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基于泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)及腸道菌群的滋補脾陰方藥對情志應(yīng)激所致糖尿病認知功能障礙的研究

發(fā)布時間:2020-07-03 15:27
【摘要】:研究表明在概念、臨床范疇、發(fā)病條件等方面,情志與心理應(yīng)激有著很多的相似性,情志致病學(xué)說與心理應(yīng)激反應(yīng)有著本然的一致性。隨著2型糖尿病(Type 2 Diabetes Mellitus,T2DM)發(fā)病率在全國乃至全球范圍內(nèi)的逐年升高,心理應(yīng)激與糖尿病發(fā)病的相關(guān)性越來越引起人們的關(guān)注。心理應(yīng)激能提高糖耐量減低者發(fā)展成糖尿病的機率。糖尿病可引起大腦認知功能紊亂,表現(xiàn)出輕、中度的認知障礙以及學(xué)習(xí)記憶能力的下降,這種疾病即為糖尿病認知功能障礙(Diabetes-Associated Cognitive Decline,DACD),嚴重者可發(fā)展為阿爾茨海默病(Alzheimer's disease,AD)。目前尚未發(fā)現(xiàn)DACD的特征性神經(jīng)病理改變,多項研究表明其發(fā)病機制和病理學(xué)改變與AD相似。研究發(fā)現(xiàn)AD患者和動物腦內(nèi)均發(fā)生蛋白質(zhì)泛素化,依賴于E3連接酶,慢性心理應(yīng)激通過增加泛素化及降解,能夠引起認知功能損傷。提示情志所致的DACD可能與腦內(nèi)蛋白質(zhì)泛素化有關(guān)。此外,研究還發(fā)現(xiàn)慢性心理應(yīng)激可使腸道內(nèi)致病菌增加,有益菌減少等。腸道菌群的失調(diào)可導(dǎo)致T2DM及其并發(fā)癥認知功能障礙的發(fā)生發(fā)展。蛋白質(zhì)組學(xué)能夠在整體水平上對基因組表達的全部蛋白質(zhì)進行大規(guī)模研究,進行蛋白質(zhì)組學(xué)的研究可加快對疾病病理改變的認識,F(xiàn)在對于DACD的蛋白質(zhì)組學(xué)研究還很淺,對其泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)方面的分析更少,而多個針對AD的研究已經(jīng)證實了蛋白質(zhì)泛素化在AD等神經(jīng)退行性疾病中具有重要作用。因此,DACD腦內(nèi)泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究將有助于理解其發(fā)病機理。平衡的腸道菌群不僅在宿主的新陳代謝中發(fā)揮關(guān)鍵作用,而且還可以形成一個天然屏障,抵御外來病原菌的侵襲。一旦腸道菌群的平衡被打破,則宿主表現(xiàn)為疾病易感性。人體許多疾病如T2DM的發(fā)生發(fā)展都與腸道菌群的失調(diào)有關(guān)系,腸道菌群在T2DM的發(fā)生與轉(zhuǎn)歸中扮演著重要角色。近年來大量研究還發(fā)現(xiàn)腸道菌群的改變與認知行為之間存在明顯的相關(guān)性。腸道菌群的改變會影響宿主的行為,比如認知功能損傷、抑郁和焦慮等。目前仍然沒有公認的治療DACD的有效措施。中醫(yī)學(xué)認為DACD屬于“消渴”合并“健忘”或“呆癥”。在多年臨床經(jīng)驗的基礎(chǔ)上,戰(zhàn)麗彬教授依據(jù)清代·吳澄《不居集》中記載的資成湯加味而成滋補脾陰方藥(ZiBu PiYin Recipe,ZBPYR)。該方不僅能改善臨床患者健忘、呆癥等認知障礙的癥狀,而且還能改善脾陰虛癡呆大鼠、老齡大鼠、自發(fā)性糖尿病肥胖大鼠(Zucker Diabetic Fatty Rats,ZDF)大鼠、高脂喂養(yǎng)聯(lián)合鏈脲佐菌素(Streptozotocin,STZ)注射誘發(fā)的糖尿病大鼠以及db/db小鼠的認知功能。綜上,本研究一是觀察ZDF大鼠學(xué)習(xí)記憶能力的行為學(xué)表現(xiàn)及情志應(yīng)激是否促進了DACD的發(fā)生發(fā)展;二是基于非標記定量Label-free聯(lián)合液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)的泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)以及生物信息學(xué)分析找尋腦內(nèi)和情志應(yīng)激所致DACD發(fā)病、ZBPYR干預(yù)作用緊密相關(guān)的泛素化蛋白質(zhì)和生物學(xué)通路,以期為研究情志應(yīng)激所致DACD的發(fā)病機制以及ZBPYR的治療機制提供新線索;此外,基于16S rRNA技術(shù),我們動態(tài)觀察了情志應(yīng)激所致DACD及ZBPYR干預(yù)后發(fā)生發(fā)展過程中腸道菌群的變化,闡明ZBPYR對腸道菌群的動態(tài)調(diào)節(jié)作用。一、理論研究本章較為系統(tǒng)地對情志與DACD的相關(guān)性進行了探討分析,對中醫(yī)學(xué)、現(xiàn)代醫(yī)學(xué)對DACD的認識及治療的現(xiàn)有研究進展進行總結(jié),同時對“從脾論治”ZBPYR治療DACD的理論、情志應(yīng)激所致DACD動物模型的建立進行多方面、多層次、多方向的探討,為“脾主思藏意”,“思傷脾、脾失藏意”引起DACD的理論內(nèi)涵和基礎(chǔ)研究提供支撐和依據(jù)。