基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討增液湯改善脂質(zhì)代謝紊亂可能分子作用機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2024-10-03 00:37
目的本研究旨在運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討增液湯改善脂質(zhì)代謝紊亂的可能物質(zhì)基礎(chǔ)及機(jī)制。方法基于BATMAN-TCM并聯(lián)用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)及化學(xué)數(shù)據(jù)庫(Chemistry Database),篩選增液湯中的有效化學(xué)成分,基于BATMAN-TCM、TCMSP、DrugBank和UniProt篩選其有效化學(xué)成分的對應(yīng)靶點(diǎn);DiGSeE和GeneCards、DisGeNET數(shù)據(jù)庫篩選脂質(zhì)代謝紊亂疾病對應(yīng)靶標(biāo),并對增液湯靶點(diǎn)與脂質(zhì)代謝紊亂疾病靶標(biāo)進(jìn)行維恩圖(Venn)分析,并在此基礎(chǔ)上建立"增液湯-中藥-有效化學(xué)成分-共有靶點(diǎn)"網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)模型;利用DAVID及OmicShare數(shù)據(jù)庫對靶標(biāo)進(jìn)行京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集、基因本體論(Gene Ontology,GO)分析并作可視化圖;利用STRING在線工具對共有靶...
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
本文編號:4006548
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圖4生物過程的顯著性氣泡圖
圖3增液湯GO富集分析結(jié)果圖5分子功能的顯著性氣泡圖
圖6細(xì)胞組成的顯著性氣泡圖
圖5分子功能的顯著性氣泡圖2.4共有靶點(diǎn)的KEGG通路富集分析
圖7增液湯KEGG通路富集數(shù)目統(tǒng)計(jì)圖
應(yīng)用DAVID數(shù)據(jù)庫及OmicShare軟件對共有靶點(diǎn)進(jìn)行KEGG生物途徑富集分析,選擇P<0.01作為靶點(diǎn)的篩選標(biāo)。同時(shí)制作目標(biāo)基因EnsemblID,使用Omicshare處理分析,選擇通路(Pathway)為前置條件,篩選符合P≤0.01信號通路進(jìn)行富集分析。將上述最終結(jié)....
圖8增液湯KEGG通路富集分析顯著性氣泡圖
圖7增液湯KEGG通路富集數(shù)目統(tǒng)計(jì)圖2.5共有靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及核心靶點(diǎn)確定
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