發(fā)布時間：2018-05-07 01:36

  本文選題：人類免疫缺陷病毒 + 基因型��； 參考：《河北大學》2017年博士論文

【摘要】：河北省位于中國華北地區(qū),環(huán)繞京津,自古是京畿要地,是進入首都北京的門戶,南部與河南省相鄰。自1989年從國外務工回國人員當中確認首例艾滋病例以來,河北省經(jīng)過二十世紀九十年代中期在廊坊獻血人群和邢臺受血人群中爆發(fā)艾滋病疫情后,新診斷HIV/AIDS病例呈現(xiàn)逐年上升的趨勢,截止到2015年底全省累計報告HIV/AIDS患者7303例。27年來,HIV-1在河北省的流行傳播人群已經(jīng)發(fā)生改變,2005年以后,性接觸已經(jīng)替代血液傳播,成為河北省艾滋病疫情發(fā)展的最主要途徑。本研究首先對河北省HIV-1的總體流行形式進行了分析,并以2013年全年新診斷報告且未治療的HIV-1陽性病例為研究對象,實施了目前國內針對一個省份的最廣泛的HIV-1分子流行病學調查,分析了新診斷病例中HIV-1耐藥毒株及其流行。并且研究了16-25歲青少年人群和男男性接觸傳播人群(MSM)中HIV-1流行及傳遞性耐藥(TDR)突變,有利于預測和觀察河北省HIV-1的整體流行變化。研究成果主要包括以下幾個方面。1.河北省新診斷HIV-1陽性病例逐年上升,經(jīng)性行為傳播持續(xù)成為HIV擴散的主要途徑,特別是男男同性接觸感染快速上升,成為我省HIV疫情上升的主要途徑。2.基于HIV-1 gag全長基因-pol部分基因序列,2013年共發(fā)現(xiàn)有9種HIV-1基因型正在河北省內流行。前四個主要基因型是CRF01_AE(53.4%)、CRF07_BC(23.4%)、subtype B(15.9%)和新的獨特型重組體(URFs,4.9%)。一年內,以前河北省內未曾證實存在的三種基因型(subtype A1、CRF55_01B和CRF65_cpx)首次在MSM人群中被發(fā)現(xiàn)。發(fā)現(xiàn)所有9種基因型均已在性接觸傳播人群中傳播。30個URFs毒株通過6種基因重組模式形成,包括CRF01_AE/BC(40.0%)、CRF01_AE/B(23.3%)、B/C(16.7%)、CRF01_AE/C(13.3%)、CRF01_AE/B/A2(3.3%)和CRF01_AE/BC/A2(3.3%),并且證實在30個URFs中流行著2個潛在的流行性毒株(pCRF)。分子進化分析顯示河北省的流行毒株通過多種渠道從我國西南和南部省份、鄰省等經(jīng)多次傳入河北,特別是與北京、遼寧等鄰省以MSM為主的性傳播人群之間存在4個較大的CRF01_AE(2個)、subtype B(1個)和CRF07_BC(1個)流行簇,具有緊密的傳播關系。河北省內流行的所有9種HIV-1基因型已經(jīng)通過性接觸特別是MSM從其原有的高危人群傳入普通人群。3.在河北省5個MSM監(jiān)測點中共發(fā)現(xiàn)50例新發(fā)感染HIV-1陽性病例。通過對其HIV-1 gag(46條)、pol(48條)和env(45條)基因序列的綜合分析發(fā)現(xiàn)四種基因型,即CRF01_AE(56.0%)、CRF07_BC(30.0%)、subtype B(12.0%)和URFs(6.0%)。URFs的3種重組模式被確認,即CRF01_AE/BC、CRF01_AE/B和CRF01_AE/C。Subtype B和CRF01_AE毒株與鄰省傳播關系緊密。監(jiān)測點新發(fā)感染MSM人群中HIV-1主要流行趨勢與河北省整體流行趨勢基本一致,因此通過MSM監(jiān)測點可以觀察河北省整體的HIV-1流行趨勢。4.通過分析HIV-1 pol基因序列,2013年新診斷未治療病例中總的耐藥突變發(fā)生率為16.2%(109/672)。蛋白酶抑制劑(PIs)耐藥突變率為6.3%(42/672),核苷類逆轉錄酶抑制劑(NRTIs)突變率為2.4%(16/672),非核苷類逆轉酶抑制劑(NNRTIs)突變率為8.6%(58/672)。其中,兩個不同基因編碼區(qū)的雙重突變率為0.7%(5/672)、三個基因編碼區(qū)的多重突變率0.1%(1/672)和單基因編碼區(qū)的多位點突變0.4%(3/672)。這種復雜的突變模式導致當前史坦福數(shù)據(jù)庫所列藥物中除了3TC、ABC、DDI、FTC和TDF五種NRTIs外,其他14種藥物都產(chǎn)生了不同程度的耐藥性,特別是導致所有的PIs和NNRTIs藥物藥效不同程度地降低。16-25歲青少年和MSM監(jiān)測點新發(fā)感染病例中傳遞性耐藥(TDR)發(fā)生率分別為6.6%和2.1%。分子進化分析發(fā)現(xiàn)HIV-1耐藥毒株分布在不同的流行簇中,尤其是與鄰省以MSM為主的大流行簇為HIV-1耐藥毒株的傳播創(chuàng)造了條件。
[Abstract]:Hebei province is located in North China, circling Beijing and Tianjin, is a Gyeonggi city from ancient times, is the gateway to the capital of Beijing, and the South and Henan province. Since 1989, since the first AIDS case was confirmed from the returnees from foreign workers abroad, Hebei province broke out in the Langfang blood donation crowd and the Xingtai blood crowd in the middle of 1990s. After the disease epidemic situation, the newly diagnosed HIV/AIDS cases showed a trend of increasing year by year. By the end of 2015, 7303 cases of HIV/AIDS patients were reported in the province for.27 years. The population of HIV-1 in Hebei province has changed. After 2005, sexual contact has replaced blood transmission, which has become the most important way for the development of AIDS epidemic in Hebei province. First, the general epidemic form of HIV-1 in Hebei province was analyzed. With the new diagnosis report of 2013 and the untreated HIV-1 positive cases, the most extensive HIV-1 molecular epidemiological survey in one province was carried out in China, and the HIV-1 resistant strain and its epidemic in the newly diagnosed cases were analyzed. The HIV-1 epidemic and transmissibility resistance (TDR) mutation in the 16-25 year old and male male contact population (MSM) were investigated, which was beneficial to the prediction and observation of the overall epidemic changes of HIV-1 in Hebei province. The research results mainly included the following aspects:.1. in Hebei Province, the new diagnostic HIV-1 positive cases increased year by