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PIK3CA基因在漿液性卵巢癌中的拷貝數(shù)擴增分析及其機制探討

發(fā)布時間:2018-10-29 08:28
【摘要】:目的:研究PIK3CA基因在漿液性卵巢癌中的拷貝數(shù)變異(CNV)情況,探討PIK3CA參與卵巢癌發(fā)生發(fā)展的可能機制及其預(yù)后。方法:從癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫收集漿液性卵巢癌數(shù)據(jù)(591例患者/603例樣本)及其臨床資料,包括CNV、m RNA表達和蛋白表達數(shù)據(jù)。分析PIK3CA基因拷貝數(shù)變異與基因表達和預(yù)后的相關(guān)及其共表達蛋白。對PIK3CA和其相關(guān)共表達蛋白進行基因集富集分析。結(jié)果:PIK3CA基因在27.7%的卵巢癌患者中發(fā)生拷貝數(shù)擴增,且與其m RNA表達和蛋白表達呈顯著正相關(guān),預(yù)后顯著較好(OS:P=0.0469;PFS:P=0.0241)。PIK3CA基因拷貝數(shù)擴增和表達升高富集了胰島素信號通路、Erb B通路、m TOR信號通路等基因集。結(jié)論:PIK3CA基因拷貝數(shù)擴增在高級別漿液性卵巢癌中是一種預(yù)后較好因素,通過不同信號通路在腫瘤進展中發(fā)揮重要作用,可作為判斷預(yù)后的標記物。
[Abstract]:Objective: to study the copy number variation (CNV) of PIK3CA gene in serous ovarian cancer and to explore the possible mechanism and prognosis of PIK3CA involved in the development of ovarian cancer. Methods: the data of serous ovarian cancer (591 patients / 603 samples) and their clinical data including CNV,m RNA expression and protein expression were collected from the cancer genome map (TCGA) database. To analyze the correlation between PIK3CA gene copy number variation and gene expression and prognosis and coexpression protein. PIK3CA and its associated coexpression proteins were analyzed by gene set enrichment. Results: the copy number amplification of PIK3CA gene was found in 27.7% of ovarian cancer patients, and was positively correlated with the expression of m RNA and protein, and the prognosis was significantly better (OS:P=0.0469;). PIK3CA gene copy number amplification and expression increase enriched insulin signaling pathway, Erb B pathway, m TOR signal pathway and other gene sets. Conclusion: copy number amplification of PIK3CA gene is a good prognostic factor in high grade serous ovarian cancer. It plays an important role in tumor progression through different signal pathways and can be used as a marker to judge prognosis.
【作者單位】: 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(No:81502254)
【分類號】:R737.31

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本文編號:2297160


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