模擬失重下巨噬細胞長鏈非編碼RNA表達譜變化及生物信息學分析
發(fā)布時間：2020-12-14 12:36
目的探索在模擬失重下巨噬細胞RAW264.7差異表達的長鏈非編碼RNAs（Lnc RNA）及其生物學意義。方法巨噬細胞RAW264.7隨機分為對照組（C）和模擬失重組（Z）,Z組細胞回轉(zhuǎn)72小時模擬失重,采用Arraystar小鼠長鏈非編碼RNA芯片鑒別對照和模擬失重組巨噬細胞Lnc RNAs表達譜的差異。通過volcano法鑒別（差異倍數(shù)≥2.0,P≤0.05）兩組間有統(tǒng)計學差異的Lnc RNAs,對篩選的差異表達Lnc RNAs以熒光定量PCR技術(shù)進行驗證。采用GO和KEGG分析預測Lnc RNAs的潛在功能,以e Bioscience基于Luminex的多重免疫分析技術(shù)和流式細胞術(shù)檢測炎癥因子分泌及細胞凋亡,以Western blotting技術(shù)研究相關(guān)蛋白表達水平變化。結(jié)果Lnc RNA芯片結(jié)果顯示,與對照組相比,模擬失重組有693個差異表達的Lnc RNAs,其中328個Lnc RNAs表達上調(diào),365個Lnc RNAs表達下調(diào)的。q RT-PCR驗證結(jié)果表明,Lnc RNAs ENSMUST00000137470,uc009oqw.1,uc007wem.2,NR0...
【文章來源】：錦州醫(yī)科大學遼寧省
【文章頁數(shù)】：63 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
LncRNA芯片實驗、數(shù)據(jù)操作分析流程圖
圖 2 LncRNA Z vs C 聚類分析圖4、LncRNA 散點圖較模擬失重組和對照組之間的全部lncRNA表達譜的散點圖(scatter紅線表示lncRNA表達在任一方向上的雙重差異。 散點圖表明樣本集中趨勢。紅色表示上調(diào)2倍lncRNA，綠色表示下調(diào)2倍lncRNA。獲得差異上調(diào)LncRNA398個，即為圖3中紅色點；差異下調(diào)LncRNA3中綠色點；沒有明顯差異的LncRNA 21231個，即為圖3中黑色點
圖 3 LncRNA Z vs C 散點圖RNA 火山圖olcano plot)，用于比較兩組樣品的顯著性差異。正負紅色的點表示P值小于0.05，差異倍數(shù)大于2的差異基P值小于0.05，差異倍數(shù)小于-2的差異基因（探針）。LncRNA325個（圖4中紅色點），差異下調(diào)LncRNA有明顯差異的LncRNA 21351個（圖4中黑色的點）
【參考文獻】：
期刊論文
[1]模擬微重力對獼猴脾臟結(jié)構(gòu)、脾臟免疫細胞及其細胞因子表達的影響[J]. 陳楊,王萍,許崇玉,蔡藝靈,馬華松. 解放軍醫(yī)學雜志. 2016(06)
[2]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
[3]Effects of spaceflight and simulated microgravity on cell sub-microstructure and antioxidant enzyme activity in tomato[J]. CHEN Yu,LU Jin Ying,LI Hua Sheng,SUN Qiao,ZHAO Ying,SU Liang,LIU Min. Science China(Technological Sciences). 2015(02)
本文編號：2916420
【文章來源】：錦州醫(yī)科大學遼寧省
【文章頁數(shù)】：63 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
LncRNA芯片實驗、數(shù)據(jù)操作分析流程圖
圖 2 LncRNA Z vs C 聚類分析圖4、LncRNA 散點圖較模擬失重組和對照組之間的全部lncRNA表達譜的散點圖(scatter紅線表示lncRNA表達在任一方向上的雙重差異。 散點圖表明樣本集中趨勢。紅色表示上調(diào)2倍lncRNA，綠色表示下調(diào)2倍lncRNA。獲得差異上調(diào)LncRNA398個，即為圖3中紅色點；差異下調(diào)LncRNA3中綠色點；沒有明顯差異的LncRNA 21231個，即為圖3中黑色點
圖 3 LncRNA Z vs C 散點圖RNA 火山圖olcano plot)，用于比較兩組樣品的顯著性差異。正負紅色的點表示P值小于0.05，差異倍數(shù)大于2的差異基P值小于0.05，差異倍數(shù)小于-2的差異基因（探針）。LncRNA325個（圖4中紅色點），差異下調(diào)LncRNA有明顯差異的LncRNA 21351個（圖4中黑色的點）
【參考文獻】：
期刊論文
[1]模擬微重力對獼猴脾臟結(jié)構(gòu)、脾臟免疫細胞及其細胞因子表達的影響[J]. 陳楊,王萍,許崇玉,蔡藝靈,馬華松. 解放軍醫(yī)學雜志. 2016(06)
[2]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
[3]Effects of spaceflight and simulated microgravity on cell sub-microstructure and antioxidant enzyme activity in tomato[J]. CHEN Yu,LU Jin Ying,LI Hua Sheng,SUN Qiao,ZHAO Ying,SU Liang,LIU Min. Science China(Technological Sciences). 2015(02)
本文編號：2916420
本文鏈接：http://www.lk138.cn/yixuelunwen/yundongyixue/2916420.html
最近更新
教材專著
