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lncRNA-LFAR1在肝纖維化發(fā)病過程中的作用及機制研究

發(fā)布時間:2018-02-26 18:14

  本文關(guān)鍵詞: 肝纖維化長鏈非編碼RNA 肝星形細(xì)胞 Smad2/3 TGFβ Notch 出處:《天津醫(yī)科大學(xué)》2017年博士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:近年來,研究發(fā)現(xiàn)長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA;lnc RNA)廣泛地參與基因表達調(diào)控,在發(fā)育、疾病的發(fā)生等過程中發(fā)揮著重要的作用。然而,目前還沒有研究報道lnc RNA在肝纖維化發(fā)病過程中的作用。本研究旨在通過構(gòu)建肝纖維化小鼠模型并利用基因芯片技術(shù)篩選纖維化肝組織中差異表達的lnc RNAs,從中確定一個差異顯著且肝組織特異性表達的lnc RNA。闡明其在肝纖維化發(fā)生過程中的作用機制及與肝纖維化發(fā)生發(fā)展及預(yù)后的關(guān)系,為肝纖維化的診斷和治療提供新靶點。方法1.構(gòu)建四氯化碳(CCl4)誘導(dǎo)的小鼠肝纖維化模型;通過對比模型鼠與正常對照鼠的肝臟外觀表型、肝組織的天狼猩紅染色、HE染色、羥脯氨酸含量測定、q RT-PCR、Western blot、免疫組織化學(xué)染色以及免疫熒光技術(shù)檢測肝纖維化的各種指標(biāo)確證建模成功。2.應(yīng)用基因芯片技術(shù)篩選肝纖維化小鼠及正常小鼠肝組織中差異表達的lnc RNAs和m RNAs;并對芯片結(jié)果進行差異分析、GO分析、KEGG Pathway分析、lnc RNA-m RNA共表達分析、臨近基因分析、同源性分析以及mi RNAs的靶點預(yù)測。3.根據(jù)差異分析和lnc RNA-m RNA共表達分析篩選出10個lnc RNAs,并在纖維化的肝組織、原代肝星形細(xì)胞、肝細(xì)胞、小鼠不同的器官組織中檢測它們的表達水平,確保芯片的可靠并篩選出一個肝特異性表達,差異顯著的lnc RNA-Liver Fibrosis Associated lnc RNA1(lnc-LFAR1)。4.驗證lnc-LFAR1不具有編碼功能;核漿分離提取RNA技術(shù)確定lnc-LFAR1在細(xì)胞中的定位;c DNA末端快速擴增技術(shù)(RACE)技術(shù)測定lnc-LFAR1的全長序列。5.以慢病毒為載體在分離的原代HSCs中過表達或敲低lnc-LFAR1的表達后,運用q RT-PCR、Western blot和激光共聚焦顯微技術(shù)檢測與HSCs激活和纖維化發(fā)生相關(guān)基因的表達量改變。6.以慢病毒為載體在小鼠原代HCs及小鼠肝細(xì)胞系A(chǔ)ML12細(xì)胞中過表達或敲低lnc-LFAR1的表達后,運用q RT-PCR、Western blot和激光共聚焦顯微技術(shù)檢測與肝纖維化、細(xì)胞凋亡以及炎癥發(fā)生相關(guān)基因的表達量改變。7.構(gòu)建CCl4及膽管結(jié)扎(BDL)誘導(dǎo)肝纖維化小鼠模型,通過小鼠尾靜脈注射以慢病毒為載體的lnc-LFAR1干擾序列體內(nèi)確證lnc-LFAR1在肝纖維化發(fā)生過程中的作用。8.通過RNA干擾技術(shù)、染色質(zhì)免疫沉淀(Ch IP)技術(shù)、熒光素酶報告基因技術(shù)確證轉(zhuǎn)錄因子Smad2/3對lnc-LFAR1的調(diào)節(jié)作用。9.過表達或沉默lnc-LFAR1表達后,運用q RT-PCR和Western blot技術(shù),檢測基因芯片結(jié)果中提示的與肝纖維化發(fā)病過程中密切關(guān)聯(lián)的信號通路,例如TGFβ/Smad、Notch、MAPK1、NF-κB等信號通路的改變。10.運用核酸結(jié)合蛋白免疫共沉淀(RIP)技術(shù)、Ch IP技術(shù)檢測lnc-LFAR1是否與轉(zhuǎn)錄因子Smad2/3或染色質(zhì)重塑復(fù)合物組分結(jié)合。結(jié)果1.通過基因芯片技術(shù),我們發(fā)現(xiàn)了一個全新的、尚未報道過的lnc RNA分子lnc-LFAR1。