【摘要】：為獲得版納微型豬近交系(Banna Mini-pig inbred line,BMI)TSATG7基因序列并分析組織表達(dá)情況,本研究以GenBank中豬及近緣物種的TSARG7基因mRNA序列為參考序列,設(shè)計(jì)特異引物擴(kuò)增BMI TSARG7基因,半定量分析10個(gè)重要組織的表達(dá)譜,并對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行功能生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示,獲得了BMI TSARG7基因1 371bp的編碼區(qū)序列(GenBank登錄號(hào):KU950831,對(duì)應(yīng)的氨基酸登錄號(hào):AMY60405),編碼456個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為52.05ku,等電點(diǎn)(pI)為9.28。多組織表達(dá)分析表明,TSARG7基因在睪丸中高表達(dá),在其他組織中呈中、低表達(dá)。功能生物信息學(xué)分析表明,TSARG7蛋白質(zhì)存在1個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,有3個(gè)跨膜螺旋結(jié)構(gòu),無信號(hào)肽序列;N末端疏水,C末端親水;有5類功能活性位點(diǎn),位于細(xì)胞質(zhì)的概率是94.1%。本試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究TSARG7基因在豬精子發(fā)生和性成熟方面的作用及功能奠定基礎(chǔ)。
【圖文】：

８４８１０）、猴子（登錄號(hào)：ＸＰ＿０１２６３２８７４）、黑猩猩（登錄號(hào)：ＸＰ＿００１１３８８８８）、人（登錄號(hào)：ＮＰ＿８４８９３４）、小鼠（登錄號(hào)：ＮＰ＿０６１２１３）、大鼠（登錄號(hào)：ＮＰ＿００１０４１３１４）６個(gè)物種的蛋白質(zhì)序列進(jìn)行比對(duì)，并構(gòu)建多物種系統(tǒng)進(jìn)化樹。２結(jié)果２．１ＴＳＡＲＧ７基因ＰＣＲ擴(kuò)增結(jié)果以睪丸ｃＤＮＡ為模板進(jìn)行ＰＣＲ擴(kuò)增，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，擴(kuò)增產(chǎn)物長度為１７９６ｂｐ，與預(yù)期片段大小相一致（圖１）。圖１ＴＳＡＲＧ７基因ＰＣＲ擴(kuò)增結(jié)果Ｆｉｇ．１ＴｈｅＰＣＲａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎｒｅｓｕｌｔｏｆＴＳＡＲＧ７ｇｅｎｅ２．２ＴＳＡＲＧ７基因序列及其編碼的氨基酸序列測(cè)序結(jié)果發(fā)現(xiàn)，ＢＭＩＴＳＡＲＧ７基因全長編碼序列１３７１ｂｐ，該序列已提交ＧｅｎＢａｎｋ，ｍＲＮＡ登錄號(hào)為ＫＵ９５０８３１，其對(duì)應(yīng)的氨基酸登錄號(hào)為ＡＭＹ６０４０５。編碼４５６個(gè)氨基酸，含有１個(gè)保守結(jié)構(gòu)域ＬＰＬＡＴ＿ＬＰＣＡＴ１－ｌｉｋｅ（圖２）。１６３９

中國畜牧獸醫(yī)４４卷ＡＴＧ，起始密碼子；＊，終止密碼子；下劃線序列，蛋白質(zhì)保守結(jié)構(gòu)域（ＬＰＬＡＴ＿ＬＰＣＡＴ１－ｌｉｋｅ，２１８－４２７位氨基酸）ＡＴＧ，Ｓｔａｒｔｃｏｄｏｎ；＊，Ｓｔｏｐｃｏｄｏｎ；Ｕｎｄｅｒｌｉｎｅｓｓｅｑｕｅｎｃｅｓ，Ｃｏｎｓｅｒｖｅｄｄｏｍａｉｎｓ（ＬＰＬＡＴ＿ＬＰＣＡＴ１－ｌｉｋｅ，２１８－４２７ａｍｉｎｏａｃｉｄｓ）圖２ＴＳＡＲＧ７基因編碼區(qū)全長序列與翻譯的氨基酸序列Ｆｉｇ．２ＴｈｅｆｕｌｌｌｅｎｇｔｈｃｏｄｉｎｇａｎｄａｍｉｎｏａｃｉｄｓｅｑｕｅｎｃｅｓｏｆＴＳＡＲＧ７ｇｅｎｅ２．３多組織半定量表達(dá)分析以１８ＳｒＲＮＡ為內(nèi)參基因，利用ＲＴ－ＰＣＲ方法檢測(cè)ＴＳＡＲＧ７基因在ＢＭＩ（０８４７）共１０種組織中的轉(zhuǎn)錄水平，結(jié)果表明，ＴＳＡＲＧ７基因ｍＲＮＡ在睪丸中高度表達(dá)，在大腦、心臟、肝臟、脾臟、腎臟、胃和附睪中中度表達(dá)，在肺臟和小腸中低度表達(dá)（圖３）。１，大腦；２，心臟；３，肝臟；４，，脾臟；５，肺臟；６，腎臟；７，胃；８，小腸；９，附睪；１０，睪丸１，Ｃｅｒｅｂｒｕｍ；２，Ｈｅａｒｔ；３，Ｌｉｖｅｒ；４，Ｓｐｌｅｅｎ；５，Ｌｕｎｇ；６，Ｋｉｄｎｅｙ；７，Ｓｔｏｍａｃｈ；８，Ｓｍａｌｌｉｎｔｅｓｔｉｎｅ；９，Ｅｐｉｄｉｄｙｍｉｓ；１０，Ｔｅｓｔｉｓ圖３ＴＳＡＲＧ７基因半定量多組織表達(dá)譜Ｆｉｇ．３Ｔｈｅｓｅｍｉ－ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｍｕｌｔｉ－ｔｉｓｓｕｅｓｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆ
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)云南省版納微型豬近交系重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)科專業(yè)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31660637、31460580、31660650)
【分類號(hào)】：S828

【參考文獻(xiàn)】

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1 陳園園;潘偉榮;霍金龍;王淑燕;王配;查星琴;曾養(yǎng)志;;版納微型豬近交系不育和可育公豬CRISP2基因全長編碼區(qū)序列克隆及睪丸差異表達(dá)分析[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué));2015年05期

2 王配;陳園園;霍金龍;霍海龍;王淑燕;潘偉榮;成文敏;查星琴;曾養(yǎng)志;;版納微型豬近交系白細(xì)胞介素6基因克隆、生物信息學(xué)及組織表達(dá)分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2015年08期

3 王淑燕;霍金龍;潘偉榮;施晨;曾養(yǎng)志;;版納微型豬近交系GHR基因克隆及生物信息學(xué)分析[J];中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào);2014年01期

4 張俊芳;朱化彬;張留光;郝海生;趙學(xué)明;秦彤;路永強(qiáng);王棟;;精子形成期基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的研究進(jìn)展[J];遺傳;2013年05期

5 ;Cloning and Characterization of Porcine TSARG7 Gene and Analysis of Its Tissue-Specific Expression[J];Agricultural Sciences in China;2009年11期

6 譚小軍;黃志平;李

本文編號(hào)：2519231