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莆田黑豬DNA甲基化差異研究

發(fā)布時(shí)間:2018-03-13 09:40

  本文選題:DNA甲基化 切入點(diǎn):莆田黑豬 出處:《福建農(nóng)林大學(xué)》2016年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:本研究采用MSAP技術(shù)檢測(cè)莆田黑豬不同生長(zhǎng)發(fā)育階段不同組織基因組甲基化模式,并應(yīng)用BSP技術(shù)分析莆田黑豬、杜洛克豬及其與莆田黑豬雜種杜莆豬的不同組織H-FABP基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài),旨在為地方豬選育和豬脂肪沉積的分子育種研究提供科學(xué)理論依據(jù)。1、采用MSAP技術(shù),選擇16對(duì)引物組合對(duì)莆田黑豬不同生長(zhǎng)發(fā)育階段基因組甲基化模式檢測(cè),主要結(jié)果如下:(1)1日齡甲基化水平,一共擴(kuò)增條帶12324個(gè),其中半甲基化條帶2510個(gè),全甲基化條帶3557個(gè),非甲基化條帶6257個(gè)。半甲基化水平中,肝臟的半甲基化水平分別顯著高于心臟、肌肉、尾(P0.05)。全甲基化水平中,心臟的全甲基化水平顯著高于肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾(P0.05)?偧谆交,心臟的總甲基化水平顯著高于肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾(P0.05);尾的總甲基化水平分別顯著高于肌肉、脂肪和耳(P0.05),分別顯著低于心臟和肝臟(P0.05)。(2)25日齡甲基化水平,一共擴(kuò)增條帶11505個(gè),其中半甲基化條帶1997個(gè),全甲基化條帶3740個(gè),非甲基化條帶5768個(gè)。半甲基化水平中,心臟的半甲基化水平顯著高于肌肉(P0.05);肝臟的半甲基化水平顯著低于脂肪(P0.05);肌肉的半甲基化水平分別顯著低于心臟、脂肪和耳(P0.05)。全甲基化水平中,心臟、肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾之間無顯著差異性。總甲基化水平中,心臟的總甲基化水平顯著高于肌肉(P0.05),顯著低于脂肪和耳(P0.05):肌肉的總甲基化水平分別顯著低于心臟、脂肪、耳和尾(P0.05)。(3)210日齡甲基化水平,一共擴(kuò)增條帶11850個(gè),其中半甲基化條帶2294個(gè),全甲基化條帶2867個(gè),非甲基化條帶6689個(gè)。半甲基化水平中,心臟的半甲基化水平顯著低于脂肪、耳和尾(P0.05);肝臟的半甲基化水平顯著低于脂肪、耳和尾(P0.05):肌肉的半甲基化水平顯著低于脂肪和耳(P0.05)。全甲基化水平中,心臟、肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾之間無顯著差異性?偧谆街,心臟的總甲基化水平顯著低于尾(P0.05);肝臟的總甲基化水平顯著低于脂肪、耳和尾(P0.05);肌肉的總甲基化水平顯著低于脂肪和尾。2、莆田黑豬不同生長(zhǎng)發(fā)育階段心臟、肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾的全甲基化水平都高于半甲基化水平。3、莆田黑豬1日齡、25日齡和210日齡階段平均總甲基化水平分別為50.67%、49.89%、43.55%,其隨著年齡增長(zhǎng)而降低。4、莆田黑豬相同生長(zhǎng)發(fā)育階段不同性別間半甲基化、全甲基化和總甲基化水平無明顯的差異性,相同性別內(nèi)半甲基化水平都要低于全甲基化,不同生長(zhǎng)發(fā)育階段公豬的總甲基化水平都略高于母豬。5、通過BSP法分析得出,莆田黑豬、杜洛克豬和杜莆豬心臟、肌肉和耳的H-FABP基因啟動(dòng)子甲基化在210日齡階段均展現(xiàn)出較低甲基化水平。6、不同豬種中,心臟、肌肉和耳的H-FABP基因啟動(dòng)子甲基化水平均無顯著差異性,相同組織在不同豬種中H-FABP基因啟動(dòng)子甲基化水平差異也不顯著。7、莆田黑豬、杜洛克豬和杜莆豬心臟、肌肉和耳H-FABP基因啟動(dòng)子區(qū)的CpG位點(diǎn)甲基化狀態(tài)分析得出,每種組織都檢測(cè)出35個(gè)CpG位點(diǎn),3種豬3種組織均有3個(gè)高度甲基化水平的CpG位點(diǎn),且它們有相同的序列位置。
[Abstract]:This study uses MSAP technique to detect Putian black pigs at different growth stages of different DNA methylation patterns, and analysis of the application of BSP technology in Putian black pigs, Duroc pig H-FABP gene in different tissues and Putian black pig pig hybrid Du Pu promoter methylation status of.1 in order to provide a basis for scientific theory for molecular breeding of pig breeding and the fat deposition of pigs, using MSAP technology, 16 primer combinations of Putian black pigs in different growth patterns of the genomic methylation detection stage, the main results are as follows: (1) 1 day old methylation level, a total of 12324 amplified bands, of which half methylation band 2510, full methylation bands 3557, non methylated bands 6257. Half methylation level, semi methylation level of liver were significantly higher than that of the heart, muscle, tail (P0.05). The methylation level, total methylation level was significantly higher in heart 浜庤倽鑴,

本文編號(hào):1605823

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