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面向傳染病主動(dòng)監(jiān)控的異構(gòu)數(shù)據(jù)挖掘方法研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-14 13:41
   主動(dòng)監(jiān)控是最有效的傳染病預(yù)防和控制方法。通過派遣醫(yī)護(hù)人員對(duì)監(jiān)控區(qū)域內(nèi)的個(gè)體進(jìn)行全面排查可從根本上抑制疾病傳播。為了最大化有限醫(yī)療資源的利用率,主動(dòng)監(jiān)控策略通常只在部分高風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域執(zhí)行。因此,如何準(zhǔn)確的評(píng)估待監(jiān)控區(qū)域的傳播風(fēng)險(xiǎn),為有限資源的合理分配提供可靠依據(jù),是提高主動(dòng)監(jiān)控策略有效性的關(guān)鍵。疾病傳播的主要驅(qū)動(dòng)力是人類的遷移行為,其主要?jiǎng)訖C(jī)和決策過程受多重因素影響,如:經(jīng)濟(jì)、環(huán)境、天氣、交通等。找到各類因素與遷移行為之間的內(nèi)在聯(lián)系,則可以建模傳染病的傳播過程,從而預(yù)測潛在的傳播風(fēng)險(xiǎn)。在大數(shù)據(jù)時(shí)代,異構(gòu)數(shù)據(jù)挖掘理論和技術(shù)日趨成熟,為傳播風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測提供了新的機(jī)遇,同時(shí)也面臨如下挑戰(zhàn):(1)如何發(fā)現(xiàn)并建模主導(dǎo)傳播趨勢的遷移模式,并找到隱含在這種遷移模式背后的驅(qū)動(dòng)因素,以解釋感染病例存在的本質(zhì)原因和生成機(jī)制。(2)如何制定全局最優(yōu)的物資分配策略,在最大化有限資源利用率的同時(shí)兼顧模型在未來監(jiān)控過程中的預(yù)測能力,即:模型可持續(xù)性。(3)如何反映動(dòng)態(tài)的遷移行為對(duì)傳播趨勢的實(shí)時(shí)影響,并解決驅(qū)動(dòng)因素在時(shí)間和空間兩個(gè)維度的影響力差異性(即:時(shí)空異質(zhì)性)問題;谝陨蠁栴},本文主張通過異構(gòu)數(shù)據(jù)挖掘方法實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確、可持續(xù)、實(shí)時(shí)的傳播風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測,主要工作介紹如下:(1)提出了一種基于時(shí)空傳播網(wǎng)絡(luò)的主動(dòng)監(jiān)控方法。該方法主張融合異構(gòu)數(shù)據(jù)建模人類的遷移過程從而預(yù)測傳播風(fēng)險(xiǎn),在實(shí)際應(yīng)用中為制定合理的主動(dòng)監(jiān)控策略提供準(zhǔn)確的參考信息。具體而言,通過分析人類的遷移行為,將傳染病的輸入和傳播過程劃分為四個(gè)階段:是否外出,去往何處,是否感染,何時(shí)返回,并將該過程建模為一個(gè)時(shí)空傳播網(wǎng)絡(luò)(Spatiotemporal Diffusion Network)。在此基上,提出了一個(gè)新型的傳染病主動(dòng)監(jiān)控框架(ASPII),該框架集成了機(jī)器學(xué)習(xí)模型、人口輻射模型、瘧疾傳播模型,融合了氣象、環(huán)境、生理、人口、地理、社會(huì)經(jīng)濟(jì)、監(jiān)控記錄等數(shù)據(jù)。此外,考慮到影響人類遷移行為的因素有多種,這些因素對(duì)不同監(jiān)控區(qū)域內(nèi)遷移行為的驅(qū)動(dòng)力不同,即:空間異質(zhì)性。