癲癇是臨床上一種常見(jiàn)的慢性疾病,起病年齡跨閾大,以發(fā)作形式多樣、反復(fù)發(fā)作為特點(diǎn),對(duì)患者身體、精神、智力等均造成不同程度的影響,臨床上可表現(xiàn)為多種癲癇綜合征,也可演變?yōu)榘d癇持續(xù)狀態(tài),甚至引起癲癇性猝死。癲癇的致病機(jī)制復(fù)雜,至今仍未闡明,由相關(guān)基因突變引起的細(xì)胞功能障礙可能為其致病原因之一。此外,近年來(lái),組學(xué)技術(shù)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域被越來(lái)越廣泛地使用,作為其重要組成部分的蛋白質(zhì)組學(xué)的迅速發(fā)展為臨床上疾病標(biāo)志物的識(shí)別、疾病的早期診斷、靶向干預(yù)提供了有力的技術(shù)支持。但是目前對(duì)癲癇的蛋白質(zhì)組學(xué)研究多集中于動(dòng)物模型或人腦組織標(biāo)本,對(duì)于癲癇血漿蛋白質(zhì)組學(xué)的研究仍不多見(jiàn)。本研究一方面應(yīng)用定量蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)癲癇患者血漿差異蛋白進(jìn)行篩選,一方面通過(guò)體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)對(duì)癲癇致病基因CACNA1A擴(kuò)增突變引起細(xì)胞凋亡的機(jī)制進(jìn)行研究。本文共分6章,主要內(nèi)容在第3、4章,具體工作如下:⒈兒童Rolandic癲癇血漿TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析（第3章）目的:應(yīng)用TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)兒童Rolandic癲癇患者血漿中的差異表達(dá)蛋白進(jìn)行分析,同時(shí)聯(lián)合生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)差異蛋白進(jìn)行篩選、可視化,以尋求癲癇患者血漿中的可能...

【文章頁(yè)數(shù)】：138 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖2.1 TMT定量蛋白質(zhì)組原理及技術(shù)流程

TMT(TandemMassTags)技術(shù)是由美國(guó)Thermo公司研發(fā)的一種多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。此類技術(shù)最多可采用10種穩(wěn)定同位素標(biāo)簽,通過(guò)特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán),然后進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,可同時(shí)比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)含量。TMT技術(shù)是常用的差異蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)、....

圖3.1本章的總體流程圖

本章的主要內(nèi)容包括以下四個(gè)方面:⑴入組病人及對(duì)照組的臨床信息采集;⑵各組血漿標(biāo)本的收集;⑶蛋白的提取及鑒定;⑷差異表達(dá)蛋白的生物信息學(xué)分析。本章的總體流程圖,如圖3.1所示。3.2實(shí)驗(yàn)材料

圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認(rèn)

圖3.2中展示的是質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控檢測(cè)結(jié)果。首先,我們檢測(cè)了所有鑒定到的肽段的質(zhì)量偏移(masserror)(圖3.2A)。質(zhì)量誤差以0為中軸并且集中在低于10ppm的范圍內(nèi),說(shuō)明質(zhì)量誤差符合要求。其次,絕大部分的肽段長(zhǎng)度分布在8-20個(gè)氨基酸殘基之間(圖3.2B),符合胰酶消....

圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認(rèn)

圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認(rèn)3.3.11生物信息學(xué)分析

本文編號(hào)：4042609