本章研究為論文的設(shè)計和系統(tǒng)研究提供基礎(chǔ)。二、實驗研究目的:1.觀察ZBPYR對情志應(yīng)激所致DACD大鼠學(xué)習(xí)記憶能力的影響;2.對情志應(yīng)激所致DACD大鼠全腦組織進行泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究以尋找出差異表達的泛素化蛋白質(zhì);3.差異表達的泛素化蛋白質(zhì)用于生物信息學(xué)分析,以期了解與DACD發(fā)病密切相關(guān)的生物學(xué)通路和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),并分析ZBPYR的可能作用靶點;4.闡明泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)果的可靠性,并初步分析差異表達的泛素化蛋白質(zhì)豐度改變與mRNA水平變化的關(guān)系;5.動態(tài)觀察情志應(yīng)激所致DACD大鼠腸道菌群的變化及ZBPYR的調(diào)節(jié)作用。方法:瘦型同窩大鼠(Lean Zucker rat,LZ)為對照組,自發(fā)性2型糖尿病模型ZDF大鼠隨機分為糖尿病模型組(ZDF)、糖尿病模型+情志組(ZDF_P)、糖尿病模型+情志+滋補脾陰方藥治療組(P_Z),共4組。1.通過監(jiān)測隨機血糖(Random blood glucose,RBG)、空腹血清胰島素(Fasting serum insulin,FSI)、口服葡萄糖耐量實驗(Oral glucose tolerance,OGTT)和胰島素耐量實驗(Insulin tolerance,ITT),觀察4組大鼠的糖尿病狀態(tài)和ZBPYR的干預(yù)作用。通過檢測皮質(zhì)酮,觀察各組大鼠下丘腦-垂體-腎上腺軸(Hypothalamic-pituitary-adrenal,HPA)是否被激活。2.通過行為學(xué)實驗,包括曠場、避暗以及水迷宮實驗,觀察4組大鼠的學(xué)習(xí)記憶能力和ZBPYR的干預(yù)作用。3.利用Label-free聯(lián)合LC-MS/MS技術(shù)進行泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,篩選差異表達的泛素化蛋白質(zhì)。4.通過GO分類注釋、KEGG通路和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),對差異表達的泛素化蛋白質(zhì)進行生物信息學(xué)分析。5.在蛋白水平上,利用Western blotting技術(shù)驗證泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)的結(jié)果可靠性;利用實時熒光定量PCR法(Quantitative Real-time PCR,qPCR)初步分析差異表達的泛素化蛋白質(zhì)豐度改變和mRNA水平變化的關(guān)系。6.基于16S rRNA技術(shù)進行腸道菌群分析,分析腸道菌群物種的豐度和多樣性,尋找ZBPYR作用的腸道菌群靶點。結(jié)果:1.ZDF組大鼠每周的RBG均明顯升高,葡萄糖機能受損,存在糖耐量異常和外周胰島素抵抗;情志應(yīng)激加重了大鼠的葡萄糖機能受損和外周胰島素抵抗;給予ZBPYR治療后,大鼠葡萄糖耐量得到改善,外周胰島素抵抗減輕。情志應(yīng)激顯著升高了大鼠的皮質(zhì)酮水平,ZBPYR治療能夠顯著降低其水平。2.在曠場實驗中,ZBPYR治療顯著升高了大鼠的正中格停留時間、中央格穿梭以及直立次數(shù),有增加大鼠運動總距離的趨勢。在避暗實驗中,ZBPYR治療有延長大鼠潛伏期的趨勢。在Morris水迷宮定位航行實驗中,接受ZBPYR治療后的P_Z組大鼠訓(xùn)練第5天的潛伏期明顯縮短。在Morris水迷宮空間探索實驗中,ZBPYR治療有增加大鼠尋找原平臺所在位置的時間、在原平臺所在象限停留時間及穿越原平臺位置的次數(shù)的趨勢。在Morris水迷宮可視化平臺實驗中,4組大鼠的游泳距離和尋找可見平臺的潛伏期比較無統(tǒng)計學(xué)差異。3.共鑒定到1,680個泛素化位點,1,620個泛素化肽段,842個泛素化蛋白質(zhì)。與LZ組比較,在ZDF組發(fā)現(xiàn)56個上調(diào)及144個下調(diào)的差異表達泛素化蛋白質(zhì);與ZDF組比較,在ZDF_P組發(fā)現(xiàn)69個上調(diào)及58個下調(diào)的差異表達泛素化蛋白質(zhì);與ZDF_P組比較,在P_Z組發(fā)現(xiàn)52個上調(diào)及124個下調(diào)的差異表達泛素化蛋白質(zhì)。此外,在上述兩兩比較中,發(fā)現(xiàn)16個共同差異表達的蛋白質(zhì)。4.生物信息學(xué)方法:差異表達泛素化蛋白質(zhì)主要位于細胞、細胞器以及細胞膜;細胞過程、單生物過程、生物調(diào)節(jié)、多細胞生物過程和代謝過程是其參與的主要生物學(xué)過程。