目的:應用RT-qPCR技術(shù)檢測大鼠骨骼肌挫傷后有ARE結(jié)構(gòu)的mRNA（AREs-mRNAs）和無ARE結(jié)構(gòu)的mRNA（non-AREs mRNAs）的表達量,探索有、無ARE結(jié)構(gòu)mRNA表達異質(zhì)性（個體間表達差異）之間的差異,以期為用于損傷時間推斷指標的篩選提供幫助。方法:成年Sprague-Dewley大鼠108只,隨機分為正常對照組、損傷后4h,8h,12h,16h,20h,24h,28h,32h,36h,40h,44h和48h組,重力錘自由落體制備骨骼肌損傷模型。實驗共分為三組,分別為實驗組（n=6）、隨機抽樣組（n=3）和樣本增多組（n=6+2）,其中隨機抽樣組利用Excel中INDERECT函數(shù)從實驗組每組6個樣本中隨機抽取3個;樣本增多組是在實驗組基礎上對照組增加6個樣本,損傷組每組增加2個樣本。在前期測序結(jié)果的基礎上,篩選出non-AREs mRNAs和AREs-mRNAs各五個,利用RT-qPCR技術(shù)檢測其表達量,并分別計算mRNA在同一時間點內(nèi)不同個體間的CV,DFA,STD,Z.SCORE。利用T檢驗、Fisher判別分析和隨機森林分類驗證有、無AREs mRNA... 

【文章來源】：山西醫(yī)科大學山西省

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對照表
前言
1 材料與方法
    1.1 mRNA選取
    1.2 材料與儀器
    1.3 動物模型建立及檢材提取
    1.4 總RNA提取
    1.5 檢測RNA純度、濃度及完整性
    1.6 RNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
    1.7 利用cDNA進行RT-qPCR擴增
    1.8 數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計學分析
2 結(jié)果
    2.1 選取mRNA信息
    2.2 總RNA的純度及完整性
    2.3 內(nèi)參基因及目的基因的擴增效率
    2.4 mRNAs表達量、變異系數(shù)、離均差、標準差及Z.SCORE
    2.5 實驗組統(tǒng)計分析
    2.6 隨機抽樣組統(tǒng)計分析
    2.7 樣本增多組統(tǒng)計分析
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻
Review
    1 AREs Structure and Function
    2 Non-AREs mRNAs may suitable for wound age estimation
    3 Measures of heterogeneity
    4 Commonly used classification method
    References
致謝
在學期間承擔/參與的科研課題與研究成果
個人簡歷


【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于聯(lián)合區(qū)間偏最小二乘判別分析的豬肉近紅外光譜定性建模分析[J]. 武小紅,孫俊,武斌,唐凱.  激光與光電子學進展. 2015(04)
[2]基于支持向量機的目標檢測算法綜述[J]. 郭明瑋,趙宇宙,項俊平,張陳斌,陳宗海.  控制與決策. 2014(02)
[3]多元統(tǒng)計分析在高校教師教學質(zhì)量管理中的應用研究[J]. 魏春梅.  高等函授學報(自然科學版). 2010(05)
[4]Fisher判別法在高校財務風險分析中的應用[J]. 鐘沖.  西南交通大學學報(社會科學版). 2007(06)

碩士論文
[1]機器學習算法在醫(yī)療數(shù)據(jù)分析中的應用[D]. 葉雷.華中師范大學 2017
[2]多元統(tǒng)計分析在高等教育評價中的應用[D]. 耿葉萌.電子科技大學 2015
[3]決策樹及神經(jīng)網(wǎng)絡算法在股票分類預測中的應用[D]. 陶雨雨.杭州電子科技大學 2014
[4]支持向量機中若干優(yōu)化算法研究[D]. 邵小健.山東科技大學 2005



本文編號：2923617