背景胸腺上皮腫瘤（thymic epithelial tumors,TETs）是一種發(fā)源于胸腺上皮細胞的腫瘤,其發(fā)病率較低,大概為0.13/10萬。根據(jù)2015年版世界衛(wèi)生組織（World Health Organization,WHO）分型,胸腺上皮腫瘤被分為胸腺瘤（A、AB、B1、B2、B3型）和胸腺癌（C型）。目前胸腺上皮腫瘤的復發(fā)和生存預后判斷主要依靠WHO分型和Masaoka分期。WHO分型中A、AB、B1、B2和B3型胸腺上皮腫瘤被認為惡性程度較低,較少復發(fā),生存預后好,而C型胸腺上皮腫瘤被認為惡性程度高,易復發(fā),生存預后差。Masaoka分期中,Ⅰ-Ⅱ期被認為復發(fā)風險低,生存預后好,而Ⅲ-Ⅳ期復發(fā)風險高,生存預后差。然而在實際臨床運用中,依靠WHO分型和Masaoka分期來判斷胸腺上皮腫瘤病人的復發(fā)和生存預后有一些局限性,例如惡性程度較低的A、AB、B1型胸腺瘤也會出現(xiàn)術后復發(fā)、早期轉移等情況,影響患者的預后。因此尋找更加精準的生物標記物用于判定胸腺上皮腫瘤的預后具有重要的臨床意義。DNA甲基化是基因表觀遺傳調控的重要方式,主要通過基因啟動子區(qū)域的高甲基化沉默基因表達,從而...

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【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖1.1癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫

陸軍軍醫(yī)大學博士學位論文域。美國國家癌癥研究所和國家人類基因組研究所于2005年建立癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫（TheCancerGenomeAtlas，TCGA)，它的網(wǎng)絡數(shù)據(jù)下載地址是：http://cancergenome.nih.go....

圖1.2基因表達綜合數(shù)據(jù)庫

陸軍軍醫(yī)大學博士學位論文據(jù)庫包含了4868個數(shù)據(jù)集，累計達到了2045092個樣本，是世界上最大的也是最著名的芯片數(shù)據(jù)存貯和查詢的全世界公益性數(shù)據(jù)庫(圖1.2所示)。GEO數(shù)據(jù)庫建立的目的主要是：通過收錄大量的高通量測序實驗數(shù)據(jù)，為后期同行科學家數(shù)據(jù)挖掘和信息的推廣....

圖1.3UCSC數(shù)據(jù)庫

圖1.3UCSC數(shù)據(jù)庫2.1.2實驗方法2.1.2.1胸腺上皮腫瘤臨床資料、DNA甲基化測序和轉錄組測序資料下載本研究訪問TCGA數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站、UCSC數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站和GEO數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站下載胸腺上皮腫瘤病人臨床資料、隨訪信息、全基因組DNA甲基化測序數(shù)據(jù)和全基因....

圖1.4TCGA數(shù)據(jù)庫中DNA甲基化測序資料

化DNA甲基化位點作為初始協(xié)變量，采用逐步邏輯回歸分析法分析胸腺上皮腫瘤總生存期和無復發(fā)生存期的獨立預測因子。根據(jù)以下標準，通過似然比試驗選擇變量：選擇一個變量（p<0.05），而在反向刪除步驟中排除p值大于0.1的變量[60]。采用ROC分析評價DNA甲基化預....

本文編號：4049554