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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子生物學(xué)探討溫下方治療肺癌的作用機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2020-11-19 18:15
   【目的】應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法預(yù)測溫下方(由人參、大黃、附子、當(dāng)歸組成)治療肺癌疾病的作用靶點(diǎn)和信號通路,并通過細(xì)胞實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其預(yù)測的準(zhǔn)確性!痉椒ā克阉鱐CMSP數(shù)據(jù)庫獲得溫下方組成藥物的有效活性成分,使用Cytoscape軟件建立活性成分-作用靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),使用String數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件繪制蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),并通過DAVID數(shù)據(jù)庫對靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體論(GO)注釋及京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析。制備不同濃度溫下方含藥血清作用A549細(xì)胞,采用四甲基偶氮唑鹽(MTT)方法測定細(xì)胞增殖情況,采用定量聚合酶鏈反應(yīng)(qPCR)技術(shù)測定蘇氨酸激酶(AKT)的mRNA表達(dá)水平,驗(yàn)證預(yù)測結(jié)果的可靠性!窘Y(jié)果】溫下方作用于肺癌的有效活性成分有32個(gè),相關(guān)靶點(diǎn)112個(gè),在靶點(diǎn)間的蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)中,分析出溫下方中有39個(gè)重要靶點(diǎn)與治療肺癌有關(guān)。驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)可知,溫下方含藥血清能濃度依賴性抑制A549細(xì)胞的增殖,下調(diào)AKT mRNA水平!窘Y(jié)論】溫下方治療肺癌具有多成分-多靶點(diǎn)-多途徑的作用特點(diǎn),可為深入研究其機(jī)制指明方向。
【部分圖文】:

成分,靶點(diǎn),肺癌,疾病


從TTD數(shù)據(jù)庫里收集到有關(guān)肺癌的疾病靶點(diǎn)一共有77個(gè):TPBG、MMP2、MMP9、ALK、PDGFRA、BCL2、BIRC5、FGFR1、PDGFRB、BRAF、CEACAM5、CDK1、CDK7、CDK9、CDK4、COX17、DRD2、TOP1、MAP2K1、HSP90B1、EGFL7、EGFR、FANCF、HPSE、HGF、HDAC1、IGF1R、ITGB1、IL2、IL4R、MMP1、KIF11、KDM1A、CSF1、MMP12、MARK3、MMP7、MAGEA3、MAGEC1、MAGEC2、MAD1L1、BAD、CLU、EIF4E、HSPB1、PRKCA、OPRM1、NTSR1、NFE2L2、CTAG1A、P2RY2、PDCD1、PPARG、PECAM1、FNTB、FNTA、ABL1、RET、AKT1、ERBB2、ERBB3、CHEK1、PLK1、ALB、SSTR2、SKP2、S1PR1、TYMS、TLR9、TUBB3、PRAME、TNFRSF10A、TNFRSF10B、TUSC2、MDM2、FLT1、KDR。圖2 溫下方成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)

靶點(diǎn),成分,關(guān)系網(wǎng)絡(luò),有效成分


溫下方成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)

肺癌,相互作用,蛋白質(zhì),靶點(diǎn)


通過Cytoscape軟件,獲得成分靶點(diǎn)-疾病靶點(diǎn)的蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。見圖3。圖3共涉及170個(gè)節(jié)點(diǎn),1 145條邊。圓圈大小和顏色深淺代表靶點(diǎn)蛋白相互作用的密切程度,橘紅色圓圈節(jié)點(diǎn)代表符合篩選條件的39個(gè)重要靶點(diǎn)。邊代表靶點(diǎn)間的相互關(guān)聯(lián),節(jié)點(diǎn)大小代表Degree值的大小,節(jié)點(diǎn)越大,對應(yīng)的Degree值越大。1.2.4 39個(gè)重要靶點(diǎn)的GO注釋與KEGG通路分析
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