本文提出了一種混合優(yōu)化算法,該算法可在優(yōu)化各因素權(quán)重系數(shù)的同時(shí)自動(dòng)的對(duì)監(jiān)控區(qū)域進(jìn)行分類,很好的解決了空間異質(zhì)性問題。(2)提出了一種基于強(qiáng)化學(xué)習(xí)的可持續(xù)主動(dòng)監(jiān)控方法。主動(dòng)監(jiān)控的實(shí)施通常僅限于部分高風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域,過程中反饋給預(yù)測模型的病例數(shù)據(jù)是不完整的,易導(dǎo)致模型在后續(xù)風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測中出現(xiàn)較大偏差,甚至失去可持續(xù)預(yù)測能力。針對(duì)該問題,本文采用強(qiáng)化學(xué)習(xí)算法對(duì)監(jiān)控物資進(jìn)行動(dòng)態(tài)分配,從而提出了可持續(xù)主動(dòng)監(jiān)控(Sustainable Active Surveillance,SAS)框架。該框架由預(yù)測器(Predictor)、分類器(Classifier)、規(guī)劃器(Planner)三部分組成,它們之間通過相互合作共同完成主動(dòng)監(jiān)控任務(wù)。其中,預(yù)測器可從正、反兩個(gè)角度對(duì)待監(jiān)控區(qū)域的風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行評(píng)估,以保證預(yù)測器的穩(wěn)定性。通過分類器可將屬性相似的待監(jiān)控區(qū)域劃分到同一類中,以實(shí)現(xiàn)未監(jiān)控區(qū)域和已監(jiān)控區(qū)域間的數(shù)據(jù)共享。通過規(guī)劃器可給出物資分配的全局最優(yōu)化策略,該策略不僅考慮了有限物資的利用率,還考慮了模型在后續(xù)風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測過程中的可持續(xù)性。(3)提出了一種基于在線學(xué)習(xí)的實(shí)時(shí)主動(dòng)監(jiān)控方法。各類驅(qū)動(dòng)因素對(duì)遷移行為的影響是具有時(shí)序性和實(shí)時(shí)性的,如四季更替和天氣突變等。因此,傳染病的傳播趨勢也同樣是具有時(shí)序性和實(shí)時(shí)性的,如瘧疾病在夏季和晴天傳播更快。此外,驅(qū)動(dòng)因素對(duì)各監(jiān)控區(qū)域感染風(fēng)險(xiǎn)的影響,不僅在空間范圍內(nèi)存在差異,在時(shí)間尺度上也存在差異,即:時(shí)空異質(zhì)性。針對(duì)以上問題,本文提出了一種基于在線學(xué)習(xí)的實(shí)時(shí)主動(dòng)監(jiān)控方法(Real-time Active Surveillance,RAS)。該方法采用FTRL-Proximal算法對(duì)模型參數(shù)進(jìn)行更新,不僅可以反映各類驅(qū)動(dòng)因素對(duì)傳播風(fēng)險(xiǎn)的實(shí)時(shí)影響,還可保證各驅(qū)動(dòng)因素權(quán)重系數(shù)的稀疏性,有利于發(fā)現(xiàn)隱含的主導(dǎo)因素。此外,本文還提出了一種動(dòng)態(tài)的監(jiān)控區(qū)域分類方法,該方法可以自動(dòng)優(yōu)化類別個(gè)數(shù)及各類中待監(jiān)控區(qū)域數(shù),很好的解決了時(shí)空異質(zhì)性問題。
【學(xué)位單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R181.8;TP311.13
【部分圖文】:

