲霞,高申,宋麗娜,李洪軍,何成彥. 中國實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2015(10)
[6]Bcl-2基因家族研究進(jìn)展[J]. 任玉偉,宿華威. 大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(02)
[7]Bcl-2家族的研究進(jìn)展[J]. 徐云峰,劉松堅(jiān). 中國療養(yǎng)醫(yī)學(xué). 2014(10)
[8]北京鴨和淮南麻鴨胸肌發(fā)育過程TPM1和TPM3基因的表達(dá)變化研究[J]. 葉保國,張小輝,徐鐵山. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2014(19)
[9]雄激素與女性生殖[J]. 崔毓桂,邵麗,千日成,劉嘉茵. 國際生殖健康/計(jì)劃生育雜志. 2014(05)
[10]阿拉善戈壁騸駝和沙漠騸駝體重、出肉量差異與其骨骼肌組織學(xué)性狀的研究[J]. 額爾敦木圖,李盈,劉圖雅,陳澤明,圖雅. 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(05)
博士論文
[1]Sonic hedgehog信號(hào)通路對(duì)正常角質(zhì)形成細(xì)胞增殖及凋亡的影響及其分子機(jī)制[D]. 劉海燕.第四軍醫(yī)大學(xué) 2015
[2]TPM4在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及其生物學(xué)意義[D]. 趙月鳴.吉林大學(xué) 2015
[3]狹鱈和牛肌肉組織提取物在牛肉嫩化中的作用機(jī)理研究[D]. 王蓉蓉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]GLP-1對(duì)骨骼肌肌球蛋白重鏈表達(dá)的影響及機(jī)制研究[D]. 王麗娜.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[5]雜種大白×梅山F1代與其母本梅山豬背最長(zhǎng)肌間差異表達(dá)基因的克隆鑒定及其特征分析[D]. 黃濤.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]應(yīng)用siRNA敲低TPM3基因表達(dá)后對(duì)大鼠胰腺癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響[D]. 馬翔.蚌埠醫(yī)學(xué)院 2013
[2]利用表達(dá)譜芯片技術(shù)篩選家兔肌肉發(fā)育相關(guān)基因[D]. 李挺.揚(yáng)州大學(xué) 2013
[3]組織間隙液中肝細(xì)胞癌診斷候選標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)[D]. 劉志磊.安徽醫(yī)科大學(xué) 2012
[4]Bcl-2抑制劑的合成與抗腫瘤細(xì)胞活性篩選及抗結(jié)核菌核苷類化合物的合成[D]. 李靜.蘇州大學(xué) 2010
[5]閹牛、公牛背最長(zhǎng)肌消減cDNA文庫的構(gòu)建和差異表達(dá)基因的篩選與鑒定[D]. 周正奎.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[6]姜曲海母豬初情期前卵巢和子宮腺體發(fā)育和激素水平的研究[D]. 劉春玲.揚(yáng)州大學(xué) 2004
本文編號(hào):2906159
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Bcl-2家族成員間異型和同型二聚體結(jié)合調(diào)控細(xì)胞凋亡的原理圖
雙峰駝TPM2與TPM3基因表達(dá)模式及其功能探究13圖2-1雙峰駝TPM2和TPM3基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖Fig2-1BactriancamelTPM2andTPM3genePCRamplificationproductagarosegelelectrophoresis2.2雙峰駝TPM2、TPM3基因核苷酸及氨基酸序列分析根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的ORFFinder軟件分析雙峰駝TPM2基因序列,開放閱讀框根據(jù)序列比對(duì)分析雙峰駝TPM2基因的序列,起始密碼子ATG位在109bp處,終止密碼子TAG位于963bp處。應(yīng)用ProtParam軟件預(yù)測(cè)TPM2理化性質(zhì),分子式為C1400H2325N397O498S115,分子量為33.03988KD,理論等電點(diǎn)為(pI)4.65。而TPM3基因序列比對(duì)結(jié)果顯示起始密碼子ATG位在146bp處,終止密碼子TAG位于521bp處,預(yù)測(cè)TPM3理化性質(zhì)結(jié)果顯示,分子式為C927H1588N294O311S5,分子量為21.98889KD,理論等電點(diǎn)為(pI)5.40,兩蛋白都屬于酸性蛋白。TMHMM2.0Server程序進(jìn)行跨膜區(qū)預(yù)測(cè),表明TPM2、TPM3蛋白都不存在跨膜區(qū)域。亞細(xì)胞定位分析雙峰駝TPM2、TPM3蛋白定位于細(xì)胞核,在線粒體、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞骨架、細(xì)胞膜以及胞質(zhì)中均有分布,主要在細(xì)胞核中大量分布。圖2-2雙峰駝TPM2二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig2-2PredictionofsecondarystructureofBactriancamelTPM2
