高通量測序技術(shù)分析急性髓系白血病血漿外泌體微RNA表達(dá)譜差異
[Abstract]:Acute myeloid leukemia (acute myeloid leukemia,AML) is a malignant clonal disease of hematopoietic stem cells. A large number of studies have shown that extracellular microRNA (miRNA or miR is an ideal molecular marker which is enriched in exocrine (exosome) and is protected by its surface membrane. At present, tumor specific exocrine miRNA (exosomal miRNA). Has been detected in various solid tumors. However, no additional miRNA was reported in patients with AML. The aim of this study was to investigate the difference of miRNA expression profile and new miRNA sequence in plasma exocrine of acute myeloid leukemia (AML). Plasma exocrine miRNAs was sequenced by solexa high-throughput sequencing technique in 7 AML patients (AML group) and 7 healthy controls (control group). New miRNAs analysis was performed with Mireap predictive software. 211 known differentially expressed miRNAs and 2 new miRNAs, selected 4 differentially expressed miRNAs:miR-155-5p,miR-335-5p,miR-451a and xxx-m0038-5p (new miRNA),) in plasma exocrine samples of two groups (23 cases each) were obtained by edger differential analysis software screening of differential miRNA,. Real-time fluorescence quantitative PCR (qRT-PCR) was performed and the results were in good agreement with the sequencing results. Target gene prediction and GO (Gene Ontology) and signal pathway enrichment analysis of differentially expressed exocrine miRNA showed that most of the biological functions of target gene aggregation were involved in the regulation of biological progression. The target genes are mainly concentrated in Fox OMP-MAPK, Hippo signaling pathway and HTLV-I infection. The results showed that there was a differential expression of miRNA in plasma between patients with AML and healthy controls. The specificity of differentially expressed miRNA is very high, which is of great significance for further elucidating the molecular mechanism of the occurrence and development of AML leukemia, developing new noninvasive diagnostic methods, new diagnostic markers and effective methods for the treatment of AML.
【作者單位】: 湖南師范大學(xué)醫(yī)學(xué)院人體解剖與組織胚胎學(xué)教研室;湖南省長沙市中心醫(yī)院;中南大學(xué)湘雅醫(yī)院血液科;中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院老年病學(xué);
【基金】:湖南省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.2015JJ4034)資助~~
【分類號】:R733.71
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本文編號:2206950
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