基于高通量測(cè)序技術(shù)的潰瘍性結(jié)腸炎及回腸貯袋患者腸道菌群的實(shí)驗(yàn)研究
發(fā)布時(shí)間:2024-05-25 05:17
目的:分析潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)、末端回腸造口及全結(jié)直腸切除、回腸貯袋肛管吻合術(shù)(ileal pouch anal anastomosis,IPAA)術(shù)后回腸貯袋患者腸道菌群結(jié)構(gòu)、豐度及多樣性變化,探討腸道菌群介導(dǎo)的UC及貯袋炎發(fā)生的微生物學(xué)機(jī)制。方法:連續(xù)選取2017年12月~2018年12月期間在天津醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院普通外科、消化內(nèi)科病房及門診,并接受結(jié)腸鏡和組織病理學(xué)檢查且符合條件的UC患者37例、末端回腸造口患者14例及IPAA術(shù)后回腸貯袋患者16例,分別記作UC組、造口組和貯袋組;選擇同時(shí)期性別年齡相匹配的健康人18例作為健康對(duì)照組,收集上述4組大便標(biāo)本至無(wú)菌管中,放置低溫冰箱儲(chǔ)存?zhèn)溆。按照改良Mayo評(píng)分系統(tǒng)將UC組分為緩解期(Aa)、輕度活動(dòng)(Ab)、中度活動(dòng)(Ac)及重度活動(dòng)(Ad)四個(gè)亞組;按照貯袋炎活動(dòng)指數(shù)評(píng)分(PDAI)將貯袋組分為≥7分的貯袋炎組(Pa)和<7分的非貯袋炎組(Pb)兩個(gè)亞組;按照基礎(chǔ)疾病的不同將造口組分為UC術(shù)后造口(Sa)組及非UC術(shù)后造口(Sb)組。隨后對(duì)糞便樣本DNA進(jìn)行抽提質(zhì)檢,PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物提純...
【文章頁(yè)數(shù)】:100 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號(hào):3981758
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1糞便樣本基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳(2)Nan0DroPZo00超微量分光光度計(jì)檢測(cè)表明,1.5OD‘
圖2.2NanoDrop2000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)糞便樣本基因組DNA
圖2.3PCR特異性擴(kuò)增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果
圖2.2NanoDrop2000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)糞便樣本基因組DNAPCR特異性擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)本實(shí)驗(yàn)采用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)經(jīng)PCR特異性擴(kuò)增后的產(chǎn)物質(zhì)量,所得條晰、單一,濃度適中,片段大小在420bp左右,無(wú)明顯雜帶及彌散,表明擴(kuò)增后產(chǎn)物為細(xì)菌16Sr....
圖2.4UC各亞組與HC組OTU分布Venn圖
釋TU對(duì)應(yīng)的物種分類信息,在Silva128數(shù)據(jù)OTUs代表序列進(jìn)行比對(duì)分析,并在門(Phyluily)、屬(Genus)水平注釋其群落的物種信息分析后,可以得知樣本在各分類水平上的分類學(xué)相對(duì)豐度,將結(jié)果繪制成菌群組成分析柱狀平上的菌群組成情況。物種組成別出20個(gè)菌....
本文編號(hào):3981758
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