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MEK1/2全長結(jié)構(gòu)及磷酸化激活的分子機(jī)理的計(jì)算結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究

發(fā)布時間:2024-06-11 22:16
  多種信號經(jīng)由相同或類似信號分子傳遞,導(dǎo)致不同生物學(xué)效應(yīng),是一種廣泛存在的細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)現(xiàn)象,有關(guān)其中共同通路部分如何對不同信號進(jìn)行分揀和傳遞,其詳細(xì)的分子構(gòu)象過程和機(jī)理目前并不完全清楚。 ERK/MAPK信號通路就是這樣一條重要的細(xì)胞內(nèi)共同通路。與胞外信號分子結(jié)合后,多種細(xì)胞表面受體都可引發(fā)MEK和ERK的依次磷酸化激活,磷酸化激活的ERK可再與上百種下游蛋白底物(如轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子)相互作用,從而調(diào)節(jié)多種基因的表達(dá)并引起相應(yīng)的細(xì)胞變化。研究表明,不同信號經(jīng)ERK/MAPK信號通路傳遞后可產(chǎn)生不同甚至相反的細(xì)胞生物學(xué)效應(yīng)。值得注意的是,MEK作為該通路中的一個關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)分子,只包括兩個蛋白分子(MEK1和MEK2),而且其蛋白序列具有很高的相似性,卻可以分別傳遞如此眾多的不同信號,勢必與其細(xì)微的構(gòu)象變化密切相關(guān),但具體機(jī)理目前并不清楚。因此,研究MEK蛋白分子在各種功能狀態(tài)下的三維結(jié)構(gòu)動態(tài)性,將為解釋此類共同通路的信號分揀傳遞原理提供非常好的范例。 經(jīng)過多年努力,目前已獲得MEK分子的多個三維結(jié)構(gòu),但無一例外,它們都缺失三部分的構(gòu)象信息,即N端區(qū)、PR區(qū)和C端區(qū);分析認(rèn)為這三個部分都具有相當(dāng)?shù)?..

【文章頁數(shù)】:113 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.MAPK信號通路示意圖

圖1.MAPK信號通路示意圖

軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩士學(xué)位論文前言receptor)、PDGFR(platelet-derivedgrowthfactorreceptor)和TRK(tyrosinekinasereceptor)A,B等;罨腞AF可將MEK的兩個特定絲氨酸磷酸化,使MEK....


圖31S9件為

圖31S9件為

軍事圖2*號插入有明序列這種ERK事醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩2.MEK1和表示相同氨入的空格。MEK1和明顯構(gòu)象差列比對顯示種序列差異K/MAPK通碩士學(xué)位論文MEK2的序氨基酸,:表序列比對軟MEK2具有差異(圖3)。示,MEK1和異與其功能通路在MEK序列比對圖表示保....


圖1.1,利用SOPMA服務(wù)器[35]對MEK1和MEK2進(jìn)行二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的結(jié)果

圖1.1,利用SOPMA服務(wù)器[35]對MEK1和MEK2進(jìn)行二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的結(jié)果

軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一部分MEK分子完整三維結(jié)構(gòu)的構(gòu)建致,因此在該區(qū)域很可能會形成一個長螺旋。因此我們選擇對MEKN端缺失部分進(jìn)行單獨(dú)手動構(gòu)建多肽并進(jìn)行分子動力學(xué)模擬,通過對其模擬軌跡的分析研究它的從頭折疊過程,從而獲得合適的構(gòu)象后進(jìn)行MEK完整三維結(jié)構(gòu)的....


圖1.2,M64和M68初始結(jié)構(gòu)圖

圖1.2,M64和M68初始結(jié)構(gòu)圖

覆蓋二級結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示的螺旋區(qū)域(MEK1中的Ala26-Glu62,MEK2中的Ser30-Glu66),這樣選擇的好處是可以獲得一個完整的螺旋,有下一步進(jìn)行結(jié)構(gòu)構(gòu)建;四,MEK1和MEK2選擇的序列必須要符合比對的結(jié)果,便于進(jìn)一步MEK1和MEK2的N端....



本文編號:3992797

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