LZ組和ZDF組的差異表達蛋白質(zhì)主要參與的KEGG通路有10條,包括胰島素分泌、胰腺分泌、cAMP信號通路等;ZDF組和ZDF_P組的差異表達蛋白質(zhì)主要參與的KEGG通路有11條,包括cAMP信號通路、心肌細胞中的腎上腺素能信號、胰島素分泌等;ZDF_P組和P_Z組的差異表達蛋白質(zhì)主要參與的KEGG通路有21條,包括內(nèi)吞作用、多巴胺能突觸、cAMP信號通路等。通過使用IntACT數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)LZ組與ZDF組、ZDF組與ZDF_P組、ZDF_P組與P_Z組分別存在79、51、59個相互作用的差異表達蛋白質(zhì)。5.通過使用Western blotting技術(shù)驗證選取的鈣/鈣調(diào)蛋白依賴性蛋白激酶Ⅱ型亞基 α(Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type Ⅱ subunit alpha,Camk2α)、鈉/鉀轉(zhuǎn)運 ATP 酶亞基 β-1(Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1,Atp1b1)、鳥嘌呤核苷酸結(jié)合蛋白G(o)亞基α(Guanine nucleotide-binding protein G(o)subunit alpha,Gnao1)、磷酸丙糖異構(gòu)酶 1(Triosephosphate isomerase,Tpi1)4個差異表達泛素化蛋白質(zhì),其結(jié)果與泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)的結(jié)果一致。qPCR結(jié)果表明,ZDF組Camk2α mRNA表達較LZ組明顯降低,P_Z組Camk2α mRNA表達較ZDF_P組顯著上調(diào)。Atp1b1 mRNA、Gnao1 mRNA、Tpi1 mRNA的表達變化與蛋白質(zhì)水平變化趨勢相一致,但未達到統(tǒng)計學(xué)差異。6.腸道菌群分析:微生物群落α多樣性指數(shù)結(jié)果顯示,給予ZBPYR可動態(tài)降低Chao1、ACE指數(shù)。在門水平上,所有樣品以厚壁菌門和擬桿菌門為主,且豐度隨時間的變化發(fā)生了動態(tài)變化。在屬水平上,各組樣品中優(yōu)勢菌屬為乳酸桿菌屬;薩特氏菌屬、羅氏菌屬、雙歧桿菌屬、鏈球菌屬、普雷沃菌屬、乳酸桿菌屬等隨時間的變化菌屬豐度發(fā)生了動態(tài)變化。樣品主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)、主坐標分析(Principal Coordinate Analysis,PCoA)和UniFrac距離組間/組內(nèi)差異比較分析能夠看出ZDF組、ZDF_P組樣品與LZ組樣品很好地分離,而P_Z組樣品分布于ZDF組與ZDF_P組之間,表明ZBPYR可調(diào)節(jié)DACD大鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)。結(jié)論:1.自發(fā)性糖尿病肥胖ZDF大鼠符合DACD的行為學(xué)改變,是良好的DACD動物模型。情志應(yīng)激促進和加重了DACD的發(fā)生發(fā)展。ZBPYR除了能改善DACD大鼠的RBG升高等糖尿病特征外,還可提高學(xué)習(xí)記憶能力。情志應(yīng)激激活了ZDF大鼠的HPA軸,ZBPYR能夠抑制HPA軸的激活。2.應(yīng)用Label-free聯(lián)合LC-MS/MS的蛋白質(zhì)非標記定量技術(shù),構(gòu)建了LZ大鼠和ZDF大鼠的泛素化蛋白質(zhì)圖譜,奠定了深入研究蛋白質(zhì)泛素化與DACD相關(guān)性的基礎(chǔ);發(fā)現(xiàn)200個差異表達泛素化蛋白質(zhì)與DACD發(fā)病相關(guān),127個差異表達泛素化蛋白質(zhì)與情志應(yīng)激相關(guān),以及可能是ZBPYR作用的16個差異表達泛素化蛋白質(zhì)靶點。3.生物信息學(xué)分析闡明了大鼠全腦組織中差異表達泛素化蛋白質(zhì)的GO分類、KEGG通路和蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)相互作用,為DACD發(fā)病機制的基礎(chǔ)研究和ZBPYR的治療機制研究奠定了基礎(chǔ)。4.通過使用Western blotting技術(shù)證實了本次實驗中泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的可靠性。qPCR結(jié)果提示蛋白質(zhì)表達水平的改變可能不完全源于mRNA的變化。5.腸道菌群分析結(jié)果表明ZBPYR能顯著性改善失調(diào)的腸道菌群多樣性并動態(tài)降低Chao1、ACE多樣性指數(shù)。人和大鼠微生物在門的組成上是相同的。從動態(tài)發(fā)展過程看,ZBPYR可升高乳酸桿菌屬、嗜黏蛋白阿克曼氏菌屬、Anaerostipes屬豐度;可降低Allobaculum、另枝菌屬、變形桿菌屬、糞球菌屬豐度。ZBPYR能顯著調(diào)節(jié)情志應(yīng)激所致DACD引起的益生菌和致病菌紊亂。
【學(xué)位授予單位】:南京中醫(yī)藥大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R285.5
【圖文】:

