發(fā)布時(shí)間：2020-12-09 07:54

　　倍蚜屬半翅目Hemiptera蚜科Aphididae綿蚜亞科Eriosomatinae五節(jié)根蚜族Fordini,是典型的轉(zhuǎn)主寄生性昆蟲,對第一寄主植物有較強(qiáng)的專化,僅寄生在漆樹科Anacardiaceae鹽膚木屬Rhus的五種植物即分布在東亞的鹽膚木、紅麩楊和青麩楊及北美的Rhus typhina和Rhus glabra,二者之間已經(jīng)形成穩(wěn)定的進(jìn)化關(guān)系。倍蚜在第一植物上寄生形成的蟲癭特稱為五倍子,富含單寧,廣泛用于醫(yī)藥、食品和輕工等領(lǐng)域,具有極高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。本文采用二代高通量測序技術(shù)對倍蚜第一寄主植物及其姊妹種黃連木的葉綠體基因組（cpDNA）進(jìn)行測序、拼接組裝和基因注釋,分析基因組特征;從GenBank下載漆樹科物種cpDNA序列,用生物信息學(xué)分析手段進(jìn)行基因組比較,探討cpDNA在不同物種之間的變異和進(jìn)化規(guī)律,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,分析漆樹科不同物種的近緣關(guān)系;與寄生倍蚜的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行相關(guān)性檢驗(yàn),分析二者之間的協(xié)同進(jìn)化關(guān)系。主要研究結(jié)果如下:1.獲得倍蚜寄主鹽膚木屬5個(gè)種和姊妹屬種黃連木cpDNA全序列,鹽膚木屬cpDNA長度介于159,187-159,984 bp之間,其中光滑漆... 

【文章來源】：山西大學(xué)山西省

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

鹽膚木屬序列共線性分析

第三章倍蚜寄主鹽膚木屬葉綠體基因組特征21圖3.2鹽膚木屬葉綠體基因組邊界區(qū)域信息Fig3.2ThechloroplastgenomeofIRregioninformationfromRhus3.5鹽膚木屬序列共線性分析為明確倍蚜寄主鹽膚木屬各物種基因排列順序是否一致，判斷其中是否存在基因重排與倒位現(xiàn)象，利用Geneious中Mauve將鹽膚木屬葉綠體基因組全序列進(jìn)行共線性分析，結(jié)果如圖3.3。通過對倍蚜第一寄主鹽膚木屬進(jìn)行共線性分析，與本研究中姊妹種黃連木葉綠體基因組全序列進(jìn)行Mauvealighment，得到基因排列順序及共線性結(jié)果如圖3.3。鹽膚木屬葉綠體基因組基因排列順序一致，未發(fā)生大面積基因重排與基因缺失現(xiàn)象，呈現(xiàn)共線性結(jié)構(gòu)。圖3.3鹽膚木屬序列共線性分析Fig3.3SyntenyanalysesofchloroplastgenomesfromRhus

倍蚜寄主鹽膚木屬葉綠體全基因組及進(jìn)化意義26基因位于LSC區(qū)域，無明顯的擴(kuò)張與收縮。檳郎青屬IR區(qū)長度與漆樹科其他屬種IR區(qū)長度差異較大，根據(jù)其邊界分析主要由IR區(qū)擴(kuò)張引起，其IR區(qū)長度較長。在LSC-IRa邊界上漆樹科各物種邊界均位于trn-H基因與rpl2基因之間，除鹽膚木屬R.chinensis和黃連木屬P.chinensis、P.vera、P.weinmaniifolia的trn-H基因與邊界間隔極小分別為2bp、7bp、7bp、1bp外，其余物種trn-H基因與邊界間隔均在25-60bp之間。在IRa-SSC邊界上，所有物種均位于ycf1基因上，并無明顯的擴(kuò)張與收縮出現(xiàn)。圖4.1鹽膚木屬與漆樹科其他植物IR區(qū)邊界比較Fig4.1ComparisonoftheBordersofRhusandotherspeciesofAnacardiaceaeintheIRArea


本文編號：2906549