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桃GH3基因家族的生物信息學(xué)分析及其在果實(shí)發(fā)育中的表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2020-10-26 05:47
   為了探索生長素酰胺合成酶(GH3)基因家族在桃(Prunus persica L.Batsch)果實(shí)生長發(fā)育過程中的作用,對(duì)桃基因組中的GH3基因家族進(jìn)行生物信息學(xué)分析,對(duì)它們?cè)谌苜|(zhì)型和硬質(zhì)型油桃果實(shí)發(fā)育成熟階段的表達(dá)水平進(jìn)行q RT-PCR檢測(cè)。檢測(cè)結(jié)果表明:桃GH3基因家族有8個(gè)成員,分別為Pp GH3-1~Pp GH3-8,聚類分析表明其分為GroupⅠ和GroupⅡ兩類。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明GroupⅡ型基因(Pp GH3-1、Pp GH3-2、Pp GH3-3、Pp GH3-4和Pp GH3-5)在溶質(zhì)型油桃中的表達(dá)水平高于硬質(zhì)型油桃,其中Pp GH3-3和Pp GH3-4最為明顯。經(jīng)NAA處理后的硬質(zhì)型油桃果實(shí)Pp GH3-1、Pp GH3-3、Pp GH3-4和Pp GH3-7相比對(duì)照上調(diào)表達(dá),其中Pp GH3-3上調(diào)表達(dá)最為明顯。試驗(yàn)結(jié)果表明生長素在桃果實(shí)成熟軟化過程扮演著重要的角色。
【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料及其處理
    1.2 桃GH3家族成員的克隆
    1.3 桃GH3家族成員的序列分析和進(jìn)化樹的構(gòu)建
    1.4 熒光PCR檢測(cè)
2 結(jié)果與分析
    2.1 桃GH3基因家族的全基因組分析
    2.2 桃Pp GH3蛋白家族相似性和進(jìn)化樹分析
    2.3 Pp GH3在溶質(zhì)型和硬質(zhì)型油桃果實(shí)生長發(fā)育過程中的表達(dá)
    2.4 外源萘乙酸處理硬質(zhì)型油桃后Pp GH3的表達(dá)分析
3 討論

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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