year, and the sexual behavior spread continued to become a HIV expansion. The main approach, especially male male sex contact infection, has become the main route of the HIV epidemic in our province,.2. based on the HIV-1 gag full length gene -pol partial gene sequence. In 2013, 9 HIV-1 genotypes were found to be prevalent in Hebei province. The first four major genotypes were CRF01_AE (53.4%), CRF07_BC (23.4%), subtype B (15.9%). And a new idiotypic recombinant (URFs, 4.9%). Within a year, three genotypes (subtype A1, CRF55_01B and CRF65_cpx), which were not confirmed in previous Hebei Province, were discovered for the first time in the MSM population. All 9 genotypes have been transmitted through 6 gene recombination patterns, including CRF01_AE/B, of.30 URFs strains in sexual contact spread population. C (40%), CRF01_AE/B (23.3%), B/C (16.7%), CRF01_AE/C (13.3%), CRF01_AE/B/A2 (3.3%) and CRF01_AE/BC/A2 (3.3%), and confirmed that 2 potential pandemic strains (pCRF) were popular in 30 URFs. Molecular evolutionary analysis showed that the epidemic strains of Hebei province were introduced into Hebei many times through many channels from southwest and southern provinces of China, and other provinces. In particular, there are 4 larger CRF01_AE (2), subtype B (1) and CRF07_BC (1) cluster of sexually transmitted populations in the neighbouring provinces of Beijing and other provinces, which have close communication relations. All 9 HIV-1 genotypes popular in Hebei province have passed through sexual contact, especially MSM from their original high risk population, into the ordinary population.3 50 newly infected HIV-1 positive cases were found in 5 MSM monitoring sites in Hebei province. Through comprehensive analysis of its HIV-1 gag (46), pol (48) and env (45) gene sequences, four types of genotypes, namely, CRF01_AE (56%), CRF07_BC (30%), subtype B (12%) and URFs (6%).URFs, were identified. The relationship between B and CRF01_AE/C.Subtype B and CRF01_AE strains was closely related to the spread of neighboring provinces. The main trend of HIV-1 epidemic in the new infection MSM population of the monitoring point was basically the same as that of the whole epidemic trend in Hebei province. Therefore, the HIV-1 epidemic trend in Hebei province was observed through MSM monitoring points,.4. through the analysis of HIV-1 pol gene sequence, the new diagnosis was not treated in 2013. The total resistance mutation rate was 16.2% (109/672). The mutation rate of the protease inhibitor (PIs) was 6.3% (42/672), the nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NRTIs) mutation rate was 2.4% (16/672), and the non nucleoside reverse enzyme inhibitor (NNRTIs) mutation rate was 8.6% (58/672). The double mutation rate of two different gene coding regions was 0.7% (5/6). 72) the multiple mutation rate 0.1% (1/672) and the multiple point mutation 0.4% (3/672) of the single gene coding region of the three gene coding regions. This complex mutation pattern leads to the other 14 drugs, in addition to five NRTIs, including 3TC, ABC, DDI, FTC and TDF in the current statf database. The drug efficacy of S and NNRTIs reduced the incidence of transmissibility resistance (TDR) in the new infection cases of.16-25 years old and MSM monitoring sites, respectively, and the incidence of TDR was 6.6% and 2.1%. molecular evolution analysis found that HIV-1 resistant strains were distributed in different epidemic clusters, especially the spread of MSM dominated pandemic clusters for HIV-1 resistant strains. The condition.

【學位授予單位】：河北大學
【學位級別】：博士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：R512.91

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本文編號：1854837