雙峰駝TPM2與TPM3基因表達(dá)模式及其功能探究13圖2-1雙峰駝TPM2和TPM3基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖Fig2-1BactriancamelTPM2andTPM3genePCRamplificationproductagarosegelelectrophoresis2.2雙峰駝TPM2、TPM3基因核苷酸及氨基酸序列分析根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的ORFFinder軟件分析雙峰駝TPM2基因序列,開放閱讀框根據(jù)序列比對(duì)分析雙峰駝TPM2基因的序列,起始密碼子ATG位在109bp處,終止密碼子TAG位于963bp處。應(yīng)用ProtParam軟件預(yù)測(cè)TPM2理化性質(zhì),分子式為C1400H2325N397O498S115,分子量為33.03988KD,理論等電點(diǎn)為(pI)4.65。而TPM3基因序列比對(duì)結(jié)果顯示起始密碼子ATG位在146bp處,終止密碼子TAG位于521bp處,預(yù)測(cè)TPM3理化性質(zhì)結(jié)果顯示,分子式為C927H1588N294O311S5,分子量為21.98889KD,理論等電點(diǎn)為(pI)5.40,兩蛋白都屬于酸性蛋白。TMHMM2.0Server程序進(jìn)行跨膜區(qū)預(yù)測(cè),表明TPM2、TPM3蛋白都不存在跨膜區(qū)域。亞細(xì)胞定位分析雙峰駝TPM2、TPM3蛋白定位于細(xì)胞核,在線粒體、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞骨架、細(xì)胞膜以及胞質(zhì)中均有分布,主要在細(xì)胞核中大量分布。圖2-2雙峰駝TPM2二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig2-2PredictionofsecondarystructureofBactriancamelTPM2
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貴州黑山羊快肌肌鈣蛋白基因克隆和氨基酸序列分析[J]. 陳浩林,吳仙,朱冠群,毛鳳顯,陳燕,鄧大鵬. 貴州畜牧獸醫(yī). 2018(06)
[2]微小RNA-193a通過原肌球蛋白調(diào)控對(duì)人肺癌細(xì)胞株A549的侵襲和增殖的影響[J]. 張春敭,齊宇,吳愷,張巖,趙松. 中華實(shí)驗(yàn)外科雜志. 2018 (03)
[3]siRNATPM4對(duì)肺癌細(xì)胞增殖凋亡的影響[J]. 何建林,李玨,楊娜. 中國老年學(xué)雜志. 2017(20)
[4]原肌球蛋白3與雄激素受體配體結(jié)合域之間的相互作用[J]. 邱陽,陳曉雅,孫崢嶸,胡冰青,徐品一,崔磊,李玲. 中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(11)
[5]原肌球蛋白3在大腸癌中的表達(dá)和意義[J]. 印璞,李玲霞,高申,宋麗娜,李洪軍,何成彥. 中國實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2015(10)
[6]Bcl-2基因家族研究進(jìn)展[J]. 任玉偉,宿華威. 大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(02)
[7]Bcl-2家族的研究進(jìn)展[J]. 徐云峰,劉松堅(jiān). 中國療養(yǎng)醫(yī)學(xué). 2014(10)
[8]北京鴨和淮南麻鴨胸肌發(fā)育過程TPM1和TPM3基因的表達(dá)變化研究[J]. 葉保國,張小輝,徐鐵山. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2014(19)
[9]雄激素與女性生殖[J]. 崔毓桂,邵麗,千日成,劉嘉茵. 國際生殖健康/計(jì)劃生育雜志. 2014(05)
[10]阿拉善戈壁騸駝和沙漠騸駝體重、出肉量差異與其骨骼肌組織學(xué)性狀的研究[J]. 額爾敦木圖,李盈,劉圖雅,陳澤明,圖雅. 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(05)
博士論文
[1]Sonic hedgehog信號(hào)通路對(duì)正常角質(zhì)形成細(xì)胞增殖及凋亡的影響及其分子機(jī)制[D]. 劉海燕.第四軍醫(yī)大學(xué) 2015
[2]TPM4在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及其生物學(xué)意義[D]. 趙月鳴.吉林大學(xué) 2015
[3]狹鱈和牛肌肉組織提取物在牛肉嫩化中的作用機(jī)理研究[D]. 王蓉蓉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]GLP-1對(duì)骨骼肌肌球蛋白重鏈表達(dá)的影響及機(jī)制研究[D]. 王麗娜.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[5]雜種大白×梅山F1代與其母本梅山豬背最長(zhǎng)肌間差異表達(dá)基因的克隆鑒定及其特征分析[D]. 黃濤.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]應(yīng)用siRNA敲低TPM3基因表達(dá)后對(duì)大鼠胰腺癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響[D]. 馬翔.蚌埠醫(yī)學(xué)院 2013
[2]利用表達(dá)譜芯片技術(shù)篩選家兔肌肉發(fā)育相關(guān)基因[D]. 李挺.揚(yáng)州大學(xué) 2013
[3]組織間隙液中肝細(xì)胞癌診斷候選標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)[D]. 劉志磊.安徽醫(yī)科大學(xué) 2012
[4]Bcl-2抑制劑的合成與抗腫瘤細(xì)胞活性篩選及抗結(jié)核菌核苷類化合物的合成[D]. 李靜.蘇州大學(xué) 2010
[5]閹牛、公牛背最長(zhǎng)肌消減cDNA文庫的構(gòu)建和差異表達(dá)基因的篩選與鑒定[D]. 周正奎.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[6]姜曲海母豬初情期前卵巢和子宮腺體發(fā)育和激素水平的研究[D]. 劉春玲.揚(yáng)州大學(xué) 2004
本文編號(hào):2906159
本文鏈接:http://www.lk138.cn/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/2906159.html
最近更新
教材專著