射頻識(shí)別,監(jiān)控器,結(jié)核,自動(dòng)識(shí)別


第 2 章 相關(guān)技術(shù)和算法概述些地區(qū)的無線通訊設(shè)施落后,EpiMap 采用衛(wèi)星通訊對(duì)接觸。戴無線傳感器可以持續(xù)、準(zhǔn)確的記錄個(gè)體的接觸事件(如時(shí)長),因此,逐漸成為一種收集“小范圍”內(nèi)高精度接觸數(shù)于醫(yī)院和校園等場景中的接觸模式研究。早在 2006 年,由究員 Nathan Eagle 和 Alex Pentland 提出的現(xiàn)實(shí)挖掘(Reali用可穿戴無線傳感設(shè)備記錄人們的日;顒(dòng)信息[47,48]。他們,記錄了一些 MIT 學(xué)生在教學(xué)樓內(nèi)某段時(shí)間的活動(dòng)軌跡,述接觸關(guān)系的小型社會(huì)網(wǎng)絡(luò)[49]。Salathé等人利用無線傳感中內(nèi) 788 名學(xué)生一天內(nèi)的接觸行為,并構(gòu)建了可以刻畫個(gè)體網(wǎng)絡(luò)[28]。該研究發(fā)現(xiàn)校園接觸網(wǎng)絡(luò)具有高密度連接和小世而,通過可穿戴傳感器設(shè)備收集遷移行為所需的費(fèi)用十分控的個(gè)體數(shù)量較大時(shí)。此外,穿戴傳感器設(shè)備的患者容易引視,考慮個(gè)人隱私等原因醫(yī)院通常不會(huì)給患者配帶可穿戴設(shè)

反應(yīng)擴(kuò)散模型,人群


沒能夠推廣到大規(guī)模個(gè)體遷移行為的監(jiān)控與分析研究中體行為靜態(tài)監(jiān)控來,為了克服細(xì)粒度個(gè)體接觸數(shù)據(jù)難以獲取的困難,可以刻畫特征的復(fù)合群體模型正備受關(guān)注。這類模型不僅具備模擬傳播刻畫大規(guī)模人口的接觸結(jié)構(gòu)。復(fù)合群體模型可將人口按年齡屬分為若干亞人群(Meta-population),使得相同亞人群中的個(gè)體特性(如易感性,傳染力,潛伏期,恢復(fù)期),進(jìn)而利用亞人為代替?zhèn)體接觸行為建模流行病的傳播過程[46]。基于該模型傳播可以描述為反應(yīng)擴(kuò)散(Reaction-diffusion)過程[28]。反應(yīng)刻體感染過程,擴(kuò)散則刻畫了流行病通過群體接觸結(jié)構(gòu)在亞人群外,由于流行病的控制策略通常是面向亞人群的,例如,在考配策略時(shí),接種人群通常按年齡進(jìn)行分組。因此,構(gòu)建亞人群具實(shí)際意義。

示意圖,與邏輯,線性回歸,似然


圖 2.4. 線性回歸與邏輯回歸原理示意圖邏輯回歸可根據(jù)具體問題選擇不同類型的損失函數(shù),如:0-1 損失、平方失、絕對(duì)值損失、似然損失等。以似然損失為例,假設(shè)樣本集合為{( x1,y1),( x2,y2),( xn,yn)},y={0,1},每個(gè)樣本( xi,yi)出現(xiàn)的概率可表示為:1( , ) ( 1| ) (1 ( 1| ))i iy yi i i i i iP y x P y x P y x …………(2.2當(dāng) yi=1 時(shí),上式表示樣本 i 為正例的可能性,反之,當(dāng) yi=0 時(shí),為負(fù)例的可性。所有樣本出現(xiàn)可能性的乘積為損失函數(shù)的完整數(shù)據(jù)似然,具體表示如下:1( ) ( 1| ) (1 ( 1| ))i iy yi i i iL P y x P y x …………(2.3在求解過程中,為了求導(dǎo)方便需要對(duì)上式進(jìn)行對(duì)數(shù)變換,之后,再進(jìn)行化簡具體過程如下:111 1( ) log( ( 1 | ) (1 ( 1 | )) )log ( 1 | ) (1 ) log(1 ( 1 | ))( 1 | )log log(1 ( 1 | ))1 ( 1 | ) i iy yi i i ini i i i i iin ni ii i i ii ii iL P y x P y xy p y x y p y xp y xy y p y xp y x……(2.4
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