研究目的:該研究在同領域者研究的基礎上,目的在于:1.發(fā)現肌層浸潤性膀胱癌患者不同臨床病理特征與KRT6B表達水平的關系。2.評估腫瘤組織和癌旁正常組織中KRT6B表達的關系。3.探討KRT6B表達與肌層浸潤性膀胱癌患者預后的關系。4.尋找KRT6B在膀胱癌腫瘤細胞上表達的位置。希望通過該研究能夠找到跟膀胱癌有關的新的標記物,以利于膀胱癌的診斷,以利于后期評估患者預后。給治療新靶點的發(fā)現提供新的方向和思路。研究方法:膀胱癌患者腫瘤組織及癌旁正常組織的所有基因mRNA表達的原始數據來源于TCGA公共數據庫。我們從中獲得所需要的KRT6B mRNA原始表達數據。從Firehose上獲取膀胱癌患者的所有臨床資料信息。利用R軟件和edgeR包標準化KRT6B mRNA表達譜原始數據。然后將數據與臨床進行資料整合。經過排除,最終選定403例肌層浸潤性膀胱癌病例和19例癌旁正常組織。定義KRT6B mRNA表達量≥中位數(35.80)為高表達。KRT6B mRNA表達量35.80為低表達。評定各臨床病理特征與KRT6B mRNA表達水平的關系采用卡方檢驗。腫瘤組織與癌旁正常組織KRT6B mRNA表達量的關系用非參數檢驗。分析膀胱癌的預后采用Cox回歸分析。采用Kaplan-Meier法繪制相關生存曲線。當P0.05時才認為具有統(tǒng)計學意義。為了觀察KRT6B蛋白在膀胱癌的表達位置,我們采用免疫組化染色方法。研究結果:1.KRT6B mRNA在患者不同性別之間(P0.05)、不同膚色之間(P0.05)、不同病理分級之間(P0.05)、不同亞型之間(P0.05)以及淋巴結轉移與否(P0.05)中差異均存在統(tǒng)計學意義。KRT6B mRNA在不同年齡、腫瘤浸潤深度、淋巴管血管的侵犯情況、復發(fā)情況之間的差異均無統(tǒng)計學意義(均P值0.05)。2.KRT6B mRNA在肌層浸潤性膀胱癌腫瘤組織和癌旁正常組織中的表達存在顯著性差異(P0.05)。MIBC腫瘤組織中KRT6B mRNA的表達量較癌旁正常組織高。3.經COX單因素、多因素分析結果顯示:MIBC患者的KRT6B mRNA的表達水平、年齡、復發(fā)情況、淋巴結轉移情況和腫瘤的浸潤深度都是影響MIBC患者總生存期的獨立危險因素(P均0.05),MIBC組織學亞型與其預后也相關。然而MIBC的膚色、性別、脈管侵犯情況同MIBC患者預后的關系統(tǒng)計結果無明顯統(tǒng)計學意義(P0.05)。4.免疫組化結果顯示KRT6B蛋白在膀胱癌腫瘤細胞的胞膜和胞漿均可表達。結論1.KRT6B可能參與了MIBC的發(fā)生和進展。2.KRT6B的表達水平影響MIBC患者的預后。3.KRT6B蛋白在膀胱癌腫瘤組織中有表達,且細胞漿或細胞膜上表達。
【學位單位】：天津醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2019
【中圖分類】：R737.14
【部分圖文】：

膀胱癌的表達及預后意義1.1 對象和方法1.1.1 研究對象1.1.1.1 KRT6B mRNA 表達數據及臨床資料的來源本研究的所有數據均來源于 TCGA 公共數據庫。進入 TCGA 官網（https://cancergenome.nih.gov/），登陸 GDC 數據門戶。在“Repository”界面下設定檢索條件，如圖 1.1。其一、Cases 條件界面中 Primary Site 選定 Bladder；Program選定 TCGA；其它條件為系統(tǒng)默認選項。其二 Files 條件界面選項中選定Transcriptome Profiling，Gene Expression Quantification 和 HTSeq – Counts；Files中的其它條件為系統(tǒng)默認選項。最終從中共獲取 433 個膀胱癌患者樣本原始基因表達譜數據，其中包括 414 例膀胱癌腫瘤組織和 19 例癌旁正常膀胱組織的原始 mRNA 表達數據。

圖1.2 FIREHOSE登陸界面1.1.1.2 入組標準納入標準：①包含KRT6B mRNA原始表達數據的膀胱癌病例；②有基本資料和臨床病理信息的病例；③被明確診斷為MIBC的病例；④已經死亡的病例且有明確死亡時間的病例；⑤膀胱癌癌旁正常組織病例。排除標準：①排除無臨床基本資料和病理信息的病例；②排除被明確診斷為NMIBC的病例；③排除已死亡的卻沒有明確死亡時間的病例；④排除重復檢測的病例。由于TCGA數據庫中膀胱癌患者臨床資料信息的收錄存在不同程度的缺失，我們將各組內沒有相關臨床資料信息的病例予以剔除。所以最終納入各臨床特征下的病例總數不均相等。

T2、T3、T4期MIBC患者K-M生存曲線（P＜0.05）
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本文編號：2845054