金魚和鯽PTX3基因的克
發(fā)布時間:2020-11-21 05:52
金魚是由我國野生鯽演變而來的一類觀賞魚類,頭瘤類金魚是其眾多品系中重要的一類。頭瘤類金魚的觀賞價值和經(jīng)濟價值受頭瘤形狀、大小和顏色等的影響,然而其頭瘤的產生機制尚不清楚。目前的研究普遍認為頭瘤是組織的異常增生。最近的研究發(fā)現(xiàn),隨著頭瘤的發(fā)生,PTX3(Pentraxin 3)基因的表達水平上調,證明PTX3在金魚頭瘤發(fā)生過程中可能發(fā)揮著重要作用;而PTX3在哺乳動物中發(fā)揮著類抗體、結合特定病原菌、激活并調控補體等免疫相關作用。因此我們推測,在頭瘤的異常增生過程中,PTX3可能作為免疫相關因子對其發(fā)揮持續(xù)免疫的作用。為驗證這一推論,我們對魚類中的PTX3開展了相關研究。主要研究結論如下:1.PTX3在基因結構和蛋白結構上具有保守性。金魚和異育銀鯽PTX3基因均由3個外顯子和2個內含子構成。金魚的兩個內含子分別長945bp,1519bp;異育銀鯽的兩個內含子分別長970bp,1513bp。金魚和異育銀鯽PTX3基因c DNA序列全長分別為1918bp,1560bp,均包含了一個1362bp的開放閱讀框,編碼453aa的蛋白質。預測的PTX3蛋白由信號肽(1-22aa)、氨基端(23-240aa)和PTX結構域(241-453aa)三部分構成,在PTX結構域有一非典型的Pentraxin信號(HICAVWSS)。兩種魚類編碼的PTX3氨基酸序列高度同源,僅有兩個氨基酸不同。2.PTX3在異育銀鯽各組織中均有表達,在腦和肌肉中的表達量最高。在嗜水氣單胞菌感染后,PTX3在肝臟、脾臟、頭腎、腸和血液等魚體的主要免疫器官和組織中均出現(xiàn)顯著的表達上調。這一結果表明PTX3與魚類免疫相關。3.PTX3體外功能實驗證明,PTX3不具有細菌抑制活性,但具有細菌結合活性,這一結合在PTX3氨基端區(qū)域和PTX結構域均可發(fā)生。
【學位單位】:華中農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2015
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:
金魚和異育銀鯽PTX3蛋白結構示意圖
22圖 2 金魚 PTX3 基因全長起始密碼子用方框標出;外顯子序列用大寫字母表示,下面顯示氨基酸序列;內含子/外顯子連接處的 gt/tg 用黑體表示;信號肽用下劃線標出。Fig.2 The full nucleotide sequence of PTX3 in goldfishInitiation codon is surrounded by box;exon sequences are indicated in upper case letters and thededuced amino acid sequence is shown below the nucleotide sequence. The gt/ag intron/exonboundaries are highlighted in boldface.The putative signal peptide is underlined.
23圖 3 異育銀鯽 PTX3 基因全長起始密碼子用方框標出;外顯子序列用大寫字母表示,下面顯示氨基酸序列;內含子/外顯子連接處的 gt/tg 用黑體表示;信號肽用下劃線標出。Fig.3 The full nucleotide sequence of PTX3 in gibel carpInitiation codon is surrounded by box; exon sequences are indicated in upper case letters and thededuced amino acid sequence is shown below the nucleotide sequence. The gt/ag intron/exonboundaries are highlighted in boldface.The putative signal peptide is underlined.
【參考文獻】
本文編號:2892627
【學位單位】:華中農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2015
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:
金魚和異育銀鯽PTX3蛋白結構示意圖
22圖 2 金魚 PTX3 基因全長起始密碼子用方框標出;外顯子序列用大寫字母表示,下面顯示氨基酸序列;內含子/外顯子連接處的 gt/tg 用黑體表示;信號肽用下劃線標出。Fig.2 The full nucleotide sequence of PTX3 in goldfishInitiation codon is surrounded by box;exon sequences are indicated in upper case letters and thededuced amino acid sequence is shown below the nucleotide sequence. The gt/ag intron/exonboundaries are highlighted in boldface.The putative signal peptide is underlined.
23圖 3 異育銀鯽 PTX3 基因全長起始密碼子用方框標出;外顯子序列用大寫字母表示,下面顯示氨基酸序列;內含子/外顯子連接處的 gt/tg 用黑體表示;信號肽用下劃線標出。Fig.3 The full nucleotide sequence of PTX3 in gibel carpInitiation codon is surrounded by box; exon sequences are indicated in upper case letters and thededuced amino acid sequence is shown below the nucleotide sequence. The gt/ag intron/exonboundaries are highlighted in boldface.The putative signal peptide is underlined.
【參考文獻】
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1 潘泓宇;頭瘤類金魚雜交子一代性狀分析及頭瘤的早期發(fā)育[D];上海海洋大學;2012年
本文編號:2892627
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