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人工飼養(yǎng)黑鸛種群分子遺傳學(xué)分析及管理對策研究

發(fā)布時間:2024-03-15 05:44
  黑鸛(Ciconia nigra)是一種分布廣泛、體態(tài)優(yōu)美的大型遷徙性涉禽,我國僅有1000只左右,是重要的瀕危物種。目前我國動物園中已經(jīng)建立了穩(wěn)定的人工飼養(yǎng)種群,成為這一個物種的活體基因庫。為了更好的對人工飼養(yǎng)的黑鸛種群進行管理,本文從線粒體D-Loop區(qū)和微衛(wèi)星兩個方面對黑鸛種群的遺傳多樣性進行探究。黑鸛雌雄同型,形態(tài)學(xué)難以進行性別的區(qū)分,利用分子手段對黑鸛的性別進行鑒定。分別取用CHD基因的 1對引物CHD-1F/CHD-1R和EE0.6的2對引物AWS05/NRD4和SINT-F/SINT-R來鑒定,兩組引物的鑒定結(jié)果相同,鑒定結(jié)果顯示該種群的性別比例為1:1。在對黑鸛種群的D-Loop區(qū)進行擴增時,發(fā)現(xiàn)該種群存在核拷貝現(xiàn)象,拷貝的片段長度在3400-4200bp之間,這種插入屬于中性突變,無不良影響。對D-Loop區(qū)的序列進行分析,共得到10個單倍型,23個多態(tài)性位點,單倍型多樣性(Hd)為0.768,核苷酸多樣性(π)為0.00744,平均核苷酸差異數(shù)(k)為4.504,說明該種群中的個體存在著嚴(yán)重的單倍型分布不均衡的現(xiàn)象。中性檢驗的結(jié)果顯示,該種群存在著不顯著的負(fù)選擇的壓...

【文章頁數(shù)】:71 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1黑鸛地理分布圖(來自世界自然保護聯(lián)盟瀕危物種紅色名錄)??Figure?1-1?Geographical?distribution?of?the?black?stork??(https://www.iucnredlist.Org/species/22697669/l?11747857?)??

圖1-1黑鸛地理分布圖(來自世界自然保護聯(lián)盟瀕危物種紅色名錄)??Figure?1-1?Geographical?distribution?of?the?black?stork??(https://www.iucnredlist.Org/species/22697669/l?11747857?)??

黑鸛種群的分布十分廣泛,亞歐非均有其分布的記載[18]。國外黑鸛在北半球的繁殖??區(qū)域大致在N40° ̄60°的古北界,國內(nèi)主要在東北、華北和新疆等地[U8,27],分布情況如??圖1-1。黑鸛種群大部分集中在歐洲,占全球黑鸛總數(shù)的67%,據(jù)估計東歐有??6600?9700個繁殖對....


圖1一哺乳動物、魚類、兩棲類線粒體D-助叩區(qū)位置

圖1一哺乳動物、魚類、兩棲類線粒體D-助叩區(qū)位置

圖1-3鳥類線粒體D-L〇〇P區(qū)位置??Figure?1-3?The?location?of?D-Loop?on?the?mitochondrial?genome?of?birds??1.3.1線粒體DNA標(biāo)記在鳥類中的應(yīng)用??與核DNA相比,mtDNA的結(jié)構(gòu)簡單、提取容易、進化....


圖3-1部分樣品中提取的總DNA的電泳圖??M:?5K?DNA?Marker;?1 ̄7為7份隨機抽取樣品的總DNA??

圖3-1部分樣品中提取的總DNA的電泳圖??M:?5K?DNA?Marker;?1 ̄7為7份隨機抽取樣品的總DNA??

樣品是陸續(xù)采集的,從采集到開展實驗之間時間跨度最長接近一年,雖然在-20°C??條件下冷凍保存,但也不同程度發(fā)生DNA的降解,保存時間越短的樣品提取的DNA??質(zhì)量越好(圖3-1、表3-1)。因為本研究主要基于PCR技術(shù),所提取得DNA均能滿足??實驗的需求。??■■■■??圖3....


圖3-3?EE0.6基因PCR擴增產(chǎn)物電泳圖及性別鑒定結(jié)果???

圖3-3?EE0.6基因PCR擴增產(chǎn)物電泳圖及性別鑒定結(jié)果???

易出現(xiàn)錯誤,將未出現(xiàn)條帶的個體均判別為雄性,因此另外加入一對Z染色體上的引物??SINT-F/SINT-R特異性擴增190bp左右的條帶作為陽性控制,即雄性僅有一個190bp的??條帶,而雌性則會出現(xiàn)190bp和380bp兩條條帶(圖3-2和圖3-3)。??實驗結(jié)果顯示,兩個基因....



本文編號:3928626

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