大鼠,統(tǒng)計學(xué)意義,組間,和圖


_Z逡逑組大鼠有降低的趨勢(表丨-2和圖1-2A)。FS丨水平在4組間沒有統(tǒng)計學(xué)意義(表逡逑1-3邋和圖邋1-2B)。逡逑表邋1-2邋大鼠邋RBG邋(邋x土s,mmol/L)逡逑分組第1周第2周第3周第4周邋第5周邋第6周邋第7周邋第8周逡逑38逡逑

電泳圖,電泳圖,大鼠,樣品


圖2.1-1各組大鼠樣品的SDS-PAGE電泳圖逡逑F大鼠全腦泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)的鑒定結(jié)果逡逑質(zhì)譜定量分析及maxquant查庫來獲得樣本的肽段豐度信息。以prote0.01,peptide邋FDR彡0.01為篩選條件對結(jié)果進行過濾。最終鑒定至ljl,6化位點,1,620個泛素化肽段,842個泛素化蛋白。逡逑e邋Ontology邋分析逡逑ne邋Ontology(簡稱GO)可用來全面描述生物體中基因和基因產(chǎn)物的屬數(shù)據(jù)庫中有3個獨立的本體(Ontology):生物學(xué)過程(Biological邋Process分(CellularComponent)、分子功能(MolecularFunction)。逡逑本研究中,通過Proteome邋Discoverer軟件,懫用GO分類注釋(level邋的泛素化蛋白質(zhì)。對于3個本體(生物學(xué)過程、細胞組分、分子功能)的條目,將所有相應(yīng)泛素化的蛋白質(zhì)個數(shù)列出,并做出餅狀統(tǒng)計圖2.1-2.1-4。GO分類圖顯示了邋3個本體中所涉及到各條目的分布情況,并以標記各個條目。逡逑

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9 唐時s

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