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大數(shù)據(jù)下激活和抑制人左腦基于不同物質結合的外泌體認知的新網(wǎng)絡

發(fā)布時間:2024-06-27 22:27
  本文從GEO GDS2678構建的441個在人類左腦相比于黑猩猩左腦顯著性高表達的基因(SAM算法(倍數(shù)變化≥2))組成的總CC數(shù)據(jù)庫之中,原創(chuàng)構建了對應的激活或者抑制分子的CC數(shù)據(jù)庫,并進一步分別構建USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2的激活或抑制兩兩正相關分子庫。根據(jù)GRNInfer并整合DAVID和MAS 3.0構建上述分子的人左腦直接激活或抑制的上下游反饋分子和知識網(wǎng)絡。結果顯示USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2來自于人左腦并與認知相關,均含外泌體。其中USP14下游激活網(wǎng)絡包括細胞質、線粒體、細胞基質、質膜、細胞質核周區(qū)、膜、溶酶體膜、質膜整體成分、膜的整體成分和溶酶體,以此提出并驗證USP14網(wǎng)絡通過除核外的病毒受體激活基于外泌體的認知;AK3P1下游激活網(wǎng)絡包含細胞質、細胞核、細胞基質、線粒體、核質和膜,以此提出并驗證AK3P1網(wǎng)絡通過蛋白質、ATP和poly(A)RNA結合激活基于外泌體的認知;BAG5上游激活網(wǎng)絡則含細胞核、核質、細胞質、細胞質基質、膜,從而提出并驗證基于外泌體的認知通過蛋白質和...

【文章頁數(shù)】:62 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1通過GRNInfer構建基于計算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡

圖2-1通過GRNInfer構建基于計算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡

溶酶體相關膜蛋白?2?(LAMP2),?C1?型?Niemami-Pick?。ǎ危校茫保,?pleckstrin?同??源性如結構域家族B成員1?(PHLDB1)以及跨膜蛋白63A?(TMEM63A)。具體??分子網(wǎng)絡見圖2-1。??{?EMPP2J?]?;?(NHB8?*}?....


圖3-1通過GRNInfer構建基于計算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡

圖3-1通過GRNInfer構建基于計算的人左腦下游直接激活分子網(wǎng)絡

(RFK),富含絲氨酸/精氨酸的剪接因子7(SRSF7),SMG1磷脂酰肌醇3-激酶??相關激酶(SMG1),血影蛋白紅細胞(SPTB)以及電壓依賴性陰離子通道??2?(?VDAC2)等,具體網(wǎng)絡見


圖4-1通過GRNInfer構建基于計算的似G5人左腦上游直接激活分子網(wǎng)絡

圖4-1通過GRNInfer構建基于計算的似G5人左腦上游直接激活分子網(wǎng)絡

成員2?(PDIA2),蛋白磷酸酶1調節(jié)亞基13B?(PPP1R13B),視網(wǎng)膜母細胞瘤結??合蛋白6CRBBP6),核糖核酸酶P/MRP?14kDa亞基(RPP14),染色體5(SMC5)??以及鋅指和含有43的BTB結構域(ZBTB43)的結構維持,具體網(wǎng)絡見圖4-1。??圖....


圖6-l通過GRNInfer構建基于計算的』i?仲人左腦下游直接抑制分子網(wǎng)絡

圖6-l通過GRNInfer構建基于計算的』i?仲人左腦下游直接抑制分子網(wǎng)絡

篩選ARF6CC彡0.25的分子,從總Pearson相關系數(shù)(CC)數(shù)據(jù)庫之中,??通過SPSS計算GEO?GDS2678數(shù)據(jù)庫,篩選441個在人類左腦相比于黑猩猩左??腦中顯著性高表達的基因(SAM算法(倍數(shù)變化彡2)),并構建其抑制分子的??CC數(shù)據(jù)庫;緊接著,進一步分別計算....



本文編號:3996022

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