重慶市庫蚊標(biāo)本中宜昌病毒的分離鑒定
發(fā)布時間:2024-07-09 00:37
目的對2017年采集自重慶地區(qū)蚊蟲標(biāo)本攜帶的病毒進行分離鑒定。方法采用組織細胞培養(yǎng)法進行病毒分離,應(yīng)用高通量測序技術(shù)獲得病毒分離物的全基因組序列,采用系統(tǒng)發(fā)育法進行種類及分子特征分析。結(jié)果庫蚊標(biāo)本來源的病毒陽性分離物CQFD2017能引起白紋伊蚊細胞C6/36病變,但不能引起金黃地鼠腎細胞BHK-21、非洲綠猴腎細胞Vero病變。CQFD2017全基因組序列長度為20 893 bp,包含6個開放閱讀框。系統(tǒng)進化分析發(fā)現(xiàn),該毒株位于Nidovirales病毒目Mesoniviridae病毒科的Yichang病毒所在的進化分支,與Yichang病毒(NC040534)的核苷酸一致性為98.6%,ORF1a和ORF1b區(qū)氨基酸一致性分別為99.06%和99.15%,因此將該毒株命名為Yichang病毒CQFD2017株。結(jié)論 2017年重慶市庫蚊標(biāo)本分離的CQFD2017株為Yichang病毒。
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【部分圖文】:
本文編號:4004121
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圖1蚊蟲標(biāo)本采集地點
2017年9月,在重慶市巴南區(qū)和豐都縣共采集到732只蚊蟲標(biāo)本(圖1),其中騷擾阿蚊672只(92%),致倦庫蚊30只(4%),三帶喙庫蚊30只(4%)。這些蚊蟲被分為20批次接種細胞。從重慶地區(qū)豐都縣致倦庫蚊標(biāo)本分離物在接種C6/36細胞后72h開始引起細胞CPE。CPE的主....
圖2CQFD2017對C6/36細胞致病變作用
為了研究CQFD2017的系統(tǒng)進化地位,從NCBI的GenBank下載了與CQFD2017相似性≥30%的RNA依賴的RNA聚合酶(RNA-dependentRNApolymerase,RdRp)氨基酸序列,并用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。分析表明,CQFD2017屬于Mesoni....
圖3基于宜昌病毒分離株CQFD2017的RdRp區(qū)氨基酸序列的系統(tǒng)進化分析
表1CQFD2017與Mesoniviridae病毒科家族成員的氨基酸序列比對分析Tab.1AminoacididentitiesbetweenCQFD2017andothermembersoffamilyMesoniviridaeVirusCQFD2....
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