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HJURP基因多態(tài)性與HBV相關(guān)性肝癌遺傳易感性的關(guān)聯(lián)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-11-20 23:16
   目的:在中國(guó)人群中探討Holliday交叉識(shí)別蛋白(Holliday Junction Recognition Protein,HJURP)基因單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(Single nucleotide polymorphism,SNP)與乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)相關(guān)的肝細(xì)胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)易感性的關(guān)系,進(jìn)一步闡述影響肝癌發(fā)生的生物學(xué)機(jī)制。 方法:本研究采用候選基因的關(guān)聯(lián)研究策略,涉及兩個(gè)病例對(duì)照人群(廣西肝癌病例-對(duì)照人群和江蘇肝癌病例-對(duì)照人群,總共包括448個(gè)病例和462個(gè)對(duì)照)。應(yīng)用酚氯仿法從5 ml EDTA抗凝的外周血中提取DNA。利用GenomeLab SNPstream分型平臺(tái)結(jié)合Taqman基因分型方法對(duì)HJURP基因的24個(gè)標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行基因分型;通過RT-PCR半定量實(shí)驗(yàn)和免疫組化實(shí)驗(yàn)研究關(guān)聯(lián)位點(diǎn)rs3771333基因型與HJURP基因表達(dá)差異的相關(guān)性。利用SNPStats (http://bioinfo.iconcologia.net/snpstats/start.htm)和SPSS (version 13.0, Chicago, Illinois)軟件,對(duì)每個(gè)SNP位點(diǎn)的基因型和單體型進(jìn)行l(wèi)ogistic回歸分析,采用Bonferroni法進(jìn)行多重檢驗(yàn)校正。以比值比(odds ratios, ORs)及其95%可信區(qū)限(confidence intervals, CIs)表示相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度。遺傳易感性分析校正性別、年齡、吸煙、飲酒、家族史等影響因素。比較rs3771333位點(diǎn)基因型與HJURP mRNA表達(dá)量的差異用Mann-Whitney U-檢驗(yàn)。比較癌組織和癌旁組織HJURP表達(dá)水平差異用Wilcox秩和檢驗(yàn);比較rs3771333位點(diǎn)基因型與HJURP蛋白表達(dá)水平的差異用Mann-Whitney U-檢驗(yàn)。 結(jié)果:本研究發(fā)現(xiàn)rs3771333與HBV相關(guān)HCC易感性有顯著性關(guān)聯(lián),相對(duì)于A/A基因型,A/C和C/C基因型是風(fēng)險(xiǎn)基因型。在合并人群中的OR值為1.82 (95%可信區(qū)間, 1.33-2.49; P = 0.00019);攜帶rs3771333位點(diǎn)風(fēng)險(xiǎn)C等位的HJURP表達(dá)量顯著低于A/A基因型攜帶者(P = 0.0078和0.0077,分別為mRNA水平和蛋白水平)。 結(jié)論:本項(xiàng)研究首次揭示了在中國(guó)人群中HJURP基因多態(tài)性與HBV相關(guān)HCC易感性之間具有遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)。對(duì)于HJRUP-rs3771333位點(diǎn),相對(duì)于A/A基因型,A/C和C/C基因型是風(fēng)險(xiǎn)基因型。同時(shí),通過RT-PCR半定量實(shí)驗(yàn)和免疫組化實(shí)驗(yàn)證實(shí)了rs3771333與HJURP基因的mRNA和蛋白表達(dá)水平相關(guān),從而影響HBV相關(guān)HCC的遺傳易感性?傊,我們的研究結(jié)果提示,HJURP基因是中國(guó)人群HBV相關(guān)HCC的易感基因,HJURP基因的SNP位點(diǎn)rs3771333在此易感性中發(fā)揮重要的作用。
【學(xué)位單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2011
【中圖分類】:R512.62;R735.7
【部分圖文】:

質(zhì)控圖,基因型


X/X基因型質(zhì)控圖

質(zhì)控圖,基因型


X/Y基因型質(zhì)控圖

質(zhì)控圖,基因型


Y/Y基因型質(zhì)控圖
【參考文獻(xiàn)】

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