ARE結(jié)構(gòu)對(duì)骨骼肌損傷后mRNA表達(dá)異質(zhì)性影響研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-18 07:28
目的:應(yīng)用RT-qPCR技術(shù)檢測(cè)大鼠骨骼肌挫傷后有ARE結(jié)構(gòu)的mRNA(AREs-mRNAs)和無(wú)ARE結(jié)構(gòu)的mRNA(non-AREs mRNAs)的表達(dá)量,探索有、無(wú)ARE結(jié)構(gòu)mRNA表達(dá)異質(zhì)性(個(gè)體間表達(dá)差異)之間的差異,以期為用于損傷時(shí)間推斷指標(biāo)的篩選提供幫助。方法:成年Sprague-Dewley大鼠108只,隨機(jī)分為正常對(duì)照組、損傷后4h,8h,12h,16h,20h,24h,28h,32h,36h,40h,44h和48h組,重力錘自由落體制備骨骼肌損傷模型。實(shí)驗(yàn)共分為三組,分別為實(shí)驗(yàn)組(n=6)、隨機(jī)抽樣組(n=3)和樣本增多組(n=6+2),其中隨機(jī)抽樣組利用Excel中INDERECT函數(shù)從實(shí)驗(yàn)組每組6個(gè)樣本中隨機(jī)抽取3個(gè);樣本增多組是在實(shí)驗(yàn)組基礎(chǔ)上對(duì)照組增加6個(gè)樣本,損傷組每組增加2個(gè)樣本。在前期測(cè)序結(jié)果的基礎(chǔ)上,篩選出non-AREs mRNAs和AREs-mRNAs各五個(gè),利用RT-qPCR技術(shù)檢測(cè)其表達(dá)量,并分別計(jì)算mRNA在同一時(shí)間點(diǎn)內(nèi)不同個(gè)體間的CV,DFA,STD,Z.SCORE。利用T檢驗(yàn)、Fisher判別分析和隨機(jī)森林分類驗(yàn)證有、無(wú)AREs mRNA...
【文章來(lái)源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對(duì)照表
前言
1 材料與方法
1.1 mRNA選取
1.2 材料與儀器
1.3 動(dòng)物模型建立及檢材提取
1.4 總RNA提取
1.5 檢測(cè)RNA純度、濃度及完整性
1.6 RNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
1.7 利用cDNA進(jìn)行RT-qPCR擴(kuò)增
1.8 數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 選取mRNA信息
2.2 總RNA的純度及完整性
2.3 內(nèi)參基因及目的基因的擴(kuò)增效率
2.4 mRNAs表達(dá)量、變異系數(shù)、離均差、標(biāo)準(zhǔn)差及Z.SCORE
2.5 實(shí)驗(yàn)組統(tǒng)計(jì)分析
2.6 隨機(jī)抽樣組統(tǒng)計(jì)分析
2.7 樣本增多組統(tǒng)計(jì)分析
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
Review
1 AREs Structure and Function
2 Non-AREs mRNAs may suitable for wound age estimation
3 Measures of heterogeneity
4 Commonly used classification method
References
致謝
在學(xué)期間承擔(dān)/參與的科研課題與研究成果
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于聯(lián)合區(qū)間偏最小二乘判別分析的豬肉近紅外光譜定性建模分析[J]. 武小紅,孫俊,武斌,唐凱. 激光與光電子學(xué)進(jìn)展. 2015(04)
[2]基于支持向量機(jī)的目標(biāo)檢測(cè)算法綜述[J]. 郭明瑋,趙宇宙,項(xiàng)俊平,張陳斌,陳宗海. 控制與決策. 2014(02)
[3]多元統(tǒng)計(jì)分析在高校教師教學(xué)質(zhì)量管理中的應(yīng)用研究[J]. 魏春梅. 高等函授學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[4]Fisher判別法在高校財(cái)務(wù)風(fēng)險(xiǎn)分析中的應(yīng)用[J]. 鐘沖. 西南交通大學(xué)學(xué)報(bào)(社會(huì)科學(xué)版). 2007(06)
碩士論文
[1]機(jī)器學(xué)習(xí)算法在醫(yī)療數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用[D]. 葉雷.華中師范大學(xué) 2017
[2]多元統(tǒng)計(jì)分析在高等教育評(píng)價(jià)中的應(yīng)用[D]. 耿葉萌.電子科技大學(xué) 2015
[3]決策樹及神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法在股票分類預(yù)測(cè)中的應(yīng)用[D]. 陶雨雨.杭州電子科技大學(xué) 2014
[4]支持向量機(jī)中若干優(yōu)化算法研究[D]. 邵小健.山東科技大學(xué) 2005
本文編號(hào):2923617
【文章來(lái)源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對(duì)照表
前言
1 材料與方法
1.1 mRNA選取
1.2 材料與儀器
1.3 動(dòng)物模型建立及檢材提取
1.4 總RNA提取
1.5 檢測(cè)RNA純度、濃度及完整性
1.6 RNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
1.7 利用cDNA進(jìn)行RT-qPCR擴(kuò)增
1.8 數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 選取mRNA信息
2.2 總RNA的純度及完整性
2.3 內(nèi)參基因及目的基因的擴(kuò)增效率
2.4 mRNAs表達(dá)量、變異系數(shù)、離均差、標(biāo)準(zhǔn)差及Z.SCORE
2.5 實(shí)驗(yàn)組統(tǒng)計(jì)分析
2.6 隨機(jī)抽樣組統(tǒng)計(jì)分析
2.7 樣本增多組統(tǒng)計(jì)分析
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
Review
1 AREs Structure and Function
2 Non-AREs mRNAs may suitable for wound age estimation
3 Measures of heterogeneity
4 Commonly used classification method
References
致謝
在學(xué)期間承擔(dān)/參與的科研課題與研究成果
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于聯(lián)合區(qū)間偏最小二乘判別分析的豬肉近紅外光譜定性建模分析[J]. 武小紅,孫俊,武斌,唐凱. 激光與光電子學(xué)進(jìn)展. 2015(04)
[2]基于支持向量機(jī)的目標(biāo)檢測(cè)算法綜述[J]. 郭明瑋,趙宇宙,項(xiàng)俊平,張陳斌,陳宗海. 控制與決策. 2014(02)
[3]多元統(tǒng)計(jì)分析在高校教師教學(xué)質(zhì)量管理中的應(yīng)用研究[J]. 魏春梅. 高等函授學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[4]Fisher判別法在高校財(cái)務(wù)風(fēng)險(xiǎn)分析中的應(yīng)用[J]. 鐘沖. 西南交通大學(xué)學(xué)報(bào)(社會(huì)科學(xué)版). 2007(06)
碩士論文
[1]機(jī)器學(xué)習(xí)算法在醫(yī)療數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用[D]. 葉雷.華中師范大學(xué) 2017
[2]多元統(tǒng)計(jì)分析在高等教育評(píng)價(jià)中的應(yīng)用[D]. 耿葉萌.電子科技大學(xué) 2015
[3]決策樹及神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法在股票分類預(yù)測(cè)中的應(yīng)用[D]. 陶雨雨.杭州電子科技大學(xué) 2014
[4]支持向量機(jī)中若干優(yōu)化算法研究[D]. 邵小健.山東科技大學(xué) 2005
本文編號(hào):2923617
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