研究表明lnc-LFAR1是一個肝特異性表達的lnc RNA;在肝星形細(xì)胞和肝細(xì)胞內(nèi)lnc-LFAR1也均有表達;盡管lnc-LFAR1在纖維化的肝組織中表達量減低;然而,在小鼠原代肝星形細(xì)胞培養(yǎng)激活過程中l(wèi)nc-LFAR1表達明顯增多;TGFβ刺激小鼠原代肝星形細(xì)胞(HSCs)和肝細(xì)胞(HCs)后lnc-LFAR1表達明顯增多;與正常的小鼠原代肝星形細(xì)胞相比,肝纖維化小鼠的原代肝星形細(xì)胞(HSCs)內(nèi)lnc-LFAR1表達也顯著增多。2.研究發(fā)現(xiàn),lnc-LFAR1促進HSCs的激活;促進促肝纖維化相關(guān)基因的表達。3.在原代HCs和小鼠肝細(xì)胞系A(chǔ)ML12細(xì)胞中,敲低lnc-LFAR1的表達抑制TGFβ引起的促肝纖維化相關(guān)基因、促炎癥相關(guān)基因表達水平的增高;敲低lnc-LFAR1的表達同時抑制TGFβ引起HCs凋亡。4.敲低lnc-LFAR1的表達抑制CCl4及膽管結(jié)扎(BDL)誘導(dǎo)的小鼠肝纖維化的發(fā)生。5.TGFβ通過促進轉(zhuǎn)錄因子Smad2/3結(jié)合于lnc-LFAR1的啟動子區(qū)域,從而促進lnc-LFAR1的表達。6.Lnc-LFAR1通過促進Smad2/3的磷酸化以及轉(zhuǎn)錄,激活TGFβ-Smad2/3信號通路。7.Lnc-LFAR1通過促進Notch2、Notch3和Hes1的轉(zhuǎn)錄,從而激活Notch信號通路。8.細(xì)胞漿內(nèi)的lnc-LFAR1通過促進TGFβR1與Smad2/3的結(jié)合,從而促進Smad2/3的磷酸化。9.細(xì)胞核內(nèi)的lnc-LFAR1與轉(zhuǎn)錄因子Smad2/3結(jié)合,促進TGFβ-Smad2/3信號通路和Notch信號通路組分的基因轉(zhuǎn)錄,從而激活TGFβ和Notch信號通路。結(jié)論綜上所述,我們發(fā)現(xiàn)了一個肝特異性表達的lnc RNA分子lnc-LFAR1。通過體內(nèi)外實驗證明lnc-LFAR1通過促進HSCs的激活和HCs的凋亡,從而促進肝纖維化的發(fā)生。機制上,細(xì)胞漿內(nèi)的lnc-LFAR1通過促進TGFβR1與Smad2/3的結(jié)合,從而促進Smad2/3的磷酸化。而細(xì)胞核內(nèi)的lnc-LFAR1與Smad2/3結(jié)合后促進Smad2/3結(jié)合于α-SMA,Col1α1,MMP2,TGF-β,Smad2,Smad3,Notch2和Notch3的啟動子區(qū)域,從而促進這些靶基因的轉(zhuǎn)錄,激活TGFβ和Notch信號通路。通過深入探討lnc-LFAR1在肝纖維化發(fā)生及發(fā)展過程中的重要作用,豐富了lnc RNAs的分子作用機制;同時也完善了lnc RNAs的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為肝纖維化的診斷和治療提供新靶點。
[Abstract]:In recent years , it has been found that long noncoding RNA ( lnc RNA ) plays an important role in the pathogenesis of liver fibrosis . In this study , the expression of lnc - LFAR1 in liver fibrosis was significantly increased by using the technique of RNA interference and Western blot . The expression of lnc - LF1 mRNA in liver fibrosis mice was significantly increased by using the technique of RNA interference and Western blot . MMP2 , TGF - 尾 , Smad2 , Smad3 , Notch2 and Notch3 promote the transcription and activation of TGF - 尾 and Notch signaling pathways .

【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R575.2

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