復(fù)合應(yīng)激性ED大鼠及伊木薩克片干預(yù)后陰莖組織差異表達蛋白的生物信息學(xué)分析
【部分圖文】:
結(jié)果顯示,ED組差異表達的蛋白質(zhì),經(jīng)IPA疾病標志物分析模塊分析,其中T-激肽原1(MAP1)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)、膠原α-1(Ⅲ)鏈(COL3α1)、膠原α-1(Ⅰ)鏈(COL1α1)、膠原α-2(Ⅰ)鏈(COL1α2)、雙鏈蛋白聚糖(BGN)以及肌球蛋白-11(MYH11)屬于復(fù)合應(yīng)激ED大鼠陰莖組織中與ED相關(guān)的蛋白標志物(表3)。經(jīng)伊木薩克片藥物干預(yù)后,差異表達的蛋白質(zhì)經(jīng)IPA疾病標志物分析模塊分析, MAP1、GAPDH、BGN和MYH11屬于伊木薩克片藥物干預(yù)大鼠模型陰莖組織中與ED相關(guān)的蛋白標志物(表4)。2.2.4.2 生物標志物的相互作用網(wǎng)絡(luò)
對通過IPA疾病庫中獲得的ED大鼠模型組的差異蛋白中與ED相關(guān)7種蛋白構(gòu)建了相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,結(jié)果顯示,上述7種蛋白質(zhì)存在直接或間接的相互作用關(guān)系。其中IL-6和 TGF-β直接或間接的影響了上述蛋白的表達(圖4A);對伊木薩克組與ED相關(guān)的4種蛋白構(gòu)建了相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,結(jié)果顯示上述4種蛋白質(zhì)存在直接或間接的相互作用關(guān)系,其中IL-6和P38MAPK直接或間接的影響了上述蛋白的表達(圖4B)。網(wǎng)絡(luò)中的紅色點為實驗數(shù)據(jù)中的上調(diào)差異蛋白,綠色點為實驗數(shù)據(jù)中的下調(diào)表達蛋白,實線表示直接信號通路,虛線表示間接信號通路(圖4)。圖3 大鼠陰莖組織差異表達蛋白質(zhì)典型通路分布
表4 伊木薩克組大鼠陰莖組織中ED生物標志物的IPA篩選分析Table 4. Results of ingenuity pathway analysis on the ED biomarkers in the penile tissue of the ED rats model after intervention with Yimusake Tablets Gene bank Official symbol Protein name Mr PI Unique pebtide Up/down regulation P01048 MAP1 T-kininogen 1 47 700 6.52 6.00 Down P04797 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphatedehydrogenase 35 800 8.03 14.00 Down P47853 BGN Biglycan 41 700 14.00 7.52 Up Q63862 MYH11 Myosin-11 152 400 49.00 6.18 Up3 討論
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