本文從GEO GDS2678構建的441個在人類左腦相比于黑猩猩左腦顯著性高表達的基因(SAM算法(倍數(shù)變化≥2))組成的總CC數(shù)據(jù)庫之中,原創(chuàng)構建了對應的激活或者抑制分子的CC數(shù)據(jù)庫,并進一步分別構建USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2的激活或抑制兩兩正相關分子庫。根據(jù)GRNInfer并整合DAVID和MAS 3.0構建上述分子的人左腦直接激活或抑制的上下游反饋分子和知識網(wǎng)絡。結果顯示USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2來自于人左腦并與認知相關,均含外泌體。其中USP14下游激活網(wǎng)絡包括細胞質、線粒體、細胞基質、質膜、細胞質核周區(qū)、膜、溶酶體膜、質膜整體成分、膜的整體成分和溶酶體,以此提出并驗證USP14網(wǎng)絡通過除核外的病毒受體激活基于外泌體的認知;AK3P1下游激活網(wǎng)絡包含細胞質、細胞核、細胞基質、線粒體、核質和膜,以此提出并驗證AK3P1網(wǎng)絡通過蛋白質、ATP和poly(A)RNA結合激活基于外泌體的認知;BAG5上游激活網(wǎng)絡則含細胞核、核質、細胞質、細胞質基質、膜,從而提出并驗證基于外泌體的認知通過蛋白質和...

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－１通過ＧＲＮＩｎｆｅｒ構建基于計算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡

溶酶體相關膜蛋白?２?（ＬＡＭＰ２），?Ｃ１?型?Ｎｉｅｍａｍｉ－Ｐｉｃｋ?�。ǎ危校茫保�，?ｐｌｅｃｋｓｔｒｉｎ?同??源性如結構域家族Ｂ成員１?（ＰＨＬＤＢ１）以及跨膜蛋白６３Ａ?（ＴＭＥＭ６３Ａ）。具體??分子網(wǎng)絡見圖２－１。??｛?ＥＭＰＰ２Ｊ?］?；?（ＮＨＢ８?＊｝?....

圖３－１通過ＧＲＮＩｎｆｅｒ構建基于計算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡

（ＲＦＫ），富含絲氨酸／精氨酸的剪接因子７（ＳＲＳＦ７），ＳＭＧ１磷脂酰肌醇３－激酶??相關激酶（ＳＭＧ１），血影蛋白紅細胞（ＳＰＴＢ）以及電壓依賴性陰離子通道??２?（?ＶＤＡＣ２）等，具體網(wǎng)絡見

圖４－１通過ＧＲＮＩｎｆｅｒ構建基于計算的似Ｇ５人左腦上游直接激活分子網(wǎng)絡

成員２?（ＰＤＩＡ２），蛋白磷酸酶１調節(jié)亞基１３Ｂ?（ＰＰＰ１Ｒ１３Ｂ），視網(wǎng)膜母細胞瘤結??合蛋白６ＣＲＢＢＰ６），核糖核酸酶Ｐ／ＭＲＰ?１４ｋＤａ亞基（ＲＰＰ１４），染色體５（ＳＭＣ５）??以及鋅指和含有４３的ＢＴＢ結構域（ＺＢＴＢ４３）的結構維持，具體網(wǎng)絡見圖４－１。??圖....

圖６－ｌ通過ＧＲＮＩｎｆｅｒ構建基于計算的』ｉ？仲人左腦下游直接抑制分子網(wǎng)絡

篩選ＡＲＦ６ＣＣ彡０．２５的分子，從總Ｐｅａｒｓｏｎ相關系數(shù)（ＣＣ）數(shù)據(jù)庫之中，??通過ＳＰＳＳ計算ＧＥＯ?ＧＤＳ２６７８數(shù)據(jù)庫，篩選４４１個在人類左腦相比于黑猩猩左??腦中顯著性高表達的基因（ＳＡＭ算法（倍數(shù)變化彡２）），并構建其抑制分子的??ＣＣ數(shù)據(jù)庫；緊接著，進一步分別計算....

本文編號：3996022