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大數(shù)據(jù)下激活和抑制人左腦基于不同物質(zhì)結(jié)合的外泌體認(rèn)知的新網(wǎng)絡(luò)

發(fā)布時(shí)間:2024-06-27 22:27
  本文從GEO GDS2678構(gòu)建的441個(gè)在人類(lèi)左腦相比于黑猩猩左腦顯著性高表達(dá)的基因(SAM算法(倍數(shù)變化≥2))組成的總CC數(shù)據(jù)庫(kù)之中,原創(chuàng)構(gòu)建了對(duì)應(yīng)的激活或者抑制分子的CC數(shù)據(jù)庫(kù),并進(jìn)一步分別構(gòu)建USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2的激活或抑制兩兩正相關(guān)分子庫(kù)。根據(jù)GRNInfer并整合DAVID和MAS 3.0構(gòu)建上述分子的人左腦直接激活或抑制的上下游反饋分子和知識(shí)網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果顯示USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2來(lái)自于人左腦并與認(rèn)知相關(guān),均含外泌體。其中USP14下游激活網(wǎng)絡(luò)包括細(xì)胞質(zhì)、線粒體、細(xì)胞基質(zhì)、質(zhì)膜、細(xì)胞質(zhì)核周區(qū)、膜、溶酶體膜、質(zhì)膜整體成分、膜的整體成分和溶酶體,以此提出并驗(yàn)證USP14網(wǎng)絡(luò)通過(guò)除核外的病毒受體激活基于外泌體的認(rèn)知;AK3P1下游激活網(wǎng)絡(luò)包含細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核、細(xì)胞基質(zhì)、線粒體、核質(zhì)和膜,以此提出并驗(yàn)證AK3P1網(wǎng)絡(luò)通過(guò)蛋白質(zhì)、ATP和poly(A)RNA結(jié)合激活基于外泌體的認(rèn)知;BAG5上游激活網(wǎng)絡(luò)則含細(xì)胞核、核質(zhì)、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)、膜,從而提出并驗(yàn)證基于外泌體的認(rèn)知通過(guò)蛋白質(zhì)和...

【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1通過(guò)GRNInfer構(gòu)建基于計(jì)算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡(luò)

圖2-1通過(guò)GRNInfer構(gòu)建基于計(jì)算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡(luò)

溶酶體相關(guān)膜蛋白?2?(LAMP2),?C1?型?Niemami-Pick?病(NPC1),?pleckstrin?同??源性如結(jié)構(gòu)域家族B成員1?(PHLDB1)以及跨膜蛋白63A?(TMEM63A)。具體??分子網(wǎng)絡(luò)見(jiàn)圖2-1。??{?EMPP2J?]?;?(NHB8?*}?....


圖3-1通過(guò)GRNInfer構(gòu)建基于計(jì)算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡(luò)

圖3-1通過(guò)GRNInfer構(gòu)建基于計(jì)算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡(luò)

(RFK),富含絲氨酸/精氨酸的剪接因子7(SRSF7),SMG1磷脂酰肌醇3-激酶??相關(guān)激酶(SMG1),血影蛋白紅細(xì)胞(SPTB)以及電壓依賴性陰離子通道??2?(?VDAC2)等,具體網(wǎng)絡(luò)見(jiàn)


圖4-1通過(guò)GRNInfer構(gòu)建基于計(jì)算的似G5人左腦上游直接激活分子網(wǎng)絡(luò)

圖4-1通過(guò)GRNInfer構(gòu)建基于計(jì)算的似G5人左腦上游直接激活分子網(wǎng)絡(luò)

成員2?(PDIA2),蛋白磷酸酶1調(diào)節(jié)亞基13B?(PPP1R13B),視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤結(jié)??合蛋白6CRBBP6),核糖核酸酶P/MRP?14kDa亞基(RPP14),染色體5(SMC5)??以及鋅指和含有43的BTB結(jié)構(gòu)域(ZBTB43)的結(jié)構(gòu)維持,具體網(wǎng)絡(luò)見(jiàn)圖4-1。??圖....


圖6-l通過(guò)GRNInfer構(gòu)建基于計(jì)算的』i?仲人左腦下游直接抑制分子網(wǎng)絡(luò)

圖6-l通過(guò)GRNInfer構(gòu)建基于計(jì)算的』i?仲人左腦下游直接抑制分子網(wǎng)絡(luò)

篩選ARF6CC彡0.25的分子,從總Pearson相關(guān)系數(shù)(CC)數(shù)據(jù)庫(kù)之中,??通過(guò)SPSS計(jì)算GEO?GDS2678數(shù)據(jù)庫(kù),篩選441個(gè)在人類(lèi)左腦相比于黑猩猩左??腦中顯著性高表達(dá)的基因(SAM算法(倍數(shù)變化彡2)),并構(gòu)建其抑制分子的??CC數(shù)據(jù)庫(kù);緊接著,進(jìn)一步分別計(jì)算....



本文編號(hào):3996022

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