熒光法和分子對接研究 種黃酮與血清白蛋白的相互作用
本文關(guān)鍵詞:熒光法和分子對接研究4種黃酮與血清白蛋白的相互作用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
色譜 分光光度計(jì) 光譜
第38卷2010年4月
DOI:10.3724/SP.J.1096.2010.00483
分析化學(xué)(FENXIHUAXUE)研究報(bào)告第4期483~487
ChineseJournalofAnalyticalChemistry
熒光法和分子對接研究4種黃酮與血清白蛋白的相互作用
徐倩
鄧丹丹
曹志娟
謝瓊
梁建英
盧建忠
*
(復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院,上海201203)
摘
要
結(jié)合分子對接理論和熒光法研究4種黃酮類天然產(chǎn)物與白蛋白的相互作用及作用機(jī)理。用FlexX
軟件研究了黃芩素、黃芩苷、漢黃芩素、燈盞乙素和白蛋白的分子對接,然后用熒光法研究這4種黃酮類天然產(chǎn)物與牛血清白蛋白的結(jié)合反應(yīng),測定了結(jié)合常數(shù)KA、結(jié)合位點(diǎn)n等參數(shù)。研究表明:4種天然產(chǎn)物與牛血清白蛋白結(jié)合位點(diǎn)n≈1,溫度對結(jié)合位點(diǎn)影響不大;黃芩素和漢黃芩素主要通過疏水作用力與白蛋白結(jié)合,而黃芩苷和燈盞乙素主要通過氫鍵和范德華力與白蛋白結(jié)合。熒光實(shí)驗(yàn)和分子對接理論研究結(jié)果一致,兩者相互補(bǔ)充,能夠從實(shí)驗(yàn)和理論兩方面協(xié)同研究天然產(chǎn)物與蛋白之間的相互作用。關(guān)鍵詞
牛血清白蛋白;黃芩素;黃芩苷;漢黃芩素;燈盞乙素;熒光光譜法;分子對接
1引言
蛋白質(zhì)是藥物發(fā)揮藥效的重要載體和靶分子,探討具有藥理活性的天然產(chǎn)物與蛋白質(zhì)的相互作用及作用機(jī)理,對于了解藥物發(fā)揮藥效的作用機(jī)制,揭示藥物藥效的實(shí)質(zhì)內(nèi)涵具有重要意義。血清白蛋白是一種重要的蛋白質(zhì),,能與許多內(nèi)源和外源性化合物結(jié)合,起到存儲(chǔ)與轉(zhuǎn)運(yùn)作用。血清白蛋白有內(nèi)源性
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熒光,近年來常用于研究與藥物的相互作用。楊曼曼等用熒光法研究喹諾酮類藥物與白蛋白的作用;楊冉等
用熒光法研究黃酮與溶菌酶的相互作用;畢淑云等用熒光法研究抗生素與人血清白蛋
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白的結(jié)合反應(yīng);Wang等用熒光法研究橙皮苷類黃酮與牛血清白蛋白的相互作用;王敬政等用熒光
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法研究中藥活性成分蘆薈大黃素與血清白蛋白的相互作用機(jī)制;薛永來等
子與腫瘤抑制蛋白的相互作用。
采用熒光法研究了金屬離
黃芩素、黃芩苷、漢黃芩素和燈盞乙素是常見的黃酮類天然產(chǎn)物,具有廣泛的藥理活性。深入研究這些黃酮類天然產(chǎn)物與牛血清白蛋白(BSA)的相互作用,對于闡述它們在體內(nèi)的運(yùn)輸、分布和代謝等藥aideddrugdesign,CADD)是建立在理作用機(jī)理具有重要的意義。計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)(Computer-化學(xué)、生物學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)基礎(chǔ)上的綜合學(xué)科,在藥物研發(fā)中起到日益重要的作用。分子
主要用于研究蛋白質(zhì)受體和藥物小分子之間通過幾何匹配和能對接技術(shù)作為一種重要的CADD手段,
量匹配從而相互識(shí)別的過程。其研究領(lǐng)域常涉及柔性受體處理、溶劑效應(yīng)、互變異構(gòu)體平衡轉(zhuǎn)換、構(gòu)造
評(píng)價(jià)函數(shù)等新問題。與其它計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)方法相比,分子對接技術(shù)從整體上考慮配體和受體的結(jié)合效果,能較好地避免局部作用較好、整體結(jié)合欠佳的情況,可為分子結(jié)合模式以及藥物分子結(jié)
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構(gòu)改造提供重要信息。本研究采用FlexX軟件研究了黃芩素、黃芩苷、漢黃芩素和燈盞乙素與HSA之間的分子對接,以熒光光譜法研究這些天然產(chǎn)物與BSA的結(jié)合反應(yīng),并測定了結(jié)合常數(shù)、結(jié)合位點(diǎn)數(shù)與結(jié)合力類型,探討了黃芩素、黃芩苷、漢黃芩素、燈盞乙素與白蛋白的作用機(jī)理。綜合而言,熒光實(shí)驗(yàn)和分子對接理論研究結(jié)果一致,兩者相互補(bǔ)充,能夠協(xié)同從實(shí)驗(yàn)和理論兩方面來研究天然產(chǎn)物與白蛋白之間的相互作用,對于研究藥物在體內(nèi)的運(yùn)輸、分布、代謝具有重要意義。
2
2.1
實(shí)驗(yàn)部分
儀器和試劑
PerkinElmerLS55熒光光度儀,實(shí)驗(yàn)中采用循環(huán)水浴維持樣品溫度。天然產(chǎn)物黃芩素、黃芩苷、漢
2009-09-26收稿;2009-11-12接受
本文系國家自然科學(xué)基金(No.90409017)和上海市中藥現(xiàn)代化(No.08DZ1971201)資助項(xiàng)目*E-mail:jzlu@
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本文編號